拟南芥HMGs家族成员全基因组分析

高迁移率族蛋白是一种非组蛋白染色体蛋白质.文中通过生物信息学的方法鉴定到17个HMGs家族基因,利用在线工具分析了HMGs家族基因的组成以及染色体定位信息,利用Clustal-W以及MEGA4.0软件构建了拟南芥HMGs家族的系统发育树,利用通过查询基因芯片结果分析了该家族基因的不同组织部位的表达情况,并推测了部分基因的功能,为进一步研究HMGs家族基因的功能提供了参考.     

水稻逆境响应基因OsMsr11的克隆与分析

为了挖掘新的耐逆基因,本文在应用Affymetrix水稻表达芯片分析超级稻亲本培矮64S在不同逆境(高温、干旱、低温)胁迫下、不同发育时期叶片和穗中全基因组表达模式的基础上,对其中一个多逆境响应基因OsMsr11(Oryza sativa L.multiple stressresponsive gene 11)进行了克隆与分析。OsMsr11是一个受低温、干旱、高温多逆境诱导的基因,在孕穗期低温胁迫下表达水平显著上调。通过PCR扩增获得了包含其完整开放阅读框的cDNA序列。序列分析表明,其ORF为234 bp,编码77个氨基酸,有信号肽序列,无典型的保守基因结构域,预测其为分泌通路信号肽,分泌到细胞周质中,功能未知;OsMsr11基因不含内含子,对其启动子区域进行分析,发现含有多种与逆境响应相关的顺式作用元件。为研究其功能,采用农杆菌侵染法转化超级稻父本9311,初步分析表明:在水稻中过量表达OsMsr11,增强了转基因水稻的耐盐性,降低了对外源ABA的敏感性。     

浅谈柑橘基因组芯片分析方法

指出了cDNA芯片和寡核苷酸芯片是目前用于柑橘基因表达谱分析的方法,基因组芯片数据分析主要包括数据预处理,筛选差异基因,差异基因再进一步分析。通过数据分析及整合样点的生物学信息,研究了植物生理变化。     

Dietary Protein Sources Affect Intestinal Genome-Wide Transcription Profile of Weaner Piglets

为探讨饲粮蛋白质源影响断奶仔猪小肠发育的分子机制,本试验利用猪全基因组表达谱芯片分析不同蛋白质源饲粮下断奶仔猪(断奶0、3、7和14 d)小肠转录谱,24头仔公猪随机分为2个处理,处理1采用乳源蛋白质30％替代饲粮总蛋白质,处理2采用全植物蛋白质源饲粮.结果表明:1)处理1获得370个差异表达基因(P＜0.05),采用序列试验聚类分析,共获得26个表达模式,其中有3个显著表达模式,模式5和11显著性水平最高(P＜0.01).处理2获得263个差异表达基因(P＜0.05),序列试验聚类分析得到26个表达模式,其中模式3和22显著水平最高(P＜0.01).2)基因共表达网络构建和分析一定程度上揭示了不同蛋白质源饲粮对肠道发育的分子调控机制,以及两者之间的差异.通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因.通过基因芯片数据,从2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出12和9个具有重要影响和研究价值的基因,以及9个在2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因.总之,本试验筛选出了一些在不同饲粮蛋白质源影响断奶仔猪肠道发育和功能过程中可能具有深入研究意义的候选基因.     

基因芯片在拟南芥非生物胁迫响应中的应用

为更好地理解作物响应及耐受胁迫的分子机制,利用非生物胁迫诱导表达基因提高作物的抗逆性,从而对作物进行遗传改良,创制抗逆能力强的新品种。以模式植物拟南芥为例,综述了基因芯片在非生物胁迫中的应用进展,并对基因芯片差异表达在作物响应及耐受胁迫研究中的应用前景进行展望。     

口蹄疫病毒分型诊断芯片探针设计初报

为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针。从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV的VP1基因序列547条。对每一血清型序列用DNA Star软件ClastalW程序进行多重比对,做系统发育分析并进行基因分型。用生物学软件BioSun 2.0建立基因型数据库,设计每一基因型的特异性探针。共设计出104条候选探针,通过芯片试验筛选出12条特异性探针。以各型特异性探针所对应的靶序列模板做10倍系列稀释进行PCR扩增,扩增产物与探针杂交,验证各探针的灵敏度。对O型SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4个基因型的各条探针的灵敏度进行了检验,结果这些探针能够检测到102数量级拷贝数的阳性靶标。     

基因科学对世界经济的影响

基因科学在近十年来取得了了不起的进展 ,现在人们可以在分子水平上设计具备生物功效的大分子 ,改造动植物和微生物以生产人类所需要的产品。随着在基因科学这一领域内新发现的不断应用 ,企业正以一种全新的方式进行重组 ,这种重组正在改变世界经济的结构。世界上的一些大型公司对基因科学不断地进行大规模的投资 ,将彻底改变现有的研究与开发的模式。此外 ,基因科学的信息量非常巨大 ,常常和其他技术交叉紧密 ,从而使得企业的行业界线越来越模糊 ,传统的制药业、农业与食品工业 ,化工 ,化妆品业 ,环境保护产业 ,能源和计算机业的分界线越来…     

纳米技术与动物检疫

纳米技术在动物医学中的应用有很大的潜力，本文以动物医学与纳米技术相结合的角度为出发点，着重介绍纳米技术在动物疫病诊断中的应用，包括纳米基因芯片、纳米标记物等技术的阐述。     

利用马克隆值差异显著的BILs鉴定棉纤维品质相关基因

【目的】马克隆值是衡量棉纤维品质的重要指标之一。利用马克隆值存在显著差异的2个陆海回交近交系材料进行高通量基因芯片分析,旨在筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因。【方法】从SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium Barbadense L.)高世代回交近交系(Backcross Inbred Lines,BILs)群体中选取NMGA-140(马克隆值6.2)和NMGA-051(马克隆值4.0)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 DPA(Days after anthesis)的棉纤维进行了表达谱分析。【结果】获得了2655个差异表达基因,包括功能预测基因(15.57%),翻译、核糖体结构与生物合成相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换、分子伴侣相关基因(9.31%)等。推测β-tub10正向调控棉纤维发育过程,β-tub1负向调控棉纤维发育过程,Ghi.3578.1.S1_s_at在棉纤维发育早期起到了作用。【结论】为棉花纤维品质的遗传改良提供了丰富的基因资源,为分子标记辅助育种开发更多新的分子标记。     

基因组检测技术在肉鸡遗传育种中的应用

优质品种构成了肉鸡产业进步的关键支柱。随着测序成本的降低,基因组检测技术已经广泛的应用于畜禽育种,尤其对于单体价值相对较低的个体具有重要意义。该文主要概述了基因组检测的类型和原理,以及基因组检测在肉鸡遗传机制挖掘和育种实践中的应用,旨在为肉鸡遗传育种提供一定的参考和借鉴。