美国红梣叶绿体基因组密码子偏好性分析

为了提高基因的表达效率,利用叶绿体基因工程提高美国红梣的重要特性,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP分析了美国红梣叶绿体基因组中的52条基因编码序列密码子偏好性。结果表明,美国红梣叶绿体基因组密码子的GC含量依次为GC_1(45.23%)GC_2(39.23%)GC_3(26.19%);有效密码子数(ENC)范围为37.55～55.28,其中ENC值45的有34个;RSCU1的密码子有29个,其中14个以U结尾、12个以A结尾,表明其偏好以A、U结尾,且偏倚很弱。中性点图分析表明,GC_(12)与GC_3的相关系数为0.321 7,回归系数为-0.538 5,相关性不显著;美国红梣叶绿体基因组的GC含量是高度保守的,密码子偏好主要受环境选择的影响;17个密码子被确定最优密码子。本研究为美国红梣叶绿体遗传工程和遗传多样性分析提供了科学依据。     

山西林区地衣种类及区系地理成分研究

为了分析山西林区地衣物种多样性和区系分布,进行山西林区地衣汇总、物种多样性分析、区系地理成分分析和周边区域种属相似度分析。结果表明,山西林区地衣共19科(含不完全地衣)33属54种;5种及以上地衣的优势科共有4种,分别是茶渍科、网衣科、胶衣科、梅衣科,优势科占总科数的21.05%,其中,梅衣科的地衣种数最多,占全部地衣种数的18.52%,占优势科种数的37.02%;地衣生境有16种岩面生,27种树生,11种为土壤(或苔藓)生。在山西2个以上区域出现的地衣有:盘形黑瘤衣石生变种(Buellia disciformis)、喇叭粉石蕊(Cladonia chlorophaea)、梅衣(Parmelia tinctorum)、莠梅衣(Parmelia ruderata)、石梅衣(Parmelia saxatilis)、黄烛衣(Candelaria concolor)、灰石耳(Umbilicaria cinerascens)、蓝绿癞屑衣(Lepraria aeruginosa)、灰白癞屑衣(Lepraria incana);山西林区地衣区系地理成分中,温带成分占42.6%。山西与陕西地衣共有20种,种相似系数为37%,山西与山东地衣共有14种,种相似系数为25.9%;山西林区地衣和周边区域地衣相比,山西林区地衣科属种的丰富度综合系数为0.071 2。地衣丰富度处于中等水平,山西还有许多区域尚未进行地衣物种调查,还有待于更多地衣学者进行考查研究,为山西林区地衣资源的研究、利用和保护提供更多的理论依据。