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霍山石斛叶转录组中SSR位点信息分析 总被引：1，自引：0，他引：1
开发霍山石斛简单重复序列(SSR)分子标记,为霍山石斛遗传多样性和种质资源鉴定的研究提供技术支撑。利用Illumina HiSeq X10平台对霍山石斛叶片进行转录组测序,Microsatellite(MISA)软件分析霍山石斛转录组SSR的分布频率和重复基元的类型特征,软件Primer 5设计引物。从202080条Unigene中搜到43291个SSR位点,分布在36382条Unigene序列中,发生频率为18.00%,平均每6.08 kb含1个SSR位点,共有463种重复基元,单核苷酸重复占主要地位,发生频率为47.62%,在所有重复基元中,A/T出现频率最高(47.06%)。试验共获得13960条SSR引物。 相似文献
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文章以一年生铁皮石斛苗为试验材料,研究不同浓度(0.01mmol/L、0.05mmol/L、0.10mmol/L、0.15mmol/L)硝普钠(SNP)对低温胁迫(0℃,12h)下铁皮石斛(Dendrobium officinale)叶片抗氧化酶活性及基因表达的影响,旨在探讨外源NO与铁皮石斛抗冷性的关系。结果表明,低温胁迫下,0.10mmol/LSNP处理铁皮石斛,叶片SOD、CAT、POD活性与对照组相比显著增加,MDA含量和相对电导率显著降低。叶片SOD、CAT、POD基因表达荧光定量PCR分析发现,低温胁迫下0.10mmol/LSNP处理铁皮石斛,上调叶片SOD、CAT、POD基因表达,3基因的表达模式存在差异。外源NO处理可以上调SOD、CAT、POD表达,增强SOD、CAT、POD活性,有利于缓解铁皮石斛低温胁迫。 相似文献
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