固有无序蛋白有序和无序结合区域的序列特征分析

基于DisProt数据库,其将固有无序蛋白按照分子功能分为6大类,选取每一类功能下每条有序与无序区结合位点左右两侧5个氨基酸残基作为研究对象;利用方差分析分别统计6类分子功能中有序与无序区结合位点处20种氨基酸以及6类亲疏水性氨基酸分布的差异。结果表明:不同分子功能的固有无序蛋白在有序与无序结合点处的氨基酸含量及亲疏水特性都存在着较显著差异。在固有无序蛋白6类分子功能中,氨基酸(D、G、H、I、P、S、T、Y)在有序区的分布存在差异;而氨基酸(D、G、V)在无序区的分布存在差异。而在6类亲疏水性氨基酸中,强疏水性氨基酸(L、I、V、A、M、F)和弱疏水性或弱亲水性氨基酸(S、T、Y、W)以及脯氨酸P和甘氨酸G在有序区的分布存在差异;而甘氨酸G在无序区的分布存在差异。本文的研究旨在挖掘固有无序蛋白不同分子功能中有序与无序区结合位点处的序列特征,以便于下一步对固有无序蛋白预测软件的开发和改进。