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本研究以500份东北春播区糜子资源为材料,利用169个SSR标记,采用UPGMA聚类分组,进行分层抽样,构建核心种质,同时应用ID Analysis 4.0软件构建分子身份证。利用等位基因数(Na)等遗传多样性衡量指标评估核心种质的遗传差异,并利用PCOA分析核心种质。结果表明,对169对SSR引物进行筛选,发现30对多态性好,利用30对SSR引物构建的糜子核心种质包含190份材料,占全部种质的38%,全部种质与核心种质的均检测出91个等位变异,保留了100%等位基因;有效等位基因数为2.2977～2.9975和2.2872～3.0173,平均值分别为2.8198和2.8297;Shannon多样性指数为0.9532～1.0990和0.9535～1.1162,平均值为1.0645和1.0667;观测杂合度为0.3434～0.8037和0.3162～0.7849,平均值为0.5399和0.5359;期望杂合度为0.5654～0.6672和0.5645～0.6707,平均值为0.6448和0.6473;Nei’s基因多样性指数为0.5648～0.6664和0.5628～0.6686,平均值... 相似文献
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糜子为禾本科草本植物，抗旱、耐盐碱、耐瘠、生育期短。为了给糜子抗逆分子育种提供候选基因，试验在前期转录组测序注释基因的基础上，利用糜子基因组染色体16上注释的NAC蛋白结构域比对得到PmNAC1基因的gDNA序列，通过PCR扩增、基因克隆获得糜子的核苷酸序列，使用在线软件ORF Finder Blast对糜子NAC编码蛋白的理化特性及结构等进行生物信息学分析。结果表明，PmNAC1基因全长1 634 bp，编码423个氨基酸，无信号肽和跨膜结构；二级结构中氨基酸主要由8个α-螺旋和14个β-折叠组成，为亲水性蛋白，保守位点在第73～211位氨基酸，共有59个磷酸化位点；超出水平线0.5的是糖基化位点；构建了糜子转录因子NAC氨基酸序列系统发育进化树，PmNAC1蛋白与柳枝稷CUC2的亲缘关系最近，二者的遗传变异系数为0.06。 相似文献
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