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[目的]利用生物信息学分析芸薹属作物MS1基因的结构功能,为作物杂种优势利用提供理论参考.[方法]以拟南芥花粉发育关键基因AtMS1为参考序列,通过BLAST比对获得同源基因序列,运用生物信息学方法对其编码氨基酸序列进行预测分析.[结果]从甘蓝型油菜、白菜、甘蓝等芸薹属作物基因组中获得4条同源序列,与AtMS1基因的相似性在88.0%以上,均含有3个外显子,其CDS序列长度均为2004 bp,编码667个氨基酸.4个芸薹属作物MS1蛋白均含有1个植物同源结构域(Plant homeodomain,PHD),属于亲水性不稳定蛋白,定位于细胞核,磷酸化以丝氨酸(Ser)为主,以苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)为辅;二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,其中α-螺旋所占比例最高,在40.00%以上,β-转角所占比例最低,仅为10.00%左右;其三级结构大致相同,均为球状的功能结构域.4个芸薹属作物MS1蛋白和AtMS1蛋白序列的相似性为95.69%.4个芸薹属作物MS1蛋白的PHD结构域序列高度保守,仅有3个位点氨基酸残基存在差异.19个不同植物的MS1同源蛋白聚为两大类,其中琴叶拟南芥、亚麻荠、萝卜的MS1蛋白与4个芸薹属作物MS1蛋白及拟南芥AtMS1蛋白聚为一类,均属于十字花科植物,即MS1蛋白的聚类结果与植物系统分类结果相吻合.[结论]芸薹属作物MS1基因属于PHD-finger基因家族,其序列高度保守,参与调控花粉发育成熟过程. 相似文献
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【目的】克隆砂糖橘精氨酸脱羧酶基因(CrADC),分析其在干旱胁迫下的表达模式,为探究CrADC基因调控多胺合成的抗旱分子机制提供理论参考。【方法】利用RT-PCR技术克隆砂糖橘CrADC基因,采用生物信息学进行蛋白序列及进化分析,利用qPCR检测不同组织和干旱胁迫下的基因相对表达量,并进行植物表达载体构建与烟草遗传转化验证。【结果】砂糖橘CrADC基因全长2262 bp,编码753个氨基酸,含有一个吡哆醛结合域。序列及进化分析显示果树ADC蛋白序列较保守且分为3类,起源于温带的苹果、李、枣、葡萄等8种落叶果树为一个进化分支,起源于热带或亚热带的柑橘、杧果、番木瓜等6种果树属于另一分支。qPCR实验表明,CrADC基因在砂糖橘叶、花、果肉和果皮组织均能表达,但不同时期叶片和果实不同部位的表达量差异显著,干旱胁迫24 h内的基因表达量会逐步上升。转基因实验表明,CrADC基因在烟草根、茎、叶组织中也能稳定表达,转基因系比对照烟草的电导率和丙二醛含量更低,过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性更高,表现出更好的抗旱生理特征。【结论】砂糖橘CrADC序列较保守,起源于亚热带或热带果树的进化分支。Cr... 相似文献
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为探明无籽沙糖桔自交不亲和的分子机制,研究以无籽沙糖桔和普通有籽沙糖桔为试材,克隆了无籽沙糖桔E3泛素连接酶U-box基因,命名为CrU-box基因。该基因的ORF长度为3 150 bp,编码1049aa的蛋白质,无籽沙糖桔和普通有籽沙糖桔的CrU-box基因有4个核苷酸差异,并导致2个位点氨基酸发生改变。植物Ubox蛋白间序列相似性较高,表明其在进化过程中较为保守。基因表达分析表明,CrU-box基因在子房中表达量最高,其授粉后0~96 h表达量逐渐增加,96 h表达量达到最大值,96~168 h表达量逐渐下降。但在授粉后48,72,96 h时间段上,无籽沙糖桔自交授粉后的CrU-box基因表达量远高于异交授粉后表达量。初步推测无籽沙糖桔CrU-box基因突变,以及自交授粉后CrU-box高水平表达可能是导致自交不亲和形成的原因之一。 相似文献
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[目的]研究不同种类、不同生育时期水稻植株细胞壁化学组分变化规律.[方法]应用Van Soest法对普通栽培稻与东乡野生稻在不同生育时期的植株中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)、酸性洗涤木质素(ADL)等含量进行研究.[结果]NDF、ADF、ADL含量的平均值变化范围分别是55.63%~71.70%、31.98%~49.61%、2.68%~5.71%,其中以蜡熟期的东乡野生稻各含量最高,以抽穗期的协青早B各含量最低.在同一生育时期,不同种类水稻的NDF、ADF含量(除抽穗期的NDF)有显著性差异(P<0.05),以东野的含量最高,秀水110其次,以协青早B含量最低.在同一种类水稻中,不同生育时期的水稻NDF、ADF含量差异均达到显著性水平(P<0.05),以抽穗期的含量最低,乳熟期其次,至蜡熟期含量达到最高峰.[结论]籼亚种水稻的NDF、ADF等含量比普通野生稻和粳亚种水稻低,具有一定的秸秆饲料利用价值.籼型水稻若能尽早收割,秸秆配合青贮发酵与酶解等技术可以作为牲畜的有效日粮. 相似文献
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为了解夏秋屋顶菜园高温对菜心种植的影响,以4个耐热性有差异的菜心品种为材料,分析屋顶高温条件和露地对照下菜心产量及农艺性状表现。结果表明,屋顶高温胁迫会导致薹粗、主薹质量等指标表现下降,平均下降幅度为10.85%、14.08%,并引起菜心产量和生物量下降14.15%、18.00%。但不同品种差异较大,‘四九-19’菜心产量与生物量仅下降4.27%、10.76%,与对照差异不显著;而‘特青迟4号’菜心产量与生物量分别下降24.28%、29.27%,与对照差异极显著。株高、薹长、叶片数、叶片宽、叶柄长、叶柄宽等性状指标在屋顶高温胁迫下与对照差异不显著。综合看来,‘四九-19’菜心在屋顶高温胁迫下各性状表现较好,可在夏秋屋顶菜园中推广应用。 相似文献