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利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考。 相似文献
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采集供港澳家禽喉头、泄殖腔拭子进行禽流感病毒监测,建立一步法荧光RT-PCR检测A型和H5、H7、H9亚型及H7N9病毒,所用高通量核酸提取和基因扩增体系可适应活禽出口快速检测通关的要求。2006—2015年共检测约150万份拭子,结果 H5和H7亚型高致病性禽流感全部为阴性,H9亚型等A型流感病毒阳性率约0.035%,冬、春季节检出率较高,H9亚型病毒HA基因与H7N9病毒广东流行毒株具有亲缘关系。供港澳禽流感病毒监测体系快速高效、生物安全性好,结合抗体监测和临床检查,可保证出口家禽处于无禽流感状态。 相似文献
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