四川省猪流行性腹泻病毒SNJ-P株的分离鉴定与遗传进化分析

【目的】探究四川省猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株流行变异情况,并分析疫苗免疫效果不佳的原因。【方法】从四川某猪场采集仔猪肠道样本进行PCR检测、病毒纯化、病毒滴度测定以及病毒感染等试验;测定分离株全基因组序列,将分离株S基因序列与其他地区毒株及疫苗株进行比对并构建进化树;比较分离株与经典疫苗株CV777 S蛋白氨基酸位点变异情况。【结果】成功分离获得1株PEDV毒株,并命名为PEDV SNJ-P,该毒株病毒滴度为1×107.5/100μL。动物感染试验表明：分离株能引起仔猪出现腹泻和脱水等症状并导致死亡。全基因组测序及遗传进化分析表明：PEDV SNJ-P株全基因共28 003 bp,基因型为S non-INDEL型;与同型的中国分离株PEDV-WS、CH/JLDH/2016和CH/HNLH/2015等毒株亲缘关系较近,与同型的疫苗株亲缘关系相对较远,与经典疫苗株亲缘关系较远。与经典疫苗株CV777相比,SNJ-P株的S蛋白存在多处氨基酸突变、缺失和插入现象。【结论】由于毒株出现变异,SNJ-P株与疫苗株亲缘关系较远,当前所用疫苗无法提供有效保护。本研究结果以期为国内PEDV毒株的研...     

PEDV、TGEV、PoRV 3种猪病毒性腹泻病毒的流行现状及控制策略

目的建立快速准确检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)的方法。方法以原核表达的PEDV S蛋白为包被抗原,建立高效特异的间接ELISA抗体检测方法。PCR扩增PEDV S基因并命名为SJ,纯化鉴定后克隆至表达载体pET-32a (+),构建重组质粒pET-32a (+)-SJ。重组蛋白经诱导表达、纯化鉴定后,测定蛋白质量浓度,以其为抗原包被于板。优化ELISA反应条件,对建立方法的特异性、重复性、符合性及临床应用进行评估。结果原核表达的PEDV S蛋白约为35 ku,质量浓度为1.145 mg/mL。Western-blot鉴定其具有良好的反应原性,以其作为包被抗原建立的PEDV间接ELISA抗体检测方法仅对PEDV血清检测为阳性,具有良好的特异性。批内和批间重复性试验的变异系数均小于6%,利用该方法对临床样品检测的结果与市售检测结果符合率为96.67%。结论该方法特异性良好,重复性高,成本低,可用于临床PEDV血清抗体检测以及PEDV流行病学的监测,对本病的预防具有重要意义。     

裂谷热病毒两种PCR检测方法的建立及比较分析

裂谷热(RVF)具有较高的发病率与死亡率,极大危害着当地养殖业和生态系统的稳定。为建立一种能够快速有效检测裂谷热病毒(RVFV)的方法,本研究根据RVFV的保守序列设计了特异性引物与探针,分别建立了探针PCR和荧光PCR,并对这两种检测方法进行比较分析。结果显示,两种检测方法均不存在非特异扩增;最低检测浓度分别为1.03×10~(-2)拷贝/μL和1.03×10~0拷贝/μL,前者比后者有更高的灵敏度;探针PCR和荧光PCR组内和组间变异系数均小于3%。实验表明,探针PCR具有特异性强、灵敏度高、稳定性好、准确度高、检测速度快等优点。因此,探针PCR是一种灵敏度和可靠性均较高的RVFV检测方法。