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1.
香菇EST-SSR引物筛选   总被引:5,自引:0,他引:5  
SSR标记在病原菌中的应用较多,而在食用蕈菌中的应用少见。Barroso et al.(2000)首次报道了双孢蘑菇(Agaricus bisporus)及侧耳(Pleurotus spp.)中存在(TATG)n基序;秦莲花  相似文献   
2.
从真菌基因组计划网站(FGP)和NCBI网站数据库下载了总长度为8.1Mb的11150条香菇的EST(包括香菇的10条cDNA)序列,通过SSRhunter 1.3软件结合手工查找,从中发现2.83%即316条EST含有一共469个SSR.,平均每17.3kb出现一个EST-SSR。在所有EST-SSR中,三碱基和六碱基SSR出现最多,分别占EST-SSR总数的38.00%和20.00%,出现较多的基元为(A)n、(T)n、(GA)n、(AG)n、(TGA)n、(GAT)n和(TCTTT)n,占所有EST-SSR的35.39%。利用Oligo 6.0软件设计了51对EST-SSR引物,并选用其它物种的24对引物,对香菇菌株进行了PCR扩增。实验结果表明,设计的51对引物有39对具有明显的扩增产物,选用的其它物种的24对引物均没有清晰可见的特异性扩增产物。部分有扩增产物的EST-SSR引物具有多态性。  相似文献   
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