Rapid detection of Phytophthora cinnamomi using PCR with primers derived from the Lpv putative storage protein genes

Phytophthora cinnamomi is an ecologically and economically important pathogen. In this study, PCR assays were developed with primer pair LPV2 or LPV3 for rapid detection and identification of this organism. Both primer pairs were selected from putative storage protein genes. The specificity of these primer pairs was evaluated against 49 isolates of P. cinnamomi , 102 isolates from 30 other Phytophthora spp., 17 isolates from nine Pythium spp. and 43 isolates of other water moulds, bacteria and true fungi. PCR with both primer pairs amplified the DNA from all isolates of P. cinnamomi regardless of origin. The LPV3 primers showed adequate specificity among all other species tested. The LPV2 primers cross-reacted with some species of Pythium and true fungi, but not with any other Phytophthora species. PCR with the LPV3 primers detected the pathogen at levels of a single chlamydospore or 10 zoospores in repeated tests. The PCR assay was at least 10 times more sensitive than the plating method for detection of the pathogen from artificially infested soilless medium, and, to a lesser extent, from naturally infected plants. PCR with LPV3 primers can be a useful tool for detecting P. cinnamomi from soilless media and plant tissues at ornamental nurseries, whereas the LPV2 primers can be an effective alternative for identification of this species from pure culture. Applications of these assays for detection of P. cinnamomi in other environments were also discussed.     

小麦苗枯病菌的ITS分析及PCR检测

 小麦苗枯病菌(Clavibacter fangii,Cf)是引起小麦细菌性苗枯病的病原,本研究用16S~23S rDNA间的内源转录间隔区(internally transcribed spacer,ITS)序列通用引物L1(5'-AGTCGTAACAAGGTAGCCGT-3')和L2(5'-GTGCCAAGGCATCCACC-3')扩增Cf和其它相关细菌的基因组DNA;并对其PCR产物进行回收、克隆和测序,将所获序列和其它已报道的细菌ITS序列进行多重比较后设计出Cf的特异性引物I1(5'-TGCCAAGTCACACTGAGACGA-3')和I2(5'-CAATGATCTACCACCCTCCGA-3')。此引物可以从Cf中扩增出351bp的特异性片段,而其余参试的21个细菌PCR反应结果均为阴性。该方法可以应用于小麦苗枯病菌的快速、可靠检测。此外,本研究对多种植物病原棒形杆菌的ITS序列进行比较研究,发现其具有一定的分类意义。     

利用RT-PCR检测库尔勒香梨苹果茎痘病毒的研究

 以库尔勒香梨新鲜、冷藏、冷冻叶片和皮层为材料,对提取双链RNA (dsRNA)的2种方法和提取总RNA的3种方法进行了分析比较,并对总RNA的提取方法进行了改进,获得了纯度较高、完整性较好的dsRNA和总RNA,在此基础上进行了反转录(RT)和PCR扩增。在国内首次完成了对苹果茎痘病毒(ASPV)的RT-PCR检测,建立了ASPV有效RT-PCR反应体系。用此体系扩增到ASPV一个长约316 bp的片段。实验表明以dsRNA和总RNA为模板均能成功进行RT-PCR检测,且dsRNA优于总RNA。     

不同引物对植原体的检测灵敏度比较研究

用常规PCR和巢式PCR对目前常用的各种植原体引物(fPl/rP7、fU5/rP7、fU5／rU3、fAY/rEY和fFD9/rFD9)的检测灵敏度进行了比较研究。研究发现，它们的检测灵敏度并不相同。最灵敏的引物(fAY/rEY)要比最不灵敏的引物(fFD9/rFD9)的灵敏度至少高出数千倍。因此，按照不同的检测目的选择所用的检测引物是明智的，特别是当待测样品中的植原体浓度极低时，比如葡萄组织样品中植原体的检测。据此提出了用于不同检测目的时的最佳引物。     

生物安全与家禽疫病控制

疫病成为制约我国畜牧业发展的主要因素，要较好控制疫病必须推行生物安全措施。本文从生物安全概念、推行生物安全必要性、生物安全范围、生物安全难点及养鸡场生物安全措施进行了论述。     

圆点印迹法检测葡萄斑点病毒技术研究

采用圆点印迹法检测GFkV，结果表明：Tris-HCl和PBS在提取GFkV时效果相同，在带毒葡萄植株中韧皮部的GFkV含量较高。     

生姜根结线虫病原鉴定及发生规律

采用田间调查、接种试验、电镜与显微镜观察以及酯酶同工酶电泳等方法,对引发生姜癞皮病的病原及发生规律进行了研究.结果表明,引起生姜癞皮病的病原为南方根结线虫Meloidogyne incognita.该病在每年6月中旬开始发生,8、9月份危害严重.病原在生姜上一年可发生完整的4代,完成1代平均约需35天.病原主要在0～40cm的土层内分布和危害,但具体分布情况依寄主生长状况而稍有差异.南方根结线虫繁殖速率受初始接种密度的影响也很大,当初始接种密度较低时,线虫繁殖速率较高,初始接种密度增大,繁殖速率降低,其平衡密度为每100g干土746.20个卵.     

红掌细菌性疫病的病原菌初步鉴定

 在云南西双版纳的红掌上发现一种由细菌侵染引起的病害,从叶片的病组织上分离到具有致病性的杆状细菌,将分离的病原菌接种于健康的红掌上,表现出与田间一致的症状。感病初期在叶缘或叶脉间出现水渍状小点,后期病斑多呈棕褐色至黑色坏死,病健交界处多呈黄色。从接种发病的病斑与田间标样上分离的病原菌菌落形态完全相同。通过菌株的培养性状、常规生理生化特性及透射电镜下菌体形态观察结果,将病原菌初步鉴定为黄单胞菌属(Xanthomonas)。BIOLOG鉴定和致病性测定结果进一步鉴定病原菌为地毯草黄单胞菌花叶万年青致病变种Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae(Xad)(McCulloch & Pirone) Vauterin et al.     

基于GIS的中国小麦条锈病菌越夏区气候区划

 基于多年的气象数据(1980~2001年),首次从制约小麦条锈病菌越夏的温度因子入手,结合寄主小麦因素,利用地理信息系统(Geographical Information System,GIS),对我国小麦条锈病菌越夏区进行较详细的气候区划。本研究从温度条件上明确了全国适合小麦条锈病菌越夏的范围。研究表明,在我国小麦种植区适合小麦条锈病菌越夏的范围很广。其中甘肃、四川、云南、陕西境内适合越夏的地区是连成一片的,甘肃东部除了西边的几个县外其它地方7、8月份最高一旬均温在20~23℃,条锈病菌越夏困难;西藏、青海境内的小麦种植区几乎都适合小麦条锈病菌越夏;贵州境内适合越夏的地区可能和云南越夏区是一个整体。云南适合越夏的地区甚广,且地形复杂,需要进一步调查研究。     

生姜癞皮病的发生危害及病原初步鉴定

生姜癞皮病在山东7月开始发病,8月中旬至9月中旬为盛发期。病株植株矮小、茎细、分枝少,叶色变淡,根茎表皮疣裂,根系腐烂,产量品质降低。病原物为南方根结线虫。砂质土壤、连作重茬、过量施钾肥均可加重该病的发生。