Polymorphism analysis of microsatellites and construction of linkage map in part regions of four chromosomes in chicken

Based on chicken' consensus map issued in 2000,17 microsatellites near 4 candidate genes such as IGF2,OBR,GDF8 and APOA1 in 4 chromosomes(chromosome 5,7,8 and 24)were chosen for polymorphism analysis and construction of linkage map.Combining the technique of PCR and the fluorescent semi-automated detection,genome scanning was performed for 440 chickens,which was derived from China Agricultural University chicken resource families within three generations.The individuals of this resource families were genotyped.The results showed that the number of alleles ranged from 4 to 14;heterozygosity(H) of markers was between 0.3116 and 0.9148.Polymorphic information content(PIC)varied from 0.2672 to 0.8679.Microsatellites along with above-mentioned 4 candidate genes doing as general markers were used to construct linkage map.The spans of 4 linkage maps constructed in the part region of chromosome 5,7,8 and 24 were 263.5,79.9,206.2 and 104.2 cM,respectively.The order of markers was consistent with that of counterpart of reported consensus map.However,The spans of linkage map were larger than that of consensus map.The constructed linkage maps laid the foundation for mapping quantitative trait loci(QTL)responsible for economically important traits in chicken.     

黄瓜作图亲本间分子标记的多态性分析

利用AFLP,SRAP和SSR3种不同类型的分子标记技术,研究了作图亲本F-3与HZL04-1间的多态性。结果表明,这3种标记技术多态性检测效率不同,其中,AFLP揭示作图亲本间多态性效率最高,SRAP次之,SSR多态性检测效率最低。选择高效揭示多态性的分子标记技术是提高黄瓜遗传图谱构建效率的关键。分析探讨了几种分子标记技术的优缺点,认为应用AFLP,SRAP构建黄瓜遗传图谱为最佳,SSR可以作为补充的标记。     

玉米重组自交系群体遗传图谱的构建及标记

以黄早四和Mo 17为亲本,组建了含239份重组自交系的F9代分离群体.共选取了370对SSR引物用于亲本多态性筛选,结果有126对引物能扩增出清晰的多态性条带.用这些有多态性的引物进一步作群体分析,除有23对引物扩增效果较差外,其余引物在多态性、重复性方面均表现较好.最后,用该重组自交系群体构建了玉米分子标记遗传连锁图谱,该图谱拟合了103个分布于10个连锁群的微卫星标记位点,覆盖玉米整个基因组1 455.4 cM,标记间平均图距14.1 cM.     

合浦珠母贝印度家系F↓（1）代的AFLP分析

用AFLP标记对合浦珠母贝(Pinctada fucata)印度家系的亲本及其子一代(F1)进行了遗传分析。27对引物共扩增出1 013个位点,其中835个位点在F1代分离,178个位点不分离,多态位点比例82.4%。分离位点中,符合孟德尔分离规律的位点458个,占分离位点数的54.9%。偏孟德尔分离规律的位点377个,占分离位点数的45.1%。分离比为3∶1的位点共有482个,占分离位点数的57.7%,符合孟德尔分离规律的位点251个,占52.1%(占分离位点数的30.1%);分离比为1∶1的位点共有353个,占分离位点数的42.3%,符合孟德尔规律的位点207个,占58.6%(占分离位点数的24.8%)。半数以上的标记符合孟德尔遗传规律。表明AFLP标记适合于合浦珠母贝的遗传图谱构建。[中国水产科学,2007,14(1):52-58]     

作物生产地图点符号系统的创建与应用

基于AutoCAD 2010软件,本文研究与开发了生动形象、辨识度高、与作物生产相关的地图点符号系统。该点符号系统可用以表达作物生产相关的地理要素空间位置、分布特点以及质量和数量特征等,有助于增强作物生产专题地图的图形生产力与提供作物生产空间决策支持,利于推动作物生产信息化建设。     

宁春4号×河东乌麦F2∶5家系遗传图谱构建与籽粒蛋白质性状QTL分析

为适应宁夏回族自治区小麦绿色优质高效品种选育和产业提质增效的需求,以宁春4号与河东乌麦杂交后代的248个F_2∶5家系为材料,对其进行遗传图谱构建与籽粒蛋白质数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)分析,以期为该地区小麦蛋白质性状遗传改良提供育种中间材料和QTL。结果表明:用197个SSR(simple sequence repeats)标记构建了包括小麦21条染色体的分子遗传图谱,总长度为2 342.63 cM,标记间平均距离为11.89 cM;蛋白质性状在F_2∶5家系出现较大分离,粗蛋白质含量、湿面筋含量的群体平均值(分别为14.49%、30.96%)介于双亲该性状之间,稳定时间的群体平均值(10.86 min)均超过高亲;粗蛋白质含量、稳定时间、湿面筋含量的超中亲比例分别达50.81%、77.82%、50.00%,超高亲比例分别达21.77%、59.27%、22.98%;籽粒蛋白质性状3个指标间均呈极显著正相关(P﹤0.01)。利用22个标记共检测到36个籽粒蛋白质QTL,分别为14个粗蛋白质含量QTL、6个稳定时间QTL和16个湿面筋含量QTL,涉及1A、2A、3A、5A、7A、1B、2B、6B、1D、2D、3D、4D、5D、6D、7D等15条染色体,36个QTL的连锁系数(LOD值)最大为14.9,表型贡献率为3%~6%,加性效应为-1.71~1.17,有11个标记所在的位点存在籽粒蛋白质性状QTL富集区。     

Genetic linkage map of the pearl oyster,Pinctada martensii (Dunker)

Genetic linkage maps were constructed with amplified fragment length polymorphism (AFLP) and microsatellite markers for the pearl oyster, Pinctada martensii (Dunker), the main bivalve used for marine pearl production in Asia. Twenty‐four AFLP and 84 microsatellite primer pairs were used for linkage analysis in a full‐sib family with two parents and 78 offspring. Of the 2357 AFLP fragments generated, 394 (16.7%) were polymorphic and segregating. Most (340 or 86.2%) of the markers segregated according to expected Mendelian ratios. Female and male linkage maps were constructed using 230 and 189 markers, including 15 and 10 microsatellites respectively. The female map consisted of 110 markers in 15 linkage groups, covering 1415.9 cM, with an average interval of 14.9 cM. The male map consisted of 98 markers in 16 linkage groups, with a total length of 1323.2 cM and an average interval of 16.1 cM. When unlinked doublets were considered, genome coverages were 78.5% for the female and 73.5% for the male map. Although preliminary, the genetic maps constructed here should be useful for future linkage and quantitative trait loci mapping efforts.     

镜鲤体质量和体长的QTL定位研究

以镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系为材料,用940对微卫星(SSR)标记进行基因组扫描,采用半同胞家系的分析策略对体质量(BW)和体长(SL)进行QTL定位分析。QTL检测显示:基于父系的QTL分析,共检测到8个QTL区间。5个与体质量相关的QTL区间中,1个QTL为95%基因组水平(genome-wide)显著性,位于LG26连锁群,其他4个QTL均为95%染色体水平(chromosome-wide)显著性;3个与体长相关的QTL区间与体质量的QTL区间重叠,其中,1个QTL为99%基因组水平显著性,其余2个QTL均为95%染色体水平显著性。基于母系的QTL分析,共检测到11个QTL区间。6个与体质量相关的QTL区间中,1个QTL为99%基因组水平显著性,位于LG26,2个QTL为99%染色体水平显著性,其余3个QTL均为95%染色体水平显著性;5个与体长相关的QTL中有4个与体质量QTL区间重叠,其中,1个QTL为99%基因组水平显著性,1个QTL为99%染色体水平显著性,其余3个QTL均为95%显著性染色体水平。结果表明,在LG26上,存在着与体质量和体长都显著相关的QTL区间,且均达到基因组显著性水平,最小置信区间为3 cM。此QTL结果可以应用于鲤鱼分子标记辅助育种。     

鱼源嗜水气单胞菌质粒的指纹图谱及其与耐药性的关系

为了解国内各地嗜水气单胞菌的耐药性、质粒指纹图谱及质粒大小与其耐药性之间的关系,分离、收集了40株不同时期来源于国内各地的鱼源嗜水气单胞菌,通过KB纸片法检测对29种抗生素的耐药性,碱裂解法小量提取质粒后,采用限制性内切酶EcoRⅠ及HindⅢ对质粒DNA进行酶切并对质粒菌株采用溴化乙锭消除处理,通过琼脂糖凝胶电泳获得质粒指纹图谱,研究质粒与耐药性的关系。试验结果显示,嗜水气单胞菌耐药情况严重,且多重耐药普遍;40株嗜水气单胞菌的质粒检出率为37.5%;质粒指纹图谱与耐药相关性分析表明,嗜水气单胞菌的耐药性与所携带质粒的数量和大小无直接关系,来源相同、耐药类型相似的菌株质粒图谱及酶切质粒图谱相似;质粒消除试验发现质粒消除率为100%,但都只能消除部分质粒;其中12株菌部分耐药表型消失,提示质粒和染色体分别编码耐药基因,2.01 kb的质粒与该菌对萘啶酸、万古霉素的耐药性有关。     

VMS200系统及其在农业工程中的应用

随着精确农业技术的长足发展,介绍了一套建立在视窗平台上借助全球卫星定位系统(GPS)和地理信息系统(GIS)为基础的信息收集、地图制作、信息储存和管理的一系列软硬件系统-多媒体地图测绘系统(VMS200)的组成及发展过程,并基于相关实验,对多媒体地图测绘系统(VMS200)在现代农业工程领域中的应用进行了分析研究.