大肠杆菌分子分型方法研究进展

大肠杆菌是一种条件致病性的人畜共患病病原菌,对人和动物健康有着严重的危害.因致病性大肠杆菌造成的动物感染和动物产品污染在动物健康和公共卫生安全上是一个严重的问题.大肠杆菌的分子分型和系统进化分群对于准确、快速地确定大肠杆菌的污染及感染来源,判定不同大肠杆菌致病性之强弱,保障人类和动物健康,改善公共卫生环境具有重大意义....     

大型奶牛养殖环境源大肠埃希菌毒力基因与系统进化分群

对甘肃2个大型奶牛养殖环境的大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)分离株进行系统进化分群和毒力基因分布情况研究,分析系统群与E.coli主要毒力基因之间的潜在关联,以期为E.coli的研究和防治提供参考。利用PCR方法对281株E.coli分离株进行系统进化分群鉴定和毒力基因检测。281株E.coli分离株被分为8个系统进化群,B1、A、E、F、D、C、B2群和隐支Ⅰ或Ⅱ的占比分别为51.96%,28.47%,11.39%,2.85%,1.78%,1.07%,0.71%,0.36%,有4株为未知系统群。毒力基因检测结果显示,ompA、ibeB、ompT、iroN、traT、iucD、fyuA和irp2的阳性率分别为100%,98.58%,76.16%,71.53%,68.33%,64.06%,30.96%,30.25%。不同年份和养殖环境的部分毒力基因的分布存在明显差异,携带8个所鉴定的毒力基因的菌株在B1、B2群和粪土源中的分布较多;traT在2017年的分布明显低于2018和2019年;traT和iroN在粪土源分离株中的分布高于污水源。系统群与毒力基因的关联...     

奶牛养殖场环境大肠杆菌的ERIC-PCR分型和系统进化分群

旨在了解奶牛养殖场环境中大肠杆菌流行情况及遗传多样性，探究不同样品分离菌株的遗传关系及系统进化分群情况，收集2017—2019年新疆某大型奶牛场养殖环境中的209份样品进行大肠杆菌分离和16S rRNA鉴定，对非重复菌株进行ERIC-PCR分型和系统进化分群试验。结果显示，共分离到338株大肠杆菌，分离率为67.46%。ERIC-PCR将其分为Ⅰ~ⅩⅣ共14型。Ⅳ（196株）型为优势型；其次为Ⅰ型（59株）、Ⅴ（31株）、Ⅹ（11株）；剩余41株分布于其他10种型。除2株未分群外，其他被分为6个群，B1群（75.45%）分布最多，其次是A群（18.34%）、C群（2.96%）、D或E群（1.18%）、F群（0.30%）。综上表明，奶牛养殖场环境中大肠杆菌存在广泛的DNA多样性，且不同时间及来源菌株间存在较近的亲缘关系；系统进化分群以B1群为主。     

获得性16S rRNA甲基化酶的研究进展

外源获得性16S rRNA甲基化酶基因广泛分布于革兰阴性细菌中，介导对多种氨基糖苷类药物的高水平耐药。该酶能将S-腺苷-L-甲硫氨酸的甲基添加到16S rRNA氨酰tRNA识别位点的特异性核苷酸上，从而干扰氨基糖苷类药物与靶位点的结合。16S rRNA甲基化酶基因通常由转座子等活动性遗传元件介导并嵌入到可转移的质粒或染色体中，从而导致耐药基因广泛而迅速地传播。更令人担忧的是，16S rRNA甲基化酶基因经常与bla_NDM-1、bla_CTX-M和qnrB1等其他耐药基因偶联，介导对β-内酰胺类药物和氟喹诺酮类药物的多重耐药。对于多重耐药16S rRNA甲基化酶阳性菌引发的感染，治疗方法非常有限。迄今为止，至少已有30个国家和地区对16S rRNA甲基化酶进行了相关报道，由此可见，16S rRNA甲基化酶基因的全球传播正成为一个全球重大公共卫生问题。