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试验旨在挖掘杏花鸡品种的群体特征性选择印记,筛选杏花鸡特征性基因和核心基因。研究基于已报道的来源于22个群体的157只鸡的全基因组数据,通过窗口内群体间遗传分化系数(ZFst)及群体内杂合度(ZHp),对其中的杏花鸡群体(n=9)进行全基因组选择印记分析,挖掘杏花鸡群体特征性选择印记,对候选基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,蛋白相互作用网络分析和核心基因的筛选。结果显示:通过ZFst与ZHp,分别鉴定到172个杏花鸡群体基因组潜在受选择基因,其中包含29个共同受选择基因,包括COL3A1、LMO3、TBC1D14、COL22A1、EP300、TMTC3、KCNE5、PAICS、SGK1、DERA、GPR20、LHFPL6、PREX1、PIK3C2G、HEPACAM2、KITLG、KIAA0232、SMAD1、RIMKLB、SLIT2、LONRF1、NXT2、LDB2、TSNARE1、ABLIM2、VPS50、TCF12、ACSL4与FOXJ2;两种方法共鉴定到的受选择基因进行GO分析,分别富集到68条、82条和16条通路,主要涉及磷和含磷化合物代谢、细胞分化的调节、连接酶活性...  相似文献   
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