马疱疹病毒5型的鉴定及遗传进化分析

采集乌鲁木齐某马术俱乐部226匹纯血马鼻拭子样品,用高通量测序检测纯血马携带病毒多样性,结果宏病毒组学分析共产生73664946条reads,有16067条reads(0.022％)注释为哺乳动物病毒,其中105条reads注释到马疱疹病毒5型(EHV-5)gH基因.根据GenBank中的EHV-5参考株2-141/6...     

A群轮状病毒的分类及命名

1分类轮状病毒（RV）属于呼肠孤病毒科（Reoviridae）、轮状病毒属（Rotavirus）。完整病毒粒子为无囊膜,球状,呈20面体结构,直径小于100纳米,由外层衣壳,内层衣壳和核心衣壳3层蛋白衣壳组成。轮状病毒基因组由11节段双股RNA组成,     

某奶牛小区奶牛隐性乳房炎的调查及药物敏感性试验

病原微生物感染引起的奶牛乳房炎是奶牛常见、防治难、花费多的疾病,其发病率居高不下,不仅给我国奶牛业生产造成经济损失,而且某些病原菌以及因治疗导致牛奶中抗生素残留,除给乳品工业造成不良影响外,更会带来一定的食品安全隐患,危害人类健康。     

马细小病毒的鉴定及遗传进化分析

本研究旨在了解马细小病毒的遗传进化特征。采集新疆昌吉市和哈密市等马场共计53匹马的粪便样品,运用高通量测序技术调查马匹携带病毒的情况。分析病毒宏基因组学测序结果,粪便样品中的核酸信息显示有马细小病毒(Equine Parvovirus,EqPV),根据GenBank中的细小病毒参考毒株VP1基因序列,设计特异性引物,验证病毒组学结果并分析马细小病毒的遗传进化特征。结果显示,在28份伊犁马粪便中发现3份样品呈EqPV阳性,阳性率为11%;在25份焉耆马粪便中检测到2份EqPV阳性样品,阳性率为8%,由遗传进化分析结果表明伊犁马和焉耆马细小病毒属于不同的进化分支,是完全不同的两种马细小病毒。本研究报道了新疆本土品种马的细小病毒携带情况,为马细小病毒的防控和流行病学研究提供基础数据。     

牛轮状病毒的流行情况及预防措施

轮状病毒（Rotavirus,RV）属于呼肠孤病毒科,轮状病毒属,其是引起多种幼龄动物病毒性腹泻的主要病原体。 1947年有学者第1次以病理学及流行病学描述了轮状病毒在幼鼠中引起的流行性腹泻,1963年第1次通过电镜观察到引起鼠流行性腹泻的病毒。     

乌鲁木齐市宠物犬、猫粪源大肠杆菌耐药性分析与ESBLs基因型检测

为分析宠物源大肠杆菌对抗菌药物的耐药情况及ESBLs耐药基因型，采集乌鲁木齐市181份宠物犬、猫肛拭子样品，分离获得120株大肠杆菌，通过Kirby-Bauer(K-B)药敏纸片法对分离株进行药物敏感性试验，采用PCR方法检测CTX-M(CTX-M-1G、CTX-M-2G和CTX-M-9G)、TEM和SHV三种超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因。结果显示:120株大肠杆菌对四环素、氨苄西林、复方新诺明和哌拉西林的耐药率在35.8%~60.8%；对头孢噻肟、链霉素、庆大霉素、氯霉素、环丙沙星和多粘菌的耐药率在10.0%~29.2%；对亚胺培南、左氧氟沙星、阿米卡星、头孢他啶、氨曲南、氨苄西林-舒巴坦、阿莫西林、头孢吡肟和美罗培南的耐药率在0.8%~10.0%。58株(48.3%)大肠杆菌呈多重耐药表型(Multidrug resistance，MDR)；犬源分离株主要对3类抗生素产生耐药(16.9%，12/71)，猫源分离株主要对4类抗生素产生耐药(18.4%，9/49)；其中共检测出35株ESBLs阳性菌株，CTX-M-1G、CTX-M-9G和TEM基因的检出率分别为40.0%(14/35)、28.6%(10/35)和34.3%(12/35)，未扩增出CTX-M-2G和SHV基因。综上，从健康和患病宠物中均分离到多重耐药大肠杆菌，流行的ESBLs基因型以CTX-M和TEM为主。     

新疆牛、羊和骆驼源产志贺毒素大肠埃希菌的系统进化分群、血清群与毒力基因及耐药性分析

旨在了解新疆牛、羊和骆驼源产志贺毒素大肠埃希菌（Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC）的系统进化分群、血清群、毒力基因、耐药性及其遗传多样性,本研究采用PCR方法对牛、羊和骆驼源STEC进行了系统发育分群、血清群和毒力基因stx₁、stx₂（包括亚型）、eaeA、hlyA检测,通过K-B纸片法对分离株进行药物敏感性检测,并对其进行ERIC-PCR基因分型。结果表明：94株非O157 STEC以B1群为主,含9个血清群,包括O146（n=14）、O22（n=7）、O3（n=4）、O168（n=4）、O8（n=3）、O167（n=2）、O88（n=1）、O112ab （n=1）和O147（n=1）。毒力基因检测显示,46.8%（44/94）仅携带stx₁,6.4%（6/94）仅携带stx₂,46.8%（44/94）同时携带stx₁+stx₂。羊源STEC以携带stx₁+hlyA为主（68.0%）;牛源STEC以携带stx₁+stx₂+hlyA为主（57.9%）;骆驼源STEC以携带stx₁+hlyA为主（25.0%）。stx_1a主要分布于牛源STEC,stx_1c主要分布于羊源STEC。14株（14.9%）为耐药菌,对头孢他啶、四环素、头孢噻肟、氨苄西林和氨曲南的耐药率为3.2%~5.3%,对复方新诺明、头孢吡肟、哌拉西林-他唑巴坦、氨苄西林-舒巴坦、阿莫西林-克拉维酸和多黏菌素B的耐药率为1.1%~2.1%。ERIC-PCR结果显示牛、羊和骆驼源STEC亲缘关系较近。牛、羊和骆驼携带多种已知血清群STEC,贮存丰富的毒力基因,存在感染人类的风险,应在屠宰加工过程中予以预防和控制。     

牛传染性鼻气管炎病毒DQ株gD基因表达及其间接ELISA方法的建立和初步应用

以原核表达的牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)重组gD蛋白作为包被抗原,建立检测IBRV抗体的间接ELISA方法.构建pET30a-gD重组质粒,在大肠杆菌中表达IBRV重组gD蛋白,Western-blot检测该重组蛋白具有良好的免疫活性.通过方阵试验确定了抗原的最适包被浓度为2.5 μg/mL,血清最佳稀释倍数为1:200,酶标二抗最佳稀释倍数为1:5 000,与病毒中和试验,全病毒ELISA方法的检测结果符合率分别为87.5%、92.5%.用该法对黑龙江部分地区采集到的863份牛血清样品进行检测,结果阳性率为82.27%.本试验建立的间接ELISA方法可用于IBR的检测和流行病学调查.     

新疆某马场马乳头瘤病毒1型全基因组测定及分析

为探明引起新疆昌吉某马场呼吸困难纯血种公马鼻腔内乳头瘤样组织的病原,采集马鼻腔内乳头瘤样组织样品,采用高通量测序检测样品携带病毒多样性.结果显示,在乳头瘤样组织中检测到马乳头瘤病毒1型,命名为G2株.采用PCR方法扩增该病毒的全基因组序列,结果显示,EcPV-1 G2株与EcPV-1、EcPV-2-9参考株E6、E7、...     

新疆地区马呼吸道致病病毒的检测及其遗传进化分析

为了解致汗血马马驹呼吸道疾病的病原,本研究采集新疆乌鲁木齐市南山某汗血马马场82份汗血马的鼻拭子样品(包括4匹患呼吸道疾病的汗血马马驹、6匹健康汗血马马驹和72匹成年健康汗血马),经处理鼻拭子样品、提取病毒RNA、反转录、经PCR扩增及产物纯化后由公司进行高通量测序和宏病毒组学分析.结果显示,与健康马相比,患病马驹鼻拭...