抑制性差减杂交结合基因芯片技术在植物基因差异表达研究中的应用

抑制性差减杂交技术和基因芯片技术是近年来发展起来的研究基因差异表达的2种非常有效的方法.SSH技术或基因芯片技术单独使用都存在不同程度的缺陷和不足,但若将2种技术结合起来使用,则能充分发挥各自的优势,并最大限度地弥补各自的不足.鉴于此,对SSH技术与基因芯片技术的原理与优缺点以及两者的结合在植物研究上的应用进行了综述.     

基因组选择与猪育种

随着高通量基因芯片和测序技术的快速发展,促使个体SNP基因型的判型成本快速下降,基因组范围的高密度SNP标记数据已经在家畜群体内使用。传统的LEMAS、LD-MAS或G—MAS预测育种值的能力是有限的,这是因为传统的MAS只使用很少的被证明是有效标记,而这些标记只解释复杂性状很小比例的遗传变异（10％～20％）。为了克服传统MAS的缺陷,Meuwissen等（2001）建议了一种新的、不同的方法,这种方法被叫做基因组选择（GS）。     

基因芯片技术在水生动物疾病防控中的作用

基因芯片技术是多学科交叉的综合性科学技术,具有自动化程度高、检测效率高、应用范围广等优点,已经成功地应用于生物学的各个领域,本文展望了基因芯片技术在水生动物疾病防控中的作用.     

油松雌雄球花高通量基因表达谱芯片分析

生殖调控是针叶树种遗传改良与良种生产过程中的重要环节,已经有许多实践经验积累,然而对其中雌雄球花发育及调控的分子生物学基础研究仍相当匮乏.以油松多个体多组织样本均一化cDNA文库为材料,通过转录组测序,获得46 584个油松单基因簇;基于这些基因信息,设计并定制油松表达谱芯片;通过对雌雄球花基因表达芯片分析,筛选到2 460个在球花发育后期显著差异表达的基因,其中1 309个在雄球花优势表达,1 151个在雌球花优势表达.分别从雄球花与雌球花优势表达的基因中各挑选1个表达水平差异超过800倍的基因,由于其功能未知,分别命名为MCE1(Male Cone Expressed 1)与FCE1(Female Cone Expressed 1),并进一步分析它们在雌雄球花不同发育阶段的表达规律.结果表明:MCE1只在雄球花各发育阶段高水平表达,而在雌球花各发育阶段表达水平极低,推测其参与雄球花的整个发育过程;FCE1在早期雄球花中大量表达,但随着雄球花的发育其表达量会急剧降低,而在雌球花中却始终稳定地高水平表达,推测其在雌雄球花不同发育阶段发挥不同的作用.研究结果可为油松及近缘树种雌雄球花发育的分子生物学研究提供基础和新的思路.     

科苑采撷

饲养家兔巧摸胎摸胎应在配种后8～10天进行为宜。摸胎时,先将母兔放在一个平面上,左手抓住母兔耳朵及颈部皮肤,右手先由前向后抚摸其皮毛,使其安静下来。然后右手拇指与其他四指呈“八”字型,伸到母兔腹下,轻轻托起后腹,使腹内容物前移,五指慢慢合拢,抚摸腹内容物的形状、大小和质地。如感觉有花生米大小、圆形、有肉感而滑的东西,则为妊娠的表现。国外奶牛增产新招①饲喂粥料:给奶牛喂粥料比喂干、湿料可提高产奶量31%。加工粥料时,先把粉状精料加少许食盐,用少量水冲稀搅匀,待锅内水沸腾时倒入,搅拌5～10分钟即成。②修整牛蹄:每季度休整…     

美国研究人员研发出“基因芯片”速测禽流感

美国研究人员研发出了一种“基因芯片”,以流感病毒基因为模板,可快速检测各种流感病毒,其中包括H5N1型高致病性禽流感病毒。这种基因芯片名为“M芯片”,由科罗拉多大学与美国疾病控制和预防中心合作研制,测试感冒病毒十分准确,可轻易区分H5N1型禽流感病毒与普通感冒病毒。     

EPG技术分析不同品种茶树抗假眼小绿叶蝉取食行为的差异

假眼小绿叶蝉是我国最严重的茶树害虫,不同品种对其表现出抗性或感性,EPG是近年用于快速检测作物抗刺吸式害虫的新技术。以浙江、江苏主推的6个茶树良种为供试材料,用可视的DC-EPG技术记录了该叶蝉的刺探取食行为。结果表明:(1)叶蝉在6个品种茶树上的7种基本刺吸波形是相同的。(2)在锡茶5号、苏茶1号上的刺探次数多,在韧皮部内的被动取食波-E波的持续时间长;在龙井43上刺探次数少,在韧皮部内的被动取食波E波持续时间短;苏茶120、中茶108和安吉白茶则居中。(3)使用聚类分析、多重比较分析,评判6个品种茶树抗叶蝉取食能力由强至弱的顺序为龙井43>苏茶120>中茶108>安吉白茶>苏茶1号>锡茶5号,该顺序与田间观察的6个品种茶树上叶蝉虫口密度由小到大的顺序基本一致。认为EPG技术可用于评判不同品种茶树对叶蝉抗性的强弱。     

从杨树基因组表达谱芯片数据中挖掘树木生长发育规律的研究

杨树是林木的模式树种,也是第1个完成全基因组测序的树种。杨树基因组计划推动了杨树基因芯片技术的不断改进和完善,通过结合统计学、信息学与传统生物学的方法与技术,对芯片数据进行深度挖掘和分析,使得基因组进化、木材形成、激素代谢、开花和休眠等研究领域进入如火如荼的发展阶段。     

植物内生菌活性提取物对粳稻基因表达的影响

运用基因表达芯片技术,分析了植物内生菌活性提取物对粳稻的根系进行处理后,粳稻根部基因表达谱的差异。处理后,有883个基因发生了变化,超表达13个,与粳稻生长发育有关的基因6个。     

犬基因组结构和多态性研究进展

家犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上注册的已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征。利用高密度芯片技术进行犬全基因组多态性分析,并通过基因组多态信息扫描定位功能基因成为热点,总结和综述了犬基因组结构变异和多态信息的研究进展,为开展家犬基因组学研究提供新的方法和思路。