基于网络药理学方法研究两面针抗肿瘤的作用机制

【目的】基于网络药理学构建两面针抗肿瘤的“活性成分-抗肿瘤靶点-抗肿瘤通路”等网络关系,预测其抗肿瘤的作用靶点并对其作用机制进行研究分析。【方法】以口服利用度（OB）及类药性（DL）为限制条件在中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库筛选出两面针主要活性化学成分,在Pharmmapper服务器上筛选和建立两面针靶点数据库。通过OMIM及其他数据库进行抗肿瘤相关基因及蛋白靶点筛选。使用R4.2.1软件做出两面针活性成分、靶点基因和肿瘤。靶点基因相交情况筛选两面针作用靶点。通过Cytoscape 3.6.1软件Merge及Union功能,建立了两面针“有效成分-肿瘤靶点”的可视化交互网络。利用STRING数据库构建抗肿瘤靶点之间的交互网络、PPI网络,利用DAVID数据库对靶蛋白进行KEGG通路注释分析,富集出生物通路,构建出“活性成分-抗肿瘤靶点-抗肿瘤通路”网络。选择其中一个关联度较高的活性化合物作为配体、KEGG富集结果中较为显著的信号通路所涉及靶点作为受体,对活性成分与核心靶蛋白进行分子对接验证。【结果】经筛选和分析获得两面针活性成分21个,抗肿瘤靶点14个,包括EGFR、ESR...     

不同春季气候类型对芒果丰产效应及其开花期适宜气象指标初探与构建

为探究不同春季气候类型对芒果开花期、成花、坐果和产量的影响及其开花期适宜气象指标,以2-4月降雨量少、湿度较低、3月份温度较高的2018年为春季少雨晴暖天气类型,以2-4月降雨量多、湿度较高、3月份温度较低的2019年为春季多雨阴冷天气类型,对比分析两种天气类型开花期的温度、降雨量、湿度及其条件下对芒果开花期、成花、坐果和产量的影响,提出芒果开花期适宜的气象指标及构建方法。结果表明：春季少雨晴暖的2018年较春季多雨阴冷的2019年芒果始花期提早12天,开花期缩短2天;成花率、坐果率和产量分别较2019年高10.2%、86.1%和144.3%;综合开花期、成花率、坐果率和产量等因素,春季少雨晴暖的2018年芒果开花期气象数据为适宜气象指标：平均温度20.9℃、日最低温度≥14.2℃、最高温度≤29.6℃,累积降雨量62.5mm、日降雨量≧9.8mm天数少（2天）且不相邻,平均湿度72.6%、无日湿度≧89.0%的天数。各芒果产区以开花期适宜气象指标中的温度指标为参考,依据历年温度回升趋势确定达到该温度值的时间段,以此作为开花起始时间,后通过花期调控技术使芒果开花期全部或大部时段落入设定的开花期时间段,以避过低温阴雨或因花期过迟引起的高温天气,从而实现丰产稳产。研究结果可为芒果确立适宜开花期和丰产稳产,营造适宜的开花期果园小气候提供科学依据。     

象草全基因组bHLH转录因子家族鉴定及表达分析北大核心CSCD

bHLH转录因子家族不仅参与了植物的生长发育,而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面发挥着关键作用。在全基因组水平对重要饲草及能源植物象草的bHLH转录因子家族进行了鉴定及分析,并利用转录组数据及定量RT-PCR分析了象草bHLH转录因子对赤霉素(GA_(3))和多效唑(PAC)的响应。结果显示:在象草中共鉴定出229个具有完整保守结构域的bHLH基因家族成员(CpbHLH001~CpbHLH229),不均匀地分布于14条染色体上;系统进化分析结果表明,229个CpbHLHs可被分为18个亚类,其中C亚类的成员数量最多,为41个;此外,相同亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序;基于转录组数据的表达谱分析结果发现,多数bHLH基因在象草茎尖组织中均对GA_(3)和PAC有响应。随机挑选9个表达量较高的基因进一步通过qPCR进行验证。结果显示,经外源GA_(3)和PAC处理之后,这9个基因因不同处理而差异表达,表明这9个基因可能与GA_(3)和PAC介导的信号通路有关。综上所述,本研究为象草bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础。