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刺槐Na+/H+逆向转运蛋白RpNHX1基因的分离和生物信息学分析 总被引:1,自引:0,他引:1
盐分胁迫严重影响植物生长和产量.为了研究木本植物对盐分的适应性,利用5'RACE技术,从刺槐中克隆得到液泡Na /H 逆向转运蛋白基因RpNHX1.该基因长度为2 281 bp,含有一个开放阅读框,编码535氨基酸残基组成的蛋白,该蛋白序列与大豆GmNHX1和拟南芥AtNHX1相似,氨基酸的同源性分别达85%和69%,RpNHX1属于NHX亚族的NHX-I分枝.用生物信息学的方法预测RpNHX1具有所有Na /H 逆向转运蛋白共同的结构特点,即含有疏水的N末端,10个跨膜螺旋区域和一个具有调节功能的C端亲水区域,其中氨氯吡嗪咪敏感基序和CaM结合域也是保守的.在4和5的螺旋区域之间,存在有一串带负电荷氨基酸,显示出有规律的排列模式,这些模式在生物界中的Na /H 转运蛋白中是保守的.结合亲疏水资料,我们认为Na /H 转运通道结构可能存在于这一区域.另外,也分析了RpNHX1可能的糖基化、酰基化和磷酸化位点.从这些数据中可以看出,RpNHX1可能在细胞中起到Na 区隔化作用. 相似文献
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设施栽培与露地栽培不同,它是在半封闭的环境条件下进行的栽培、施肥管理,并在不大的土壤容量内布满大量的根系,需要吸收大量的养分,因此,它比在露地栽培要求更高的营养条件.设施栽培大多是进行高度集约和轮作生产,以特定的肥料为主,施肥量大.每茬所施的肥料由于在设施内,没有雨水的淋溶,土壤理化性状及微生物组成均发生显著变化,除灌水外土壤中的水分大多是由下而上地运动,土壤耕作层容易形成高浓度的盐类危害,使作物生育受到阻碍,以至造成产量降低. 相似文献
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一个属于Aux/IAA基因家族的毛白杨PtIAA1的克隆和序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
基于NCBI数据库中的序列信息,我们利用PCR技术克隆到一个毛白杨(Populus tomentosa)RtIAAl基因.序列分析表明PtIAA1 cDNA长度为946个碱基,编码一个由258个氨基酸组成的蛋白,该蛋白与PtIAA1、NtIAA28和AtIAA16蛋白的同源性分别高达97%、75%和74%.系统进化分析表明PtIAA1基因可能属于Aux/IAA基因家族中组的成员.与大多数的Aux/IAA基因家族中的基因一样,PtIAA1蛋白是一个短命核蛋白,拥有4个高度保守的区域. 相似文献
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