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为揭示短节间番茄的基因变异类型及基因变异对代谢通路的影响,以短节间番茄品系CH和普通节间长度番茄品系DH进行农艺性状分析以及全基因组重测序,对单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)、小片段插入和缺失(insertion-deletion, InDel)、拷贝数变异(copy number variation, CNV)及染色体结构变异(structural variation, SV)4种变异类型进行检测注释。结果表明,在2个样本中共检测到1 086 531个SNP、277 973个InDel、25 797个CNV、33 516个SV,在代谢通路中主要集中于吲哚生物碱生物合成、二萜生物合成、莽草酸途径生物碱的生物合成中发现。以SNP以及InDel中的基因作为切入点,挖掘到3个变异基因,其在CH中的相对表达量均低于DH。研究结果明确了变异位点信息,为进一步明确调控番茄节间长度相关基因的研究奠定了基础。 相似文献
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自封顶类型番茄品种产量与主茎花序数有密切关系,关于控制花序封顶性状基因的研究报道较多,而对控制番茄封顶花序节位的相关研究报道较少。为研究不同自封顶番茄主茎封顶花序节位之间的遗传变异,筛选出参与调控主茎封顶花序节位相关的候选基因。本试验利用重测序技术对3个番茄品系GXF、AXF和815进行变异检测。结果表明,3个样本共检测到5 968 501个SNP和485 114个InDel,与参考基因组比对后共发生33 473个基因变异,将发生在CDS区的变异基因进行GO和KEGG数据库比对,发现主要集中于基础代谢和玉米素的生物合成。通过基因组序列比对分析,筛选获得16个可能是参与调控番茄主茎封顶花序节位的关键基因。研究结果明确了相关基因的变异位点信息,为进一步研究自封顶番茄花序节位的遗传机理奠定了基础。 相似文献
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研究番茄单果重的遗传规律,为番茄育种提供参考.以黄果番茄品系DH(大果型)、CH(小果型)作为亲本,构建6个世代群体(P1、P2、F1、B1、B2、F2),F2代群体单果重性状的分离世代呈偏正态分布,应用植物数量性状主基因-多基因混合遗传模型进行多世代联合分析.结果表明,单果重性状的遗传模型为2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因(MX2-ADI-ADI);单果重性状主要由2对主基因遗传控制,表现为加性和显性效应,单果重性状以基因的加性效应为主;B1、B2、F2分离世代单果重性状主基因的遗传率(h2mg)分别为60.83%、0.6%、42.81%;B1、B2、F2分离世代单果重的多基因遗传率(h2pg)为0~72.15%,环境方差占表型方差(δ2e/δ2p)为27.74%~57.19%.因此,单果重性状较易受环境影响,所以宜选择晚世代进行,在栽培中更应注意肥水等环境条件的影响. 相似文献
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