芋全长转录组测序分析及淀粉生物合成相关基因挖掘

【目的】获取芋(Colocasia esculenta)全长转录本序列和结构信息,并挖掘淀粉生物合成相关基因和转录本的结构信息,为后续阐明芋淀粉生物合成的分子机制及深入利用芋基因资源提供科学依据。【方法】以荔浦芋1号为试材,采集其3月龄植株的不同组织(叶片、叶柄、球茎、匍匐茎和根)开展混合样三代全长转录组测序,对获得的转录本进行功能注释,通过生物信息学方法分析转录本可变剪接(AS)、可变多聚腺苷酸化(APA)、长链非编码RNA(lncRNA)、转录因子(TF)和简单重复序列(SSR)等的结构信息,通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)注释获得芋淀粉生物合成相关的基因和转录本,并对其进行AS和APA分析。【结果】通过对芋叶片、叶柄、球茎、匍匐茎和根混合样开展三代全长转录组测序,共获得全长转录本序列38 043条;通过与参考基因组进行比对,鉴定出新转录本31 058条,其中28 785条获得功能注释;通过对转录本结构分析,共鉴定出9360个AS事件、6436个基因存在poly(A)位点、25 081个SSR位点、304个lncRNA、1911个融合转录本和1608个TF。通过KEGG注释...     

茎尖组织培养提高荔浦芋产量和品质的应用效果

荔浦芋是荔浦县名特优传统产品,种植已有340多a的历史.1998年以来,荔浦县精心挑选在品质、形状等各项指标最符合荔浦芋特征的种芋进行茎尖组织培养,保持了荔浦芋原有的品味,提高了荔浦芋的生长势、抗病性、产量和品质,品种优势保持3～4 a.     

广西槟榔芋水田轻简化高效栽培技术

广西槟榔芋产区综合应用全田配方施肥 和高畦覆膜免培土技术，减少了后期除草、追 肥和培土3 个环节，较常规栽培每667 m² 节 约人工成本500 元，增产10% 以上，且槟榔 芋品质优异，已成为广西槟榔芋的主要栽培 模式。     

荔浦县荸荠组培苗产业化的形成及发展意义

荔浦县荸荠组培苗产业化的形成有力推动了当地荸荠产业的健康发展,回顾了荔浦县荸荠组培苗产业化的形成及发展过程,对荔浦县荸荠组培苗产业化发展进行了可行性分析,并对产业化的效益进行了分析。     

荸荠淀粉合成酶AGPase的基因克隆及表达分析

[目的]克隆荸荠ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因EdAPS1的cDNA序列,并分析其序列特征及其在荸荠不同组织和球茎发育过程中的表达情况,为研究荸荠淀粉生物合成机制提供理论依据.[方法]通过RT-PCR技术从荸荠球茎中克隆EdAPS1基因的cDNA序列,采用生物信息学方法对其序列和所编码的蛋白进行预测...     

桂芋2号荔浦芋新品种主要病虫害综合防控技术

正荔浦芋是最优秀的槟榔芋品种之一,因产于荔浦而得名,至今已有340多a的历史。基于独特的自然条件和土壤优势,以及荔浦农人数百年的智慧结晶形成的整套独特栽培管理方法,荔浦产出的荔浦芋因具有香、酥、粉、糯、甜、软、鲜的特殊风味而久负盛名,在历史上一度成为皇室贡品,荔浦县因此被冠以"荔浦芋之乡"美称,先后获得广西首个产地证明商标、农业部地理标志、中国百强农产品区域公用品牌及入选2017全国名特优新农产品目录等荣誉。     

芋组培苗浅水育苗及健康种芋夏繁技术

利用芋组培苗浅水育苗技术育苗,省去追肥、除草等环节,每667 m2减少人工成本500元,组培苗成活率从85.5%提高到99.6%,出圃周期从75 d缩短至50 d。利用健康种芋夏繁技术繁殖种芋,同时采用地膜覆盖、水肥一体化膜下滴灌设施,达到节水节肥和省工的轻简化种芋繁育,繁育周期从8个月缩短至5个月,提高了土地利用效率。     

芋不同组织淀粉生物合成和代谢相关基因的差异表达分析

【目的】开展芋（Colocasia esculenta）不同组织的转录组试验,为芋基因功能和代谢调控网络的分子机制研究提供基因资源。【方法】采集播种90 d的荔浦芋1号芋球茎、叶片、叶柄和根进行生理检测和转录组测序,对不同组织的差异表达基因（DEGs）进行GO和KEGG功能富集分析,并对淀粉生物合成和代谢相关基因进行发掘和表达模式分析。【结果】芋球茎的淀粉和可溶性糖含量分别为134.85和23.92 mg/g,在4种组织中含量最高。转录组测序共获得85.41 Gb Clean data,与参考基因组比对效率为90.30%～92.56%,共33828个基因获得功能注释。不同组织间DEGs数量为5625～10562个。球茎与根、叶片和叶柄的比较组中,在生物过程中分别富集到与淀粉生物合成和代谢相关的GO功能2、5和5个;KEGG富集分析显示,在淀粉和蔗糖代谢途径分别富集到146、161和126个DEGs。通过富集分析发掘涉及淀粉生物合成和代谢相关DEGs共82个,其在4种组织中呈不同表达模式,其中ADP-葡萄糖焦磷酸化酶基因（AGPase基因）（Taro＿004018和Taro＿026553...     

荔浦芋密植高产套种技术

荔浦芋密植高产套种技术邱祖杨韦照新吕超燕（广西荔浦县农业局５４６６００）荔浦芋是槟榔芋中目前最优良的品种之一，也是广西荔浦县的著名特产，以风味独特、香、甜、粉而成为历代皇朝贡品。同时作为我国传统的出口产品，在港、澳、台地区及东南亚各国享有盛名。目前广...     

桂林市荔浦县农产品质量安全监管现状与对策

从桂林市荔浦县农产品质量安全监管的法律法规保障、农产品安全检测等方面调查,发现存在农业环境污染、农产品质量得不到保障、农产品生产经营主体众多、标准化水平不高等问题,提出了完善细化法律、政策、制度,健全农产品安全监管综合协调制度、壮大农业执法、检测等农产品质量监管队伍,增强硬件设备建设,提升监管能力等措施。