德宏奶水牛SCD基因乳腺组织表达及生物信息学分析

本试验旨在研究德宏奶水牛SCD基因表达规律和探究水牛SCD生物学特性。用乳品分析仪测定乳脂率,依照乳脂率高低进行分组,分为高、中、低组（分别为H组、M组、L组）。采用qPCR法检测SCD基因表达量,与乳脂率进行关联分析。利用生物信息学方法对水牛SCD的结构进行预测。结果表明,H组SCD表达量极显著高于M组和L组（P<0.01）,M组极显著高于L组（P<0.01）。其mRNA表达水平与乳脂率呈强正相关。生物信息学分析结果显示,水牛SCD为不稳定亲水蛋白,不存在信号肽,主要在内质网（44.4%）发挥作用。二级结构主要由无规则卷曲（40.39%）、α-螺旋（39.55%）构成。SCD与ELOVL6、SREBP1、FASN等脂质代谢关键分子互作。研究表明,德宏奶水牛SCD基因的表达可能影响乳脂合成。     

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研究德宏奶水牛乳腺组织FASN基因表达水平及水牛FASN蛋白的生物学特性。

用乳成分分析仪测定乳脂率,并按照乳脂率将德宏奶水牛分为高(H)、中(M)、低(L)组;运用qPCR法测定乳腺组织FASN基因的表达水平,分析其与乳脂率的相关性;运用生物信息学方法分析水牛FASN蛋白的理化性质及结构特征。

H组德宏奶水牛乳腺组织的FASN基因表达水平极显著高于L组和M组(P<0.01),M组极显著高于L组(P<0.01),其mRNA表达水平与乳脂率呈极显著正相关(P<0.01)。水牛FASN蛋白的分子式为C₁₂₁₈₈H₁₉₃₂₇N₃₃₆₃O₃₆₃₁S₁₀₉,分子质量为274.56 ku,蛋白不稳定;在细胞内主要分布于细胞核;具有2个结构域,均与脂类合成代谢有关;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;进化树及同源性分析显示：水牛FASN蛋白与牦牛和家牛的亲缘关系较近,序列同源性较高;FASN主要与ACACB、ACACA和ACLY互作较为紧密。

德宏奶水牛乳腺组织中FASN基因表达可能促进乳脂率提高。