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【目的】中国特有的野生牡丹一直被国内外视为珍贵的种质资源。野生矮牡丹被认为是现代栽培牡丹品种重要的祖先种之一,开展矮牡丹在内的芍药属植物叶绿体基因组(cp DNA)特征分析对阐明牡丹系统进化、培育和改良栽培品种具有重要的理论与实践价值。【方法】在矮牡丹叶绿体高通量测序的基础上,从NCBI数据库下载凤丹牡丹、大花黄牡丹、滇牡丹、川赤芍和草芍药的cp DNA数据,利用Geneious 8. 0、EMBOSS 6. 4. 0等软件,对芍药属6个种的cp DNA进行对比分析。【结果】矮牡丹cp DNA序列共152 628 bp,共有112个基因,使用25 988个密码子,编码蛋白78个;有19个基因(包括4个rRNA、7个tRNA、8个蛋白编码基因)在IR(反向重复)区重复。共搜索到143个SSR位点,单核苷酸重复基序位点最多,为116个(占81. 12%),没有六核苷酸重复基序。尽管芍药属叶绿体基因组比较保守,但不同种间IR和LSC(大单拷贝区)的边界位置仍有一定变化,凤丹牡丹LSC/IR的rpl2基因有718 bp延伸至LSC区域,而其他种的rpl2基因均完整地位于IR区。【结论】从基因组大小和基因内容来看,芍药属cp DNA高度保守;草芍药与滇牡丹cp DNA最大,为152 698 bp;凤丹牡丹cp DNA最小,为152 153bp。矮牡丹cp DNA蛋白编码基因密码子偏好使用A/T碱基,SSRs位点的碱基组成也偏好使用A/T碱基,143个SSRs位点中,A/T组成的位点有134个;矮牡丹cp DNA SSRs分布具有不均匀性,14个SSR位点位于IR区段,103个位于LSC区段,26个位于SSC区段。IR边界分析显示,芍药属LSC/IRb的边界变化是IR区扩张与收缩的主要原因。研究结果为芍药属植物的系统进化与栽培起源等研究提供支持,对芍药属植物分子标记开发及优良品种选育具有参考价值。 相似文献
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水稻根尖质膜蛋白质组学研究方法的建立 总被引:2,自引:0,他引:2
以徐稻3号水稻苗期幼嫩根尖为材料,利用葡聚糖/聚乙二醇两相分配法纯化得到纯度达 90% 的质膜组分,使用优化的双向电泳水化液溶解质膜蛋白,通过等电聚焦/十二烷基磺酸钠 聚丙烯酰胺凝胶双向电泳 (IEF/SDS PAGE)分离和基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MALDI TOF/TOF)分析,鉴定了31个水稻质膜相关蛋白。结果表明IEF/SDS PAGE 双向电泳适合分离亲水性相对较高的膜附着蛋白。进一步利用高盐和温和去污剂对纯化的质膜进行洗涤,以降低质膜组分的复杂程度,通过 SDS PAGE 单向电泳分离和液相色谱串联质谱(LC MS/MS)分析,鉴定了 8个质膜蛋白。经洗涤后的质膜组分复杂度显著降低,SDS PAGE 中的蛋白条带只包含1~2 种蛋白,且主要为疏水性较强的穿膜蛋白,说明多种生物化学分离方法及不同质谱分析的综合运用,是解决生物膜蛋白质组学难点的有效途径。 相似文献
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用5种不同浓度(0、0.05、0.10、0.20、0.30 mg/L)的天然油菜素内酯(NBR)溶液分别浸泡黄豆、绿豆种子,结果表明,天然油菜素内酯(NBR)处理可以提高黄豆、绿豆的发芽率、轴根比,并能促进芽苗的生长,其中0.05 mg/L浓度处理的黄豆种子发芽率最高,比对照组提高了25.0百分点,芽长增加了4.33 cm;0.30 mg/L浓度处理在促进绿豆种子发芽率和芽苗的生长方面效果最为明显,发芽率提高了18.3百分点,芽长增加了7.29 cm;0.05 mg/L浓度处理的黄豆、绿豆芽苗的轴根比均达到最大,分别为2.96、1.43。 相似文献
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饲料粗蛋白含量分析方法比较 总被引:2,自引:1,他引:1
本文利用3种仪器设备,PE2400N元素分析仪、凯氏氮/蛋白质测定仪、凯氏定氮仪(国标法)对13种饲料原料和2种配合饲料样品的粗蛋白含量进行了分析测试,旨在探讨3种分析测试方法的测量误差,以检验各设备在饲料生产质量控制中的作用。经统计分析,发现这3种方法的测定结果无显著差异。另外,与国标法相比,PE2400N元素分析仪自动化程度较高,具有快速、精确、省时省力等特点,值得提倡;凯氏氮/蛋白质测定仪体积小,重量轻,省工省力,样品不转移,测试数据准确,价格低廉,适合我国国情,具有推广价值。 相似文献
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