基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析

泛素结合酶在泛素化级联反应中居于中心位置,是连接泛素活化酶和泛素连接酶的桥梁,在泛素化系统中发挥着关键作用。本研究基于荔枝转录组数据库,利用生物信息学方法对转录组数据库泛素结合酶UBC基因家族进行鉴定,最终得到28个LcUBC基因家族成员。通过荧光定量PCR技术对LcUBC基因家族在‘妃子笑'荔枝不同组织中进行时空表达分析,并对花穗对照和烯效唑处理花穗发育的不同时期进行表达分析。结果表明：LcUBC基因家族成员对应所编码的氨基酸数分布在85~1146 aa之间,等电点大小在4.03~9.61之间,5个LcUBC蛋白为稳定蛋白,其余均为不稳定蛋白。2个LcUBC蛋白定位于细胞质,2个LcUBC蛋白定位于细胞质和细胞核,1个LcUBC蛋白定位于内质网,其余蛋白均定位于细胞核。系统进化分析结果表明,LcUBC蛋白分为10个亚家族;28个LcUBC基因家族成员在不同组织的表达量存在差异;烯效唑处理‘妃子笑'荔枝花穗与对照相比,烯效唑处理21 d后,LcUBC基因家族成员的多个基因表达量较高。这是在转录组水平分析LcUBC基因家族成员,本研究结果对今后该基因家族的分类、克隆和功能研究提供了参考依据。     

玉米ZmNRT关键基因挖掘以及氮响应基因共表达网络构建

以玉米自交系B73（V4版本）作为参考基因组,利用生物信息学方法鉴定玉米ZmNRT基因家族成员,从系统发育关系、GO（Gene Ontology）富集、基因结构和玉米不同时期及组织下的表达谱等方面全面解析玉米ZmNRT基因家族。基于qPCR实验和共表达网络分析,对玉米ZmNRT家族基因在氮响应中的作用进行系统的研究。结果表明,在玉米全基因组水平上共鉴定到 162 个 ZmNRT 基因,主要分为 ZmNRT1（62 个）和 ZmNRT2（100 个） 两大类群。GO富集发现,仅46个基因参与硝态氮转运过程,这些基因被不均等分成7个亚家族,每个家族1～15个基因。基因表达模式分析结果显示,不同生育期和组织下ZmNRT基因表达是差异的。在氮诱导下,qPCR鉴定结果显示,12个ZmNRT基因是氮响应基因,9个基因表达上调,3个基因表达下调。共表达网络结果发现,其中10个ZmNRT基因与已知的氮代谢基因存在显著共表达关系（|r|>0.8 p-value<0.05）,推测这10个基因可能是调控玉米氮代谢的关键基因。     

黑穗醋栗半同胞子代遗传效应分析及优良家系选择

以黑穗醋栗半同胞家系子代测定林为研究对象,通过探讨果实性状的遗传变异规律综合分析了数量性状的遗传效应,并以此为基础材料,系统进行了优良家系的选择。结果表明,家系间果实性状存在一定的变异,其中,果径变异较小,果穗质量变异较大,单果质量变异最大,平均变异系数分别为2.75%、32.36%和40.41%。果径和果穗质量的遗传力较强,遗传增益中等,遗传分化较小,遗传力分别为0.995和0.811,遗传增益分别为1.28%和9.67%,综合考虑各种影响因素,确定RINI07为优良家系。     

番荔枝不同家系果实表型性状的差异

为了筛选出适宜广西石漠化地区栽培的番荔枝（Annona squamosa）新品种,2012年从越南岩溶地区引进了番荔枝15个家系的果实,通过对其果实表型性状差异性分析,结果表明：各家系之间果实纵径、单果质量、糖度以及种子的长度、种宽、种厚、千粒重均有显著差异,而各家系之间果实横径差异不显著,果实纵径最大是27号,果实横径最大是11号,单果质量最重是23号,糖度最高是20号。     

烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆

为揭示类异黄酮还原酶(Isoflavone reductase-like,IRL)在烟草次生物质合成和生理功能中的作用,从品种龙里红花烟中克隆普通烟草IRL(NtIRL)基因家族2个成员的全长cDNA和gDNA序列,完成了生物信息学分析、Southern杂交和RT-PCR等分子鉴定。NtIRL1基因为1 946bp,全长cDNA为1 257bp;NtIRL2基因为2 089bp,全长cDNA为1 261bp。NtIRL1和NtIRL2蛋白均为310个氨基酸,分子质量分别为34.652和34.650ku,等电点分别为5.58和5.78。2个蛋白可能发生磷酸化等翻译后修饰,无信号肽,定位于细胞质,但有可能通过跨膜域与质膜发生联系。预测这2个蛋白的K8~G88为AdoHycase(cl09931)保守域,I9~T239为NmrA(pfam05368)保守域,并具有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基。预测2个蛋白的二级结构以α螺旋和延伸链为主;三级结构具有PIP酶典型特征,中间有1个催化裂口。BLAST和系统发生分析进一步证实NtIRL家族属于PIP大家族,与IFR的关系比PCBER和PLR更近。Southern blot杂交也证明,普通烟草基因组中有且只有2个IRL基因存在。半定量RT-PCR结果显示,NtIRL1和NtIRL2均在根中优势表达,在地上部各器官中表达很弱或无表达。     

基于社交网络的家庭农场经营规模探讨

在当前家庭联产承包责任制造成土地细碎化、不利于规模经济的背景下、家庭农场及其规模问题受到 关注。根据经济主体社交网络相关理论和实践的分析可知、家庭农场的规模不是人为主观设计就能够设定的、而是 取决于家庭农场交往过程中、以市场为平台、通过社交网络获得的物质、信息等资源的状况;以及取决于社交网络形 成的多边信任结构激发出的期权价值。家庭农场社交网络及其规模经营之间的动态关系在于通过社交网络的构建 和加固、可以做到;改变农业主体的属性从而形成家庭农场规模弹性的主观条件;实现生产、需求与交易环境的协 调、从而形成合理规模;畅通资源和要素流转渠道、为适度规模经营提供物质条件;稳定规模边际收益的预期等。     

甜橙乙烯诱导酯酶基因家族的进化

为了解甜橙乙烯诱导酯酶基因（Citrus sinensis Ethylene-induced esterase gene、CsEIE）家族成员的进化历 史与功能分化、检索比对了甜橙基因组尧TAIR 数据库尧Phytozome 数据库和NCBI EST 数据库中多个物种的EIE 家族 基因、分析了甜橙中该基因家族的全部18 个成员的基因结构尧染色体分布尧蛋白结构域尧保守序列尧基因表达尧进化 选择方向以及系统发生关系。结果表明、CsEIE 家族成员分布在4 条染色体中、通常呈串联重复排列;不同基因的外 显子数目变异范围为1~5;该基因家族绝大多数成员含有3 个保守基序。系统发生学分析结果显示、被子植物EIE 家 族基因聚为3 个分支、表明EIE 基因家族是在被子植物分支前就已存在的古老的多基因家族、家族成员目前的分布 现状是基因不断重复和丢失的结果。系统发生树中、甜橙CsEIE1~CsEIE8 属于同一分支、推测其是在柑桔与研究中 其他物种分化后经多次基因重复事件产生。该分支在其他被子植物中也同样有多个经独立基因重复事件形成的旁 系同源、而另外两支中发生的重复事件要少得多。表达分析结果显示、CsEIE 基因家族在转录活性尧表达模式上已经 出现了较大的分化。所有结果表明CsEIE 基因家族仍在扩张、各成员在经受不同的选择压力。     

家庭农场发育的内在机理、政策演化与推进策略

家庭农场作为一种新型农业经营主体,不仅在形式上体现了对传统家庭经营形式的继承与转化,对农村社会阶层分化的适应与调整,更在内容上反映了农业现代化和社会化的发展需求,是对农业生产经营体制的创新与发展.国内有关这一经营形式的相关政策在历经一系列的发展变化后开始逐渐明晰,但当前家庭农场在融资、保险、竞争、政策、培训等领域还面临诸多问题.对此,提出了推进家庭农场发育的具体策略,包括完善土地流转机制、加强对家庭农场的政策支持、建立健全农业社会化服务体系、大力培育新型职业农民等.     

当前家庭农场的发展现状与对策

对当前家庭农场的发展现状及存在的问题进行了深入分析,认为家庭农场是今后商品农产品特别是粮食作物农产品的主要提供者,将在构建新型农业经营体系中占据重要位置。发展家庭农场,应加大政策扶持力度,建立健全激励与退出约束机制,加快农业社会化服务体系建设,加强农业人才培养,做好政策统筹协调,推动家庭农场又好又快发展。     

视网膜母细胞瘤109例分析

目的：分析视网膜母细胞瘤的发病特点和诊治规律。方法；收集本院近２３ａ来的１０９例ＲＢ病毒，对其临床特点，病理表现，治疗，预后及家系调查作一回顾性分析。结果：７７．１％的病例就诊年龄小于５岁。２２例为双眼发病，９例具有肿瘤家族史。１０９例中以晚期虱阳多见，病理检查大多可见有视神经和巩膜浸润。