日本落叶松种子萌发过程中18个miRNAs的表达变化

运用qRT-PCR技术,检测日本落叶松种子萌发过程中的5个阶段——干种子 (萌发培养0 d)、吸胀(1 d)、萌动(5 d)、胚根外露(9 d)和子叶展开(28 d),miR156、miR159和miR160等18个miRNAs在其种胚内的表达模式,并对其目标基因进行生物信息学分析,探讨miRNA在针叶林木种子萌发过程中的基因表达模式。结果表明:(1)从整个萌发过程分析,18个miRNAs的表达水平皆以干种子阶段最高,吸胀和萌动阶段迅速下降;干种子阶段的表达水平分别是吸胀、萌动、胚根外露和子叶展开阶段的4.8 43.5、17.2 1 000.0、45.5 1 000.0、62.5 1 862.2倍。(2)从各个阶段分析,miR894的表达水平在5个阶段均最高,miR408均最低;其余16个miRNAs在5个阶段内的表达水平各有变化,综合排序结果从高到低依次为:miR951、miR950、miR156、miR159、miR396、miR398、miR390、miR160、miR947、miR165、miR319、miR162、miR171、miR397、miR395和miR172。(3)miRNA目标基因预测结果显示:目标基因主要是ATP/DNA结合蛋白、ARF等转录因子、质膜和核糖体等细胞组分及MAP等激酶活性蛋白等蛋白编码基因。(4)miR160对其目标基因JR160237 具有切割作用,切割位点发生在miR160与目标基因互补结合位点第10与11位碱基之间。JR160237在种子吸胀阶段表达水平迅速升高,在萌动、胚根外露和成苗阶段有所回落。     

microRNA对动物生殖轴以及胚胎着床影响的研究进展

表观调控作为调节基因功能的一种重要手段,其对生殖内分泌方面的调控起着重要作用。microRNA(miRNA)作为一类小的非编码RNA,也是一种表观遗传因子,它广泛参与生物体内各种生理及病理过程,对哺乳动物繁殖起着重要的调控作用。本文围绕miRNA在哺乳动物繁殖相关组织的表达及调控作用和miRNA对胚胎着床的影响进行综述,为理解miRNA对繁殖方面的表观调控、改善哺乳动物繁殖能力提供理论基础。     

外泌体miRNA在配子发育和受精中的调控作用

外泌体(Exosomes,EXs)是一类膜状结构的纳米级细胞外囊泡,携带大量的生物活性调节分子进行细胞间信息转导。EXs携带的miRNA在配子发生、发育和受精过程中发挥重要的调控作用。本文主要对EXs中的miRNA在卵母细胞和精子成熟以及受精过程中的调控作用做一综述。     

小鼠miR367逆转录病毒载体的构建与检测

为了探明小鼠体细胞重编程过程中miR367的作用机制,试验构建小鼠miR367逆转录病毒载体。根据NCBI上小鼠miR367的相关序列,从小鼠基因组中扩增miR367并将其连接到pMD18-T载体,然后对重组质粒进行双酶切并回收目的片段。将目的片段与pMXs逆转录病毒载体连接,然后依次经过酶切、PCR筛选阳性克隆和测序,最终构建逆转录病毒载体miR367-pMXs;采用磷酸钙法将miR367-pMXs转染plat-E细胞,以包装逆转录病毒颗粒;用逆转录病毒颗粒侵染小鼠胚胎成纤维细胞,在侵染后的第5天,提取被侵染细胞的总RNA,逆转录后获得cDNA,并采用Q-PCR方法检测侵染细胞中的miR367表达量。结果表明,被逆转录病毒侵染后,小鼠胚胎成纤维细胞中miR367的相对表达量比侵染前约提高了170倍。上述结果表明,成功构建小鼠miR367的逆转录病毒载体,为开展体细胞重编程机制的相关研究提供依据。     

miR-145a-3p通过靶向ATG14调控布鲁氏菌诱导的RAW264.7自噬

【目的】探究miR-145a-3p对布鲁氏菌诱导的巨噬细胞(RAW264.7)自噬及其对布鲁氏菌胞内生存的影响。【方法】首先合成自噬相关miRNA miR-145a-3p的模拟物(miR-145a-3p mimics)和抑制剂(miR-145a-3p inhibitor)及对照模拟物(NC mimics),转染至GFP-RFP-RAW264.7细胞中,然后用布鲁氏菌侵染该细胞24 h,通过激光共聚焦显微镜观察miR-145a-3p对自噬的影响;运用TargetScan、miRBase等生物信息学软件预测miR-145a-3p的靶蛋白;通过构建PmirGLO-ATG14-3′UTR和PmirGLO-ATG14-3′UTR-mutation重组质粒,用SacⅠ和KpnⅠ进行双酶切鉴定,并利用双荧光素酶报告系统验证miR-145a-3p与自噬相关基因(autophagy-related gene 14,ATG14)的靶向关系;将RAW264.7细胞培养至60%汇合时,分别转染miR-145a-3p mimics、miR-145a-3p inhibitor和NC mimics,转染7 h后用布...     

调控基因表达的微小RNAs

微小RNA(miRNAs，microRNAs)是一类在动植物中长度约为22个核苷酸，通过RNA干涉途径调节蛋白编码基因表达活性的非编码小分子RNA。微小RNAs来源于染色体的非编码区域，由70~120个碱基大小的可形成发夹结构的前体加工折叠形成茎环结构，其表达具有组织和时期特异性，是调节其他功能基因表达的重要调控分子，而且其中一些基因在进化上有很高的保守性。微小RNAs能抑制多个基因的表达，因此这些分子将会在控制基因表达方面发挥巨大的作用。作者对微小RNAs的识别、特征、作用机制及功能进行探讨。     

Differential expression of microRNAs in bovine papillomavirus type 1 transformed equine cells

Bovine papillomavirus (BPV) types 1 and 2 play an important role in the pathogenesis of equine sarcoids (ES), the most common cutaneous tumour affecting horses. MicroRNAs (miRNAs), small non‐coding RNAs that regulate essential biological and cellular processes, have been found dysregulated in a wide range of tumours. The aim of this study was to identify miRNAs associated with ES. Differential expression of miRNAs was assessed in control equine fibroblasts (EqPalFs) and EqPalFs transformed with the BPV‐1 genome (S6‐2 cells). Using a commercially available miRNA microarray, 492 mature miRNAs were interrogated. In total, 206 mature miRNAs were differentially expressed in EqPalFs compared with S6‐2 cells. Aberrant expression of these miRNAs in S6‐2 cells can be attributed to the presence of BPV‐1 genomes. Furthermore, we confirm the presence of 124 miRNAs previously computationally predicted in the horse. Our data supports the involvement of miRNAs in the pathogenesis of ES.