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本研究旨在了解马细小病毒的遗传进化特征。采集新疆昌吉市和哈密市等马场共计53匹马的粪便样品,运用高通量测序技术调查马匹携带病毒的情况。分析病毒宏基因组学测序结果,粪便样品中的核酸信息显示有马细小病毒(Equine Parvovirus,EqPV),根据GenBank中的细小病毒参考毒株VP1基因序列,设计特异性引物,验证病毒组学结果并分析马细小病毒的遗传进化特征。结果显示,在28份伊犁马粪便中发现3份样品呈EqPV阳性,阳性率为11%;在25份焉耆马粪便中检测到2份EqPV阳性样品,阳性率为8%,由遗传进化分析结果表明伊犁马和焉耆马细小病毒属于不同的进化分支,是完全不同的两种马细小病毒。本研究报道了新疆本土品种马的细小病毒携带情况,为马细小病毒的防控和流行病学研究提供基础数据。 相似文献
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为分析宠物源大肠杆菌对抗菌药物的耐药情况及ESBLs耐药基因型,采集乌鲁木齐市181份宠物犬、猫肛拭子样品,分离获得120株大肠杆菌,通过Kirby-Bauer(K-B)药敏纸片法对分离株进行药物敏感性试验,采用PCR方法检测CTX-M(CTX-M-1G、CTX-M-2G和CTX-M-9G)、TEM和SHV三种超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因。结果显示:120株大肠杆菌对四环素、氨苄西林、复方新诺明和哌拉西林的耐药率在35.8%~60.8%;对头孢噻肟、链霉素、庆大霉素、氯霉素、环丙沙星和多粘菌的耐药率在10.0%~29.2%;对亚胺培南、左氧氟沙星、阿米卡星、头孢他啶、氨曲南、氨苄西林-舒巴坦、阿莫西林、头孢吡肟和美罗培南的耐药率在0.8%~10.0%。58株(48.3%)大肠杆菌呈多重耐药表型(Multidrug resistance,MDR);犬源分离株主要对3类抗生素产生耐药(16.9%,12/71),猫源分离株主要对4类抗生素产生耐药(18.4%,9/49);其中共检测出35株ESBLs阳性菌株,CTX-M-1G、CTX-M-9G和TEM基因的检出率分别为40.0%(14/35)、28.6%(10/35)和34.3%(12/35),未扩增出CTX-M-2G和SHV基因。综上,从健康和患病宠物中均分离到多重耐药大肠杆菌,流行的ESBLs基因型以CTX-M和TEM为主。 相似文献
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旨在了解新疆牛、羊和骆驼源产志贺毒素大肠埃希菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)的系统进化分群、血清群、毒力基因、耐药性及其遗传多样性,本研究采用PCR方法对牛、羊和骆驼源STEC进行了系统发育分群、血清群和毒力基因stx1、stx2(包括亚型)、eaeA、hlyA检测,通过K-B纸片法对分离株进行药物敏感性检测,并对其进行ERIC-PCR基因分型。结果表明:94株非O157 STEC以B1群为主,含9个血清群,包括O146(n=14)、O22(n=7)、O3(n=4)、O168(n=4)、O8(n=3)、O167(n=2)、O88(n=1)、O112ab (n=1)和O147(n=1)。毒力基因检测显示,46.8%(44/94)仅携带stx1,6.4%(6/94)仅携带stx2,46.8%(44/94)同时携带stx1+stx2。羊源STEC以携带stx1+hlyA为主(68.0%);牛源STEC以携带stx1+stx2+hlyA为主(57.9%);骆驼源STEC以携带stx1+hlyA为主(25.0%)。stx1a主要分布于牛源STEC,stx1c主要分布于羊源STEC。14株(14.9%)为耐药菌,对头孢他啶、四环素、头孢噻肟、氨苄西林和氨曲南的耐药率为3.2%~5.3%,对复方新诺明、头孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、氨苄西林-舒巴坦、阿莫西林-克拉维酸和多黏菌素B的耐药率为1.1%~2.1%。ERIC-PCR结果显示牛、羊和骆驼源STEC亲缘关系较近。牛、羊和骆驼携带多种已知血清群STEC,贮存丰富的毒力基因,存在感染人类的风险,应在屠宰加工过程中予以预防和控制。 相似文献
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以原核表达的牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)重组gD蛋白作为包被抗原,建立检测IBRV抗体的间接ELISA方法.构建pET30a-gD重组质粒,在大肠杆菌中表达IBRV重组gD蛋白,Western-blot检测该重组蛋白具有良好的免疫活性.通过方阵试验确定了抗原的最适包被浓度为2.5 μg/mL,血清最佳稀释倍数为1:200,酶标二抗最佳稀释倍数为1:5 000,与病毒中和试验,全病毒ELISA方法的检测结果符合率分别为87.5%、92.5%.用该法对黑龙江部分地区采集到的863份牛血清样品进行检测,结果阳性率为82.27%.本试验建立的间接ELISA方法可用于IBR的检测和流行病学调查. 相似文献
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