High-Quality de novo Genome Assembly of Huajingxian 74, a Receptor Parent of Single Segment Substitution Lines

Rice(Oryza sativa L.)is grown nearly worldwide and provides the staple food for more than half of the global population(Luo et al,2017).The genomes of several cultivated rice varieties including Nipponbare(NPB)(Kawahara et al,2013;Sakai et al,2013),IR64(Tanaka et al,2020),93-11(Zhang et al,2018)and R498(Du et al,2017)at chromosome level,and Minghui 63 and Zhenshan 97(Zhang et al,2016)at scaffold level have been assembled,annotated and released,among which the R498 and NPB genomes are widely used as reference genomes in rice research.However,there are thousands of rice cultivars,landraces and wild rice varieties in the world with dramatically different genetic backgrounds,and the genomes of native rice varieties in South China,which is one of the major rice production areas in China,have not been de novo assembled.Huajingxian 74(HJX74)is an indica rice variety bred in South China Agricultural University,Guangdong Province with widely environmental adaptability and high yield(www.ricedata.cn/variety/varis/602548.htm).HJX74 exhibits significant phenotypic and genetic differences from those varieties whose whole genomes have been properly sequenced and assembled(Fig.1).     

大豆耐低磷胁迫研究进展

磷是作物生长发育不可缺少的营养元素之一,但它在土壤中有效性是非常低的.缺磷是限制目前农业产量的一个重要因子,传统的农业生产主要通过施肥和土壤改良来满足植物对磷的需求,近年来人们开始发掘磷高效利用植物来替代传统方法提高磷的利用效率.在缺磷胁迫下,植物会产生一系列的包括根系形态及生理方面的适应性变化.本文综述了低磷胁迫对大豆根系、光合作用等影响的研究进展,大豆耐低磷胁迫的遗传学研究进展,以及讨论当前大豆磷效率遗传研究中存在的主要问题.     

Efficacy of different dosages of ivermectin injectable against the Hypoderma spp. in yaks

A chemotherapy trial was conducted to determine the lowest dosage of injectable preparation of ivermectin against Hypoderma spp. infestation in yaks in Tibetan areas in Tianzhu county, Gansu province, in northwest of China. One hundred and sixty yaks were randomly divided into four groups of 40 yaks for the trial. The first three groups were treated by subcutaneous injection in the neck with 0.1% ivermectin (respectively, 1, 5, 10 microg/kg body weight). The fourth group was not treated and considered as control group. All the experiments were performed in November 2000 and the animals were examined for the presence of warbles in the next March and May. The results indicated that there was no warbles found on the back of treated animal while third stage larvae were palpated on back of some of the yaks in control group. It is concluded that dosage of 1 microg/kg ivermectin injectable was sufficient to kill or stop development of larvae of Hypoderma spp. in naturally infected yaks if administrated in November.     

基于转录组数据分析环形泰勒虫对诱导宿主细胞转化相关基因的影响

本试验主要通过研究布帕伐醌(BW720)处理前后,环形泰勒虫转化牛单核细胞(TaNM Ⅰ)转录组数据的变化情况,为进一步研究环形泰勒虫诱导宿主细胞转化的分子机制奠定基础。以环形泰勒虫感染的牛单核细胞为试验材料,设置对照组(二甲基亚砜,DMSO)和试验组(BW720),利用Illumina HiSeq4000测序平台进行高通量测序,将测序得到的原始数据(Raw reads)与GenBank和Rfam数据库进行比对过滤,通过质控获得最终数据(Clean read)。利用Venn分析软件筛选出DMSO组和BW720组中差异表达明显的基因,进行功能注释(GO)以及信号通路(KEGG)分析。随机选择10个基因,利用荧光定量PCR (qPCR)检测基因在不同处理条件下细胞中的表达量。在验证测序结果的准确性后,选出差异表达明显的基因,分析其在TaNM Ⅰ细胞的凋亡、增殖等信号通路方面的作用。结果显示：BW720组和DMSO组中分别得到6 854 019 704和6 627 265 854条Raw reads,过滤、质控后分别得到22 925 606和22 171 427条Clean reads。BW720组和DMSO组中筛选出差异表达明显的基因共计4 054个(P＜0.05),其中,2 146个基因显著上调,1 908个基因显著下调;进一步筛选出共同差异表达的基因367个,其中,显著上调的196个,显著下调的171个。同时,qPCR验证随机选择10个基因的表达趋势与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。然后对差异表达基因进行GO功能注释,筛选到与细胞增殖相关的20个生物学过程、15个细胞组分以及11个分子功能条目。KEGG富集分析结果显示,在Top20的信号通路中筛选出与环形泰勒虫转化细胞有关的一些信号通路,如：癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。对这些信号通路进一步分析发现：PI3KR3、FOXO1、IL23A、FZD3、AKT、MMP9等基因在环形泰勒虫转化细胞的研究中也有相关文献的报道。本研究表明,在TaNM Ⅰ细胞中DAPK1、FZD3、FOXO3、PI3KR3等可能在感染细胞无限增殖的过程中发挥作用,为后续研究TaNM Ⅰ细胞无限增殖机制奠定了基础。     

基于单片段代换系的水稻抽穗期QTL上位性研究

【目的】探索水稻抽穗期的遗传机制.【方法】以华粳籼74的8个单片段代换系为材料,构建了7个聚合了双QTL的次级F2作图群体,并通过分子标记的选择区分出每个群体的9种基因型以估算水稻抽穗期QTL的各类上位性分量.【结果和结论】除QTL HD3/HD8间的上位性互作不显著外,其他QTL对均存在显著的上位性效应,占85.7%;在检测的28个不同类型的上位性效应中,有60.7%的估计值达到5%或1%的显著水平,其中加加、加显或显加、显显上位性分别占71.3%、42.8%、85.6%.研究结果进一步证实了上位性作用在数量性状遗传体系中的普遍性和重要性,并为水稻抽穗期的分子聚合育种提供了依据和材料.     

网络攻防技术综述

随着互联网络技术的发展,在享受网络带来方便、快捷的服务的同时,还需要防备网络的攻击,以保证网络的安全运行。     

晋旱125×（昔野×501）大豆群体同工酶研究及聚类分析

选用晋旱125×(昔野×501)大豆杂交组合的后代群体选育的较稳定的四个有代表性的特殊类型为实验材料,对双亲及子代不同类型品种的POD酶和酯酶进行电泳分析,发现POD酶和酯酶谱存在明显差异,2种同工酶的酶带数分别为21和24条。同时采用DPS数据分析软件对这两类酶带谱进行聚类分析。最终从聚类树状图上根据遗传距离将亲本与子代清晰区别开来,结果显示:在POD酶和酯酶的聚类图上6个品种均被聚为两类,子代在遗传距离上偏向于母本晋旱125。     

薏苡×川谷远缘杂交的研究

本文报道了薏苡×川谷的远缘杂交,经8年选择,获得了两个较稳定的杂种新品系,即85-15和85-18。百粒重分别为14.4g、15.9g。亩产分别为503.5kg、573.8kg。具有较强的抗黑穗病,叶枯病和耐寒能力,可以在生产上推广应用。     

晋旱125×（昔野×501）大豆群体同工酶研究及聚类分析

选用晋旱125×(昔野×501)大豆杂交组合的后代群体选育的较稳定的四个有代表性的特殊类型为实验材料,对双亲及子代不同类型品种的POD酶和酯酶进行电泳分析,发现POD酶和酯酶谱存在明显差异,2种同工酶的酶带数分别为21和24条。同时采用DPS数据分析软件对这两类酶带谱进行聚类分析。最终从聚类树状图上根据遗传距离将亲本与子代清晰区别开来,结果显示:在POD酶和酯酶的聚类图上6个品种均被聚为两类,子代在遗传距离上偏向于母本晋旱125。