简化基因组测序在畜禽应用中的研究进展

简化基因组测序(reduced-representation genome sequencing, RRGS)是指利用生物信息学方法设计标记开发方案,富集特异性长度片段,应用高通量测序技术获得海量标签序列来代表目标物种全基因组信息的测序方法。通过RRGS能够发现更多新的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,为研究控制畜禽生长发育、肉质调控、代谢调节基因及其遗传进化多样性提供重要基础分析数据。文章主要对RRGS中的限制性酶切位点相关DNA测序(restriction-site associated DNA,RAD-seq)、2b-RAD(ⅡB restriction-site associated DNA)、双酶切简化基因组测序(double digest RAD,ddRAD-seq)和基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)四种技术原理及在畜禽分子标记开发、遗传图谱构建和数量性状定位(QTL)方面的应用进行综述,旨在为简化基因组测序在畜禽育种研究中的应用提供基础资料。     

不同动物模型对安格斯牛周岁生长性状遗传参数估计的比较分析

旨在分析不同动物模型对宁夏地区安格斯牛周岁生长性状遗传参数估计的影响,筛选出估计生长性状遗传参数的最佳动物模型。本研究使用包含或剔除母体遗传效应、母体永久环境效应及母体与直接遗传效应之间是否存在协方差来区分6种动物模型,借助DMU软件的DMU_AI模块,利用约束最大似然法(AI-REML)估计安格斯牛周岁生长性状的遗传参数。利用赤池信息准则(AIC)和似然比检验(LRT)来确定最佳动物模型。结果表明:1)在不考虑母体效应的模型中(模型1),周岁体重、体高、体长和胸围的直接遗传力分别为0.59±0.02、0.52±0.03、0.20±0.04和0.52±0.03;2)在考虑母体加性遗传效应及其与直接加性遗传效应的协方差模型中(模型4),直接遗传力和母体效应的遗传力升高,总遗传力值降低;3)模型4估计的周岁体重、体高、体长和胸围的直接遗传力分别为0.77±0.01、0.73±0.03、0.33±0.04和0.70±0.03,母体效应遗传力分别为0.50±0.05、0.51±0.05、0.10±0.04和0.23±0.04,总遗传力分别为0.16±0.06、0.12±0.05、0.11±0.01和0.32±0.01。综上,基于本研究发现模型4对安格斯牛周岁生长性状的遗传参数估计效果最佳,为宁夏地区安格斯牛核心群的选育提高提供理论依据。     

静原鸡ELOVL2基因遗传多态性研究

为了探讨静原鸡极长链脂肪酸延伸酶蛋白2(elongation of very-long-chain fatty acids 2,ELOVL2)基因的遗传特性,确定核苷酸的变异位点,本研究采用PCR-SSCP及DNA测序技术对静原鸡ELOVL2基因进行多态性检测。结果显示,静原鸡ELOVL2基因外显子6无多态性,内含子2和6呈中度多态。在ELOVL2基因内含子2扩增片段上共检测到5种基因型:A_2A_2、B_2B_2、C2C2、D2D2和A_2C2,4种等位基因:A_2、B_2、C2和D2,其中A_2为优势等位基因(0.62),A_2A_2基因型为优势基因型(0.54);3个SNPs位点:g.63372228+4918GA的转换、g.63372228+5024TC的转换和g.63372228+4928CA的颠换。在E2e6I6扩增片段上共检测到3种基因型:A_1A_1、B_1B_1和A_1B_1,2种等位基因:A_1和B_1,其中A_1为优势等位基因(0.67),A_1A_1基因型为优势基因型(0.54),等位基因B_1存在g.63388000+748GC的颠换。群体遗传学分析发现,静原鸡ELOVL2基因内含子2、6遗传纯合度均较高,且偏离了Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。本研究结果表明,静原鸡ELOVL2基因内含子2和6序列突变较高,且呈中度多态,表现出纯合子优势,外显子6上无突变。     

苯酚/氯仿抽提法提取牛血与鸡血DNA部分条件的比较研究

为了探讨苯酚/氯仿抽提法中加入血液和红细胞裂解液(PBS)的量对DNA提取效果的影响以及找到针对牛血和鸡血最合适的DNA提取条件,试验以安格斯牛和静原鸡为研究对象,采用苯酚/氯仿抽提法提取血液基因组DNA。结果表明:在试验第1步加入200μL鸡血1次,用1 500μL PBS重复裂解2次,可以得到高质量鸡的基因组DNA。当加入鸡血的量过大时,提取的DNA浓度过高且不纯,蛋白质等外源核酸的污染较严重。在试验第1步加入500μL牛血1次,用1 500μL PBS裂解,重复2次,可以得到高质量牛的基因组DNA。苯酚/氯仿抽提法可以节省时间,还可以避免血液的浪费。     

安格斯牛体重和体尺性状生长曲线拟合与相关性分析

为充分了解安格斯牛生长发育规律,指导饲养管理和提高品种选育,以安格斯牛为研究对象,通过Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy 3种曲线模型对0～18月龄安格斯牛体重和体尺性状进行生长曲线拟合分析,并选出最佳生长曲线模型,利用该模型计算体重和体尺的相对生长(R)和绝对生长(G)情况,并对各性状...     

喇叭河自然保护区种子植物区系特征分析

通过对喇叭河自然保护区内共有种子植物的调查,和对其科、属的分布区类型统计,得出喇叭河自然保护区种子植物区系特征如下:①种子植物类型丰富,区系成分复杂.②优势科、属明显.③在显示出温带区系性质的同时具显著的过渡性质.④种子植物起源古老.⑤地理成分复杂.⑥特有类群丰富.     

宁夏地区安格斯牛育种目标性状确定及边际效益分析

旨在确定安格斯牛的育种目标性状及其相对经济重要性.本研究结合现有的育种和生产条件,利用差额法计算安格斯牛生长发育性状、繁殖性状和胴体性状的边际效益,确定各性状的相对经济重要性,并分析市场价格变化对目标性状边际效益的敏感性.结果表明:1)确定的3类安格斯牛育种目标性状中,生长发育性状,繁殖性状和胴体性状的相对经济重要性之...     

基于选择性激光烧结技术的泵轮铸造工艺研究

通过合理设计泵轮模型支撑,对泵轮选择性激光烧结的烧结工艺、后处理工艺进行研究,确定了烧结工艺和后处理工艺,烧结出合格的泵轮模型;对模壳焙烧工艺的研究,确定了模壳焙烧工艺,并浇注出合格的泵轮铸件.     

喇叭河自然保护区种子植物区系特征分析

通过对喇叭河自然保护区内共有种子植物的调查，和对其科、属的分布区类型统计，得出喇叭河自然保护区种子植物区系特征如下：①种子植物类型丰富，区系成分复杂。②优势科、属明显。③在显示出温带区系性质的同时具显著的过渡性质。④种子植物起源古老。⑤地理成分复杂。⑥特有类群丰富。     

37种园林绿化植物苗木对氯气的抗性及吸收能力

采用人工熏气法,对37种园林绿化植物对氯气（Cl2）的抗性及吸收能力进行了研究,通过系统聚类分析方法,将参试植物的抗性及吸收能力分别从弱到强划分为5个等级（I,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,V）。实验结果显示：37种植物对氯气抗性存在较大差异．抗性最强的为茶花Camellia japonica,最弱的为乳源木莲Manglietia yuyuanensis,红花木莲Manglietia insignis和交让木Daphniphyllum macropodum;37种植物对氯气吸收能力差异显著,吸收能力最弱的为乳源木莲,熏气前后氯元素质量分数差为0．50mg·kg^-1,最强的为火棘Pyracantha fortuneana,熏气前后氯元素质量分数差变化8107．68mg·kg^-1。图2表5参11