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利用DNA序列分析技术对我国浙江、福建和重庆3个地区的肾形肾状线虫(Rotylenchulus reniformis,RN)种内群体及群体内个体间核糖体RNA基因(rDNA)内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列进行PCR扩增及序列变异分析。结果显示不同的群体间均获得2种PCR产物,标记为变异类型Ⅰ(RN_VAR1)和变异类型Ⅱ(RN_VAR2)。基于每个群体内2条雌虫分别挑取各变异类型的5个克隆测序,共得到60个克隆序列。经序列比对分析,发现肾形肾状线虫rDNA基因2种类型的ITS区变异很大,其中变异类型Ⅰ序列长度为705~712bp,鸟嘌呤和胞嘧啶(guanine and cytosine content,GC)含量为45.1%~46.7%;变异类型Ⅱ序列长度为854~860bp,GC含量为48.4%~50.0%。2种类型的ITS相似度(包括5.8SRNA基因)仅为62.1%~65.6%,而各rDNA变异类型内部各个克隆序列也存在差异,变异类型Ⅰ内个体间相似度为89.9%~100%;变异类型Ⅱ内个体间相似度为91.4%~99.8%。系统进化分析表明2种变异序列明显分成2支,同时通过ITS序列分析无法将3个地方群体区分开来。经实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测发现RN_VAR1含量稍大于RN_VAR2,分别占保守18S基因的rDNA重复单位含量的56%和40%。同时,还发现肾形肾状线虫的2种rDNA-ITS变异类型与已报道的2种18SRNA基因变异类型相对应,表明肾形肾状线虫存在2种rDNA变异类型。 相似文献
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本文记述了从浙江省和湖北省落叶树根围采集的隶属于长针线虫属的中国2新记录种——Longidorus pius和L.diadecturus,通过修订的LoofChen(1999)多岐检索表确认,其鉴定代码分别为A56-B4-C3-D1-E1-F3-G1-H1-I1和A4-B23-C5-D3-F2-G2-H1-I1。L.pius的主要形态学特征为:体长中等(4.7~6.3 mm),虫体前端明显变细,唇区圆滑,与体驱间无缢缩,齿针长(130~143μm),尾短而圆。L.diadecturus的主要鉴别特征为:体长较短(3.2~4.6 mm),齿针长(108~120μm),导环位置相对靠后(至唇端距离为33~38μm),唇区宽,阴门的位置相对靠前等。系统发育研究表明:来自中国的L.pius r DNA中ITS1区序列与来自马其顿的模式种L.pius群体相应序列(AM743178)处于同一进化枝中,置信度达99%;L.diadecturus与来自加拿大的模式种L.diadecturus群体相应序列(AF511416)处于同一进化枝中,置信度也达99%。另外,来自中国的L.diadecturus 28S区序列与模式种L.diadecturus的序列(AY601584)处于同一进化枝中,置信度达99%,而L.pius和L.raskii(AJ549983)、Longidorus sp.FDL-2011(FR775757)属于同一分枝。L.pius和L.diadecturus这2个种在中国均系首次报道,本文提供了详细的形态学描述及系统发育关系的有关信息。 相似文献
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肾形肾状线虫(Rotylenchulus reniformis)是一种植物半内寄生线虫,分布于世界的热带和亚热带地区,是许多蔬菜和热带果树重要的病原线虫.为明确该线虫种内群体的遗传变异,本研究采用序列分析法,对采自浙江(ZJ)、福建(FJ)和重庆(CQ)3个地区的肾形肾状线虫的线粒体COII-LrRNA基因序列进行比较.结果表明,肾形肾状线虫线粒体COII-LrRNA基因片段序列为557～563 bp,AT含量为85.5％,明显高于GC含量.序列分析所得3个群体总的变异位点数、单倍型数、单倍型多样性指数(haplotype diversity,Hd)和核苷酸多样性指数(nucleotide diversity,π)分别为176、40、0.946和0.157 4.分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)结果显示,这3个肾形肾状线虫群体间遗传分化系数为0.058 15,遗传分化程度中等,没有明显的地理隔离.遗传变异结果显示,94.18％的变异来自群体内个体间,只有5.82％的变异发生在群体间.结果说明,我国肾形肾状线虫种群内COII-LrRNA基因序列变异较明显,具有丰富的遗传多样性,且对环境变化的适应能力较强.研究结果丰富了我国肾形肾状线虫的系统发育信息,为肾形肾状线虫危害植物的内在遗传因素的研究提供了资料. 相似文献
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