萝卜ALMT基因家族的鉴定与表达

为探究萝卜铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)家族成员对生物和非生物胁迫的响应,本研究通过生物信息学方法对萝卜ALMT家族成员进行鉴定,并利用转录组数据对其进行表达分析.结果显示,萝卜基因组中包含17个ALMT基因,分布于8条染色体.该家族成员外显子数量为5～7个,预测N-端含有5～6个跨膜结构,在染色体上的分布不均匀.萝...     

萝卜STP13.2基因的克隆及序列分析

利用RT-PCR技术克隆了萝卜（Raphanus sativus L.）STP13.2基因CDS序列，并对其进行测序和生物信息学分析。结果表明：RsSTP13.2 CDS序列全长1599 bp，编码532个氨基酸残基，分子式为C2678H4191N685O713S21。相对分子量为58.1 kD，理论等电点为9.29，脂肪指数为108.12，是稳定蛋白。RsSTP13.2蛋白包含12个跨膜结构，预测其可能定位于细胞膜；系统进化分析表明其与白芥、甘蓝型油菜和白菜等多个不同物种具有较高的同源相似性。本研究为下一步STP13.2基因的功能和表达调控机制研究奠定了基础。     

萝卜VQ1基因的克隆与序列分析

利用RT-PCR技术克隆了萝卜（Raphanus sativus L.）VQ1基因CDS序列，并对其进行测序和生物信息学分析。结果表明，Rs VQ1开放阅读框长861 bp，编码286个氨基酸残基，相对分子量为31.3 kD，理论等电点为6.49，脂肪指数为62.69，为不稳定的亲水性蛋白，无跨膜结构和信号肽。RsVQ1蛋白主要由无规则卷曲结构构成，预测其可定位于细胞核。系统发育分析表明该蛋白与十字花科作物VQ蛋白存在较高同源性。本研究为RsVQ1的表达和基因功能研究奠定了基础。