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为了明确大山樱叶绿体基因组特征及其密码子使用偏好,共筛选53条叶绿体CDS基因序列作为分析对象。使用CodonW 1.4.4等软件对大山樱密码子使用偏好性进行分析。结果表明,大山樱叶绿体基因组GC3含量为28.84%,含量较低;RECU>1的30个密码子中,有29个以A/U结尾;ENC平均值为47.54,证明其密码子偏好性较弱。3种绘图分析结果均表明自然选择对密码子偏好性影响较大。最终确定10个最优密码子,且7个以A/U结尾。基于CDS序列和RSCU值的系统发育分析及聚类分析结果相似,表明密码子偏好性和物种系统发育关系有一定关联。该结果为研究樱亚属植物叶绿体基因组特征及其密码子偏好性提供了相关依据。 相似文献
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钟花樱(Cerasus campanulata)花为红色,花期较早,易与其他种杂交培育出优良品种,因此近年来作为樱属(Cerasus)植物中开发利用前景较大的种系之一而受到广泛关注,然而在品种分类方面的研究工作较少.为补充钟花樱品种分类研究工作,笔者以16个国内钟花樱种系下常见的栽培品种为试材,对其花期及花器官共21个特征性状进行数量分类研究.首先对21个性状指标采用R型聚类分析和主成分分析,根据分析结果去掉相关性和累积贡献率较小的性状指标,再对16个钟花樱品种进行Q型聚类分析.R型聚类分析结果表明,花瓣长与花瓣宽、花瓣宽与花瓣指数相关,其他性状相对独立,各性状选取合理;主成分分析显示,前7个主成分累计贡献率达85.331%,保留相关性和贡献率较大的共6个性状指标进行Q型聚类分析.16个钟花樱品种按花瓣宽、花型大小、花萼长度等性状可分为二大类、三大类和五大类.花瓣宽度、花型大小和花萼长度应作为钟花樱种系品种分类的主要依据,为钟花樱常见观赏品种的梳理和选育提供了参考,拟建立国内钟花樱种系下常见栽培品种的分类体系,同时由于数量性状的不稳定性,品种分类工作需要更广泛地选择表型性状并结合现代分子技术来进行. 相似文献
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福建武夷山野生早樱群落优势种群种间竞争 总被引:1,自引:0,他引:1
为了更好地了解野生早樱Cerasus subhirtella var.ascendens群落优势种种间关系,保护和开发野生早樱这一珍贵木本观花植物,利用群落学研究方法,对福建武夷山野生早樱群落种进行了调查。在野生早樱、木荷Schima superba与青冈栎Cyclobalanoposis glauca为优势树种的群落中,以其优势度为环境容纳量,采用相对优势度求得群落内的种间竞争系数,并用Lotka-Volterra方程研究了该群落中优势树种种间竞争关系。结果表明:在现阶段以野生早樱为优势的群落,经过若干年的群落演替,平衡状态时,野生早樱、木荷与青冈栎的相对优势度分别为28.65%,62.17%和9.18%,表明未来的野生早樱群落仍将由野生早樱、木荷和青冈栎等3种植物共优组成,但木荷将取代野生早樱的优势地位,成为绝对优势种群支配整个群落。建议适度的干扰和开辟林窗,有利于野生早樱的繁衍。表4参18 相似文献
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基于2×2联列表,应用方差比率(VR)、卡方(χ2)检验、联结系数(AC)等指标对野生早樱群落中乔木层10个优势种群的种间联结性进行了研究。结果表明:10个优势乔木种群总体呈负的净关联;x2检验表明仅有4个种对表现为显著正联结,3个种对表现为有一定联结性;VR、χ2检验、AC3个参数计算的结果都较为一致,验证了该群落种对间独立性相对较强、相关性较弱的特点。现阶段,该群落种间联结性较为松散或呈负联结状态,一方面与群落所处次生演替初期有关,另一方面可能与各种群生物学特性有关。研究结果对野生早樱制定合适的保护与利用计划具有一定的科学参考价值。 相似文献
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磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)基因家族的氨基酸结构中存在保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域,对调控植物开花起着至关重要的作用。本研究以染井吉野樱全基因组数据为基础,采用生物信息学方法鉴定出13个PEBP基因,依次命名为PYPEBP1~PYPEBP13,然后进一步分析了家族中各基因结构、理化性质,对PEBP蛋白的亚细胞定位、二级结构以及磷酸化位点进行预测,并构建系统发育树。结果表明,染井吉野樱的PEBP基因家族不同蛋白质序列的长度和特性都存在较大差异;13个染井吉野樱PEBP基因大部分成员含有4个外显子和3个内含子,motif 3、motif 4、motif 5和motif 6是染井吉野樱PEBP基因的特征基序;蛋白的亚细胞定位预测显示,这13个PEBP基因的蛋白分别位于细胞核与细胞质中;蛋白质二级结构分析显示,染井吉野樱PEBP基因的蛋白质二级结构十分相似,PYPEBP5和PYPEBP12蛋白结构中无规则卷曲占比最高,而β-转角比例最低;潜在的磷酸化位点预测分析表明,除PYPEBP3、PYPEBP7、... 相似文献
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武夷山野生早樱群落灌木种群生态位研究 总被引:2,自引:0,他引:2
对福建武夷山野生早樱群落灌木层12个种群进行生态位宽度、生态位重叠和生态位相似性比例的计算与分析的研究结果表明,该群落灌木优势树种中,鹿角杜鹃、柃木、木荷、山矾和交让木具有较大的生态位宽度,分别为0.8425、0.8404、0.7664、0.6969、0.6962和0.9864、0.9759、0.7856、0.6587、0.6565;而青榨槭和野生早樱的生态位宽度值最小,其觑值和Ba值分别为0.5790、0.4611和0.4395、0.3087。 相似文献
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安徽马鞍山城市园林植物群落物种多样性调查 总被引:2,自引:0,他引:2
对马鞍山城市各类型绿地中的园林植物群落进行了调查,共记录维管植物290种(含变种),隶属于198属,95科,并对各绿地类型植物群落优势种群、物种丰富度、物种多样性及群落相异性进行了分析,结果表明:①风景区绿地与其他3个绿地类型群落优势种群组成差异明显;道路绿地与风景区绿地植物群落10种优势种群重要值所占比重较大,分别为75.56%与64.95%,公园绿地与庭院绿地所占比重较小,分别为47.56%和49.79%。②城市不同类型绿地植物群落的物种多样性差异明显,风景区绿地类型其灌木层Simpson与Shannon-Wiener最高,为0.91与2.55,各类型群落物种多样性总体表现为:风景区绿地〉公园绿地〉庭院绿地〉道路绿地;物种多样性与干扰程度呈负相关,受植物配置及群落营造影响明显。③风景区绿地类型与其他绿地类型植物群落物种相异性系数高,以灌木层植物种类成分的相似性最低。 相似文献