白羽扇豆WRKY转录因子家族鉴定及生物信息学分析

WRKY转录因子家族在植物生命活动中具有重要作用。利用生物信息学方法分析白羽扇豆基因组数据,对LaWRKY转录因子家族成员进行鉴定及染色体定位,同时分析其蛋白理化性质、系统发育进化关系、保守基序分布、保守结构域位置、基因结构及启动子-顺式作用元件等,并从系统发育进化的同源性、启动子-顺式作用元件等多角度对LaWRKY转录因子功能进行预测。结果表明,在白羽扇豆中共鉴定到106个LaWRKY转录因子家族成员,各成员不均匀地分布在24条染色体上,但18号染色体上无分布;106个成员聚类为3个亚族（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）,各亚族成员的保守基序分布相似,对应的保守结构域、基因结构特征也表现一定的规律性,多角度预测到LaWRKY转录因子与植物激素、环境变化等方面有关联。本研究为深入解析LaWRKY转录因子对白羽扇豆生命活动的调控作用提供理论参考。     

云南栘［木衣］叶片总RNA提取方法的比较与改进

高质量RNA的提取是开展云南栘［木衣］分子生物学研究的前提。采用OMEGA (Plant RNA Kit 50)试剂盒、TIANGEN(TRNzol-A+Reagent)试剂盒、CTAB法、Trizol法、SDS法及其改良法6种方法提取云南栘［木衣］叶片的RNA,并用琼脂糖凝胶电泳、核酸蛋白检测仪及RT-PCR技术比较了6种不同方法提取的总RNA样品的质量。结果表明,2种试剂盒法和trizol法不适合云南栘［木衣］RNA提取,无法得到28S、18SrRNA条带,CTAB法和SDS法虽能得到RNA的3条带,但拖带现象严重,A₂₆₀/A₂₃₀的比值较低,对SDS法进行改进,提高β-巯基乙醇的量,在缓冲液中增加PVP,使用HiBind RNA Mini柱,有效地抑制多酚多糖的污染,得到了较高质量、可用于RT-PCR扩增的云南栘［木衣］的RNA。对其开展分子生物学研究提供技术支撑。