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病原基因组信息的匮乏是牡蛎病害研究进展缓慢的主要原因之一。为鉴定更多牡蛎相关病毒,基于前期研究获得的华南沿海多地养殖的香港牡蛎 (Crassostrea hongkongensis) 病毒组测序数据进行质控、组装、物种注释后,挑选出其中疑似圆环病毒基因组序列进行进化树构建、基因组比较、蛋白结构域分析、三维结构预测和病毒丰度分析,在养殖牡蛎体内鉴定到了5个序列完整的新型牡蛎相关圆环病毒基因组,且5个病毒基因组在多个样品中存在。结果显示,5条病毒序列与已知的圆环病毒聚类在一个大的分支,说明其为圆环病毒科成员;5条病毒基因组序列均含有一个复制酶蛋白基因,且均与节肢动物圆环病毒复制酶蛋白序列最为相似;5条序列与另外7条公共数据库检索到的序列形成了一个独立的子分支,且该分支的序列来源多为动物相关样品。基于结构域分析软件 (SMART) 鉴定到多数序列中存在复制酶的保守结构域。 相似文献
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笔者采用从药用植物密毛山梗菜(Lobelia clavata)植株中分离得到的放线菌菌株DJ15为材料,对其培养基配方和发酵条件进行试验,筛选出最优配方和发酵条件,旨在从药用植物中分离筛选出微生物用于香蕉枯萎病的防治。结果表明,菌株DJ15最优培养基配方为:葡萄糖1.5%,黄豆粉1.0%,蛋白胨3%,氯化铵1.0%,氯化钠0.4%,碳酸钙0.3%,硫酸镁0.1%和硫酸钾0.1%;最优培养条件为:p H6,接种量15%,摇床转速100 r·min-1,培养时间120 h。优化发酵条件后,放线菌菌株DJ15对香蕉枯萎病病原菌的抑制率达到73.58%,比优化前提高135.11%。 相似文献
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