lncRNA 基因At3NC026490 启动子克隆与功能分析

lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们通过调控基因表达或直接影响蛋白功能,在植物生长发育与胁迫响应过程中发挥重要作用。At3NC026490是拟南芥中的一个lncRNA,目前尚未见该lncRNA功能方面的报道。从启动子角度对At3NC026490的功能进行探索,首先利用生物信息学手段分析At3NC026490启动子的特性,发现该启动子具有响应光、激素、胁迫等作用元件;随后构建At3NC026490启动子驱动GUS基因的表达载体并转入拟南芥中;GUS染色分析表明转基因株系的根、幼苗、叶等营养组织以及花器官的花瓣具有明显的GUS表型,而在不同发育时期的种子中并未观察到GUS表型,说明该启动子具有典型的组织驱动特性,表明At3NC026490基因可能在应答光、激素、胁迫刺激以及特定组织中发挥作用,该研究为后期深入阐释lncRNA的功能提供了重要信息和研究思路。     

大豆GmMYB138A 基因的克隆 及冷胁迫诱导表达分析

根据大豆基因组信息,从大豆品种吉林32中克隆了1个转录因子基因,该基因对应大豆基因组中的CDS Glyma02g03020。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白属于MYB转录因子类型,主要分布在细胞核中;进化树分析将它与1R-MYB蛋白聚为一类,并与大豆MYB138亲缘关系最近,同源性可达96%,将其命名为GmMYB138A;进一步利用qRT-PCR分析GmMYB138A响应冷胁迫的表达模式,结果表明随着胁迫处理时间的延长,该基因表达逐渐增加,并在胁迫24 h达到高峰,提示GmMYB138A可能参与大豆的冷胁迫应答过程。