中国瘰螈皮肤转录组测序及活性多肽分析

首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽。提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建cDNA文库，采用Illumina HiSeq 4000进行测序。测序数据处理后获得unigene，并对其进行基因注释和生物信息学分析。共组装获得了74 371 个非冗余unigene（平均长度为762 bp），其中33 627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释，5 137个unigene的注释结果来自两栖类物种，约占注释总数的15%。另外，从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素，它们大多数具有皮肤免疫或防御功能，且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽。结果为阐明蝾螈皮肤免疫或防御机制提供了前期基础资料。