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试验旨在以线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)为切入点,研究建昌马的母系遗传多样性与系统进化。从建昌马(n=39)血液中提取基因组DNA,用PCR方法扩增mtDNA D-loop区并直接测序,分析其高变区247 bp序列信息,统计mtDNA D-loop区的单倍型及变异位点,计算单倍型多样性(haplotype diversity,Hd)、核苷酸多样性(nucleotide diversity,Pi)和平均核苷酸变异数(average number of nucleotide differences,K)。构建包括建昌马在内的19个品种马的NJ系统进化树,计算各品种间的遗传距离。结果显示,试验获得了清晰的PCR扩增产物,并通过直接测序方法获得了约1200 bp的序列。39匹建昌马mtDNA D-loop区247 bp序列(其中1个样品缺失1 bp)的AT碱基含量为61.45%,属AT碱基对富集区,检测到33个多态性位点,共显示26种单倍型,其中4种为共享单倍型,且Hap7和Hap1为优势单倍型,单倍型多样性为0.947,核苷酸多样性为0.02399,平均核苷酸变异数为5.901,显示丰富的母系遗传多样性;NJ系统进化树显示,建昌马分布在A、C、D、E、F、G共6个支系中,约50%的样品分布在A支系,显示出复杂的母系起源;建昌马与关中马的遗传距离最小(0.021),其次是三河马、文山马、韩国车巨马(0.024),与韩国济州岛马遗传距离最大(0.032)。本研究结果表明,建昌马的mtDNA D-loop高变区遗传多样性丰富,具有多个母系起源,且A支系占有明显优势,与关中马、文山马可能有共同的母系起源。 相似文献
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为了大规模检测β-酪蛋白(β-CN)的不同遗传变异体,试验用Chelex 100树脂从九龙牦牛公牛(n=102)肉中快速提取基因组DNA,用巢式PCR特异性扩增β-CN基因(CSN2)部分片段,并对九龙牦牛公牛CSN2基因型进行单链构象多态性(SSCP)分析和测序验证。结果表明:九龙牦牛公牛中CSN2基因的A1A1、A1A2和A2A2的基因型频率分别为0.069,0.098,0.833,A2A2型(n=85)占绝对优势;A1和A2等位基因频率分别为0.132和0.868。说明PCR-SSCP方法可靠,能大规模检测九龙牦牛β-CN的基因型。 相似文献
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扁蓿豆是苜蓿属中唯一可以适应极端环境的物种,大量的研究证明其在低温寒冷条件下具有优良的抗逆性,且耐践踏、耐贫瘠、产量高,营养价值高,在改良天然草场、建立栽培人工草地、提高畜牧经济价值等方面具有重要意义。鉴于此,整合国内外学者在扁蓿豆优良抗逆性、遗传资源价值、生态价值、饲用及经济价值等多方面的研究工作进展,分析扁蓿豆对于川西北高原草地的适应性,为川西北草原退化治理、生态建设提出可行策略,同时也为苜蓿属牧草及其他牧草抗逆性育种改良研究提供参考依据。 相似文献
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目的探索兔MSTN、Myf5基因的部分单核苷酸多态性(SNP)及其与不同兔品种生长速度之间的关联。方法试验采用Chelex 100树脂从齐兴肉兔(n=30)和伊拉兔(n=30)血液中快速提取基因组DNA,用PCR扩增MSTN和Myf5基因部分片段并直接测序。结果仅在3只齐兴肉兔MSTN基因中检测到1个SNP位点c.108CT,有CC和CT 2种基因型,其余样品及伊拉兔中全部为CC型;在齐兴肉兔Myf5基因中检测到5种SNP,其SNP较丰富,但在伊拉兔中,仅在c.577+9AG位点发现1种突变率低的SNP。另外,2个品种兔的Myf5基因内含子中均存在高比例的碱基缺失突变。结论推测这些SNP位点及差异可能与兔的生长速度关联。 相似文献
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为了检测马的3个候选矮基因的单核苷酸多态性(SNP),试验从建昌马(n=16)和安宁果下马(n=4)血液中提取基因组DNA,PCR扩增3个候选矮基因的特定SNP位点并直接测序,对测序结果进行分析。结果表明:在高迁移率族蛋白A2(HMGA2)基因c.83位点仅检测到G等位基因;锌指蛋白(ZFAT)基因BIEC2-1105377位点的G等位基因占绝对优势;配体依赖核受体共抑制物(LCORL)基因BIEC2-808543位点的T等位基因占优势;ZFAT基因和LCORL基因SNP位点的优势等位基因频率均在0.8以上,并与已报道的控制马矮小性状的等位基因相同。说明建昌马和安宁果下马ZFAT基因和LCORL基因的SNP位点均存在明显的优势等位基因,而HMGA2基因可能与建昌马和安宁果下马矮小性状无关。 相似文献
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