仔猪空肠和回肠微生物多样性分析

[目的]微生物作为影响机体营养物质消化吸收的重要因素,在仔猪肠道生长发育过程中起至关重要的作用。本研究分析了马身猪与晋汾白猪仔猪在生长发育时期的空肠、回肠微生物组成变化,旨在揭示肠道菌群与血清生化指标和肠道结构的关系。[方法]收集马身猪和晋汾白猪在3个发育时期（1日龄,28日龄和70日龄）仔猪空肠、回肠组织以及内容物（n=3）,通过16S rRNA高通量测序与生信技术分析微生物多样性,HE染色测定肠道形态结构,相关性分析将微生物菌群与血清免疫指标和肠绒毛结构关联。[结果]仔猪初生期小肠绒毛最长,保育末期隐窝深度最高。晋汾白猪仔猪肠道微生物分布于28个门和518个属;马身猪仔猪肠道微生物分布于19个门和325个属。其中,厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门为仔猪优势菌门,且乳酸杆菌丰度均较高。此外,仔猪肠道微生物多样性与血清免疫指标（LPS、TNF-α、IL-6、DAO、D-LA）以及隐窝深度显著相关,而与绒毛长度显著不相关。[结论]地方品种马身猪仔猪肠道微生物组成更加保守,乳酸杆菌、Ferruginibacter等在猪抗逆性能方面发挥重要作用,Quinella、Haliangium等在营养吸收...