绿豆萌发期耐旱种质资源筛选评价和遗传多样性分析

[目的]鉴定56份绿豆种质种子萌发期耐旱性,明确其遗传特性.[方法]采用10％甘露溶液模拟干旱胁迫,以相对发芽率、相对发芽势和相对根长等10个指标作为耐旱性评价指标,通过主成分分析、隶属函数分析和多元分析方法鉴定种质耐旱性.同时基于SSR扩增对56份绿豆种质资源进行分子聚类,明确其遗传基础.[结果]干旱胁迫对萌发期10...     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅳ.不同品种同一引物检测试验

根据引物筛选结果,选出9个均可用SSR引物RM17检测纯度的两系杂交稻品种,通过室内鉴定判断品种间的分子学差异.同时通过田间正季鉴定判断品种间的植物学特征差异,探讨SSR引物的分辨力和可靠性.结果表明,当遗传背景较近的品种相互混杂时,用单对引物不能有效区分.     

SSR法鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅴ.不同引物检测同一品种纯度的准确性

试验将同一样品用不同引物检测纯度,发现不同引物检出的纯度结果不同。用SSR法检出的纯度结果不同引物之间的误差随着样品田间纯度的增高而呈现出降低的趋势。当品种不同时,室内检测结果有可能高于或低于田间鉴定结果。因此难以找到普遍适用的室内与室外检测的系统误差校正方法。     

SSR法鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅲ.两个形态学差异较大的品种间掺杂回收试验

在两系杂交稻两优培九的大群体田间纯度鉴定中,定向掺入形态学差异较大的两系杂交稻新两优6380,逐株抽取田间植株叶片样品,运用SSR法进行鉴定.结果表明,运用SSR法能够准确地检测出掺入的新两优6380.在室内检测的谱带中发现,新两优6380的带型与两优培九不育系带型的位置相同.     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅱ.不同苗龄取样方法对室内纯度结果的影响

以水稻(Oryza sativa L.)两优17为试验材料进行标准发芽后,对幼苗进行大苗、小苗分类,并利用SSR引物分别对其进行室内纯度鉴定.鉴定结果表明,苗的大小对鉴定结果的影响较大,小苗与大苗的纯度相差2.8个百分点,超出了允许的误差范围.与大田相比,大苗的纯度更接近于田间秧苗纯度.在田间小苗往往不能成苗,不影响大田纯度,故小苗是造成室内与大田纯度鉴定结果产生差异的重要原因之一.     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨 Ⅵ.不同引物判定同一样品植株纯度的准确性

将同一样品在室内用不同引物对各植株进行检测,并与田间检测结果比对,发现不同方法对杂株的判别能力不同,并分析了导致同一植株出现不同判定结果的原因,为降低分子检测和田间鉴定结果之间的误差提出了相应技术对策。     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅰ.亲本和杂交种分别筛选引物的适用性

分别采用亲本和杂交种为材料,从44对引物中筛选出适合于鉴定两系杂交水稻品种两优17、苯两优639、天两优616的引物.结果表明,对同一品种用两种方法筛选出的SSR引物相同.在没有亲本的情况下,仅用杂交种筛选得到的引物可用于室内纯度鉴定.     

蚕豆自噬基因鉴定及响应干旱胁迫分析

[目的]根据转录组测序结果鉴定蚕豆自噬(Augophagy,ATG)基因,分析其对干旱胁迫的响应,为深入研究该类基因在干旱胁迫下的作用机制提供理论参考.[方法]利用蚕豆干旱胁迫转录组测序(RNA-seq)数据,根据swiss-port、NCBI、Ensemble等数据库的注释,筛选和鉴定蚕豆ATG基因;通过Smart、...     

基于盐胁迫转录组信息的蚕豆F-box基因家族分析

【目的】通过生物信息学方法分析蚕豆F-box基因家族成员的分布、结构及进化,研究家族成员在不同处理时间条件下的表达模式及对盐胁迫的响应,为该类基因生物学功能和盐胁迫机制的研究提供参考。【方法】基于蚕豆盐胁迫转录组测序(RNA-seq)数据,利用NR、Swiss-prot和PFAM 3个数据库和NCBI网站,对蚕豆F-box基因进行筛选注释;利用Web Logo 3、Prot Comp 9.0、MEGA-X和MEME等软件进行保守结构域、亚细胞定位、系统进化树和Motif等生物信息学分析。基于盐胁迫转录组数据分析蚕豆(yz17134耐盐和yz17078不耐盐)F-box基因家族在盐胁迫下的差异表达模式,并采用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)检测部分家族成员在16和24 h的表达情况。【结果】基于盐胁迫转录组测序数据,注释得到161个蚕豆F-box基因,均含有F-box保守结构域。根据C端结构域的不同,将其分成11个亚族:FBX、FBXFBA、FBXLRR、FBXPP2、FBXKelch、FBXTUB、FBXFBD、FBXDUF、FBXACTIN、FBXWD40和FBO。保守结构域...     

41份非洲地区和我国湖北蚕豆种质资源产量性状的鉴定与评价

[目的]鉴定评价41份非洲地区和我国湖北蚕豆种质资源的产量性状,筛选出产量性状综合表现优良的蚕豆种质资源,为蚕豆种质资源保护及其新品种选育提供理论参考.[方法]从非洲和我国湖北共收集41份蚕豆种质资源,通过相关分析、主成分分析、聚类分析等方法对蚕豆10个产量性状进行综合鉴定及评价.[结果]41份蚕豆种质资源的10个产量性状变异系数均较高,从高到低排序为:单株实荚数(58.09%)>单株重(36.06%)>单株总荚数(33.82%)>百粒重(32.79%)>单果节荚数(31.60%)>荚宽(18.00%)>株高(16.75%)>单株分枝数(16.54%)>荚长(13.20%)>生育日数(2.18%).相关性分析结果表明,百粒重与单株分枝数、荚宽和荚长呈极显著正相关(P<0.01,下同),单株总荚数与单株实荚数、单果节荚数和单株重呈极显著正相关,与荚宽和百粒重分别呈极显著和显著(P<0.05)负相关.主成分分析结果显示,前5个主成分覆盖所有蚕豆资源产量性状,总贡献率达86.753%,综合前5个主成分对应的产量性状,在10个产量性状中,除荚宽外,其余9个产量性状均可作为蚕豆产量鉴定与评价的重要指标.聚类分析结果表明,41份蚕豆种质资源可分为三大类群,其中第I类群以湖北蚕豆为主,包括12份湖北种质和1份埃塞俄比亚种质,占供试种质资源的31.71%;第Ⅱ类群包含8份苏丹种质、5份湖北种质、4份埃及种质和3份埃塞俄比亚种质,占供试种质资源的48.78%;第Ⅲ类群含7份种质包括3份苏丹种质、1份埃塞俄比亚种质和3份埃及种质,占供试种质资源的19.51%.[结论]非洲地区和我国湖北蚕豆种质资源具有丰富的遗传多样性,筛选出的高产种质资源CDAS106、CDSD102和P422823026可应用于高产蚕豆育种.