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麻核桃CBF基因的克隆与生物信息学分析 总被引:1,自引:0,他引:1
CBF基因是植物CBF抗冷途径的枢纽,对增强植物抗冷能力极为重要。本研究根据已知的核桃CBF基因序列设计通用性引物,对麻核桃cDNA进行PCR扩增,成功获得麻核桃CBF基因全长序列,命名为JhCBF。JhCBF全长820 bp,包含一个645 bp的开放读码框(ORF),编码214个氨基酸。序列分析表明JhCBF与其他物种来源的CBF具有较高的同源性,其中,与桦木科白桦的同源性最高,为61.22%;JhCBF含有一个预测的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。系统进化树分析表明JhCBF与桦木科白桦的亲缘关系最近,最先聚为一类。 相似文献
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平欧杂种榛遗传多样性分析的SSR分析 总被引:1,自引:1,他引:0
本研究主要对杨树RAPD体系进行优化,以银白杨为试材,利用L16(45)正交试验设计和2个单因素试验,研究各主要参数的适宜浓度。结果表明,杨树RAPD优化后的反应体系:20μL反应体系中,含Mg2+1.5 mmol/L、Taq酶2.0 U、引物0.2μmol/L、dNTPs 0.2 mmol/L、模板DNA 50 ng。扩增程序为:94℃预变性3 min、94℃变性40 s、38℃退火60 s、72℃延伸90 s,共38个循环;最后在72℃延伸7 min后4℃保温。通过1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测其扩增产物,证明该体系稳定可靠,可以用于杨树的遗传学分析。 相似文献
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CBF(CRT/DRE-binding factor)基因是一种低温响应转录因子基因,CBF蛋白能够与很多低温相关基因的启动子结合,使其表达,从而增强植物抗冷能力。本研究利用已经公布的CBF序列的保守区设计特异引物,对樱桃砧木吉塞拉6号的cDNA进行扩增,成功获得CBF的全长序列。序列分析结果表明,其开放阅读框为723 bp,编码240个氨基酸,具有典型的AP2结构域及CBF特有的两段短肽序列。氨基酸序列同源性分析表明,该CBF与蔷薇科植物同源性较高,与其他科属植物同源性较差。 相似文献
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云南省玉米灰斑病菌差异性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
采用单孢分离方法,从云南省10个州(市)玉米灰斑病标本上分离到32个菌株,测定其抗紫外辐射能力和孢子大小,并利用SSR标记技术分析了菌株间的遗传多样性.结果表明,在海拔2000~ 2300,1800 ~ 2000,1600 ~ 1800和1000~1600m采集的菌株,紫外辐射量为7.5 KJ/m2辐照1h后,分生孢子萌发率分别为89.96%、74.15%、66.99%和46.36%;分生孢子长度分别为58.92、54.68、55.69、52.37 μm,宽度分别为9.11、7.82、7.13、6.54μm,长×宽为41.78~67.04 μm×5.76~9.43 μm,菌株采集地海拔与抗紫外辐射能力和分生孢子宽度之间呈极显著性正相关,相关系数分别为0.5812(P≤0.01)和0.7485(P≤0.01),但分生孢子长度与海拔间相关性不显著.病菌的遗传背景存在很大差异,但与菌株来源地无关联. 相似文献
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