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一次分枝角度是构建甘蓝型油菜理想株型的重要性状之一.本研究以分枝角度大的纯系黄花亲本62与分枝角度小的纯系粉花亲本77为亲本构建114个双单倍体(Double Haploid, DH)群体株系,通过基于测序的基因分型(Genotyping by Sequence, GBS)技术简化测序获得单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)数据,考察DH群体一次分枝角度表型,利用一般线性模型(General Linear Model, GLM)进行全基因组关联分析.结果表明：该群体GLM模型检测到8个显著SNP位点都分布在A07染色体,解释了25.21%～35.05%的表型变异.定位区间内分析和注释了49个基因,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析推测甘蓝型油菜一次分枝角度主效基因为编码GH3家族蛋白的BnaA07g01910D基因,此基因负责细胞繁殖扩增可能影响分枝角度表型.该研究结果有助于解析甘蓝型油菜分枝角度的遗传基础和调控机制,为指导分枝角度遗传改良奠定了基础. 相似文献
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【目的】近几年随着观光农业的兴起,花色的选育和改良已成为甘蓝型油菜种质资源鉴定和材料创制的重要研究方向。以甘蓝型油菜黄白花分离F2群体为研究对象,通过二代测序技术,对白花性状基因候选区间定位,开发与白花性状连锁的分子标记,为定位白花候选基因和选育白花新材料提供新思路。【方法】以甘蓝型油菜DH纯系黄花Y05和甘蓝型油菜纯系白花W01杂交,观察F1和F2群体的花色分离,分析白花性状遗传模式。在F2群体中选取30株纯白花和30株纯黄花构建DNA叶片子代池和RNA花瓣子代池,对亲本和DNA叶片子代池进行30×重测序,对RNA花瓣子代池进行5×测序。以法国甘蓝型油菜Darmor-bzh、中双11、Darmor、Tapidor为参考序列,重测序QTL-seq分析流程计算2个DNA子代池的SNP-index和delta(SNP-index)。利用R包画出SNP-index和delta(SNP-index)滑窗分析图,鉴定候选区间。转录组MMAPPR分析流程以法国甘蓝型油菜Darmor-bzh为参考序列,计算SNP频率,ED4(Loess fit)检测峰值和鉴定候选区间。利用MISA进行重复序列鉴定,... 相似文献
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