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研究旨在揭示香猪卵巢组织中circ_CSPP1的潜在功能。利用CIRI-full拼接circ_CSPP1的序列,circBase数据库在线blat分析circ_CSPP1的保守性,采用RT-PCR和Sanger测序技术从香猪卵巢分离和鉴定circ_CSPP1,采用miRanda、RNAhybrid和PITA软件预测和分析circ_CSPP1结合的miRNA分子及miRNA的靶基因,对靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果显示,分离到的circ_CSPP1是保守的,由CSPP1基因的外显子8~12组成,可作为ssc-miR-324、ssc-miR-10a-5p、ssc-miR-9847-3p、ssc-miR-365-5p、ssc-miR-92b-5p、ssc-miR-885-3p、ssc-miR-7139-3p、ssc-miR-9851-3p和ssc-miR-33b-3p等14个miRNAs的分子海绵,靶向755个蛋白编码基因。GO富集分析表明,circ_CSPP1的靶基因显著富集到153个GO条目,其中细胞成熟、细胞分裂位点、细胞迁移的负调控、Wnt信号通路、细胞周期蛋白结合、子宫发育、MAPK活性的激活、黏着斑和卵裂沟等条目与卵巢功能相关。KEGG富集分析表明,circ_CSPP1的靶基因富集到260个信号通路,其中显著富集的有29个信号通路,主要富集于癌症通路、细胞周期、雌激素信号通路、PI3K-AKT信号通路、卵巢类固醇生成、催产素信号通路和细胞凋亡等信号通路。综上,circ_CSPP1可作为许多miRNA的分子海绵调控香猪卵巢颗粒细胞的增殖与凋亡、卵泡成熟、排卵过程、卵巢类固醇生成和卵巢早衰等生物学过程。 相似文献
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miRNA是目前生物学研究的热点领域之一,随着越来越多的miRNA被发现,miRNA的命名及注释鉴定标准经历了一系列变化。对miRNA的命名及注释鉴定标准进行了总结,以期为后续的miRNA命名及注释鉴定提供借鉴。 相似文献
64.
【目的】MicroRNA(miRNA)是一类内源单链非编码的小分子 RNA,在动植物中参与转录后基因
表达调控。Vco-miR_n10 是蓝莓中的新型 miRNA,目前尚未见该 miRNA 功能方面的报道。本研究对蓝莓 VcomiR_n10 进行了初步功能分析。【方法】基于前期蓝莓小 RNA 高通量测序结果,对鉴定到的蓝莓新型 miRNA
(Vco-miR_n10)的前体序列(224 nt)进行克隆与测序,并利用 mfold 在线软件对其前体序列的二级结构进行
预测。采用 Gateway 系统构建了 35Spro:: pre-Vco-miR_n10 表达载体并转入野生型拟南芥中,对其正常生长及 300
mmol/L 甘露醇处理条件下的表型进行观察与分析。【结果】克隆获得了 Vco-miR_n10 的前体序列,该序列能够折
叠形成较完美的茎环结构且仅有 2 个错配碱基对。Vco-miR_n10 的成熟体序列位于 3'' 茎臂上。观察正常生长条
件下的转基因植株并无显著的表型变化。而在 300 mmol/L 甘露醇模拟的干旱条件下,Vco-miR_n10-24 与 VcomiR_n10-52 的发芽率(33.53%、37.69%)和绿苗率均显著低于野生型(发芽率 67.72%、绿苗率 66.33%)。【结
论】蓝莓 Vco-miR_n10 能够响应甘露醇模拟的干旱胁迫,并降低拟南芥对干旱的耐受能力,影响发芽率和绿苗率,
说明蓝莓 Vco-miR_n10 可能在植物响应干旱胁迫过程中发挥一定的调控功能。 相似文献
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本研究通过PCR方法从拟南芥基因组序列中分离了3个理论推断与耐寒相关的miRNA片段(miRNA402,miRNA319和miRNA393)和1个与植物生长相关的片段miRNA172。利用重叠延伸PCR技术将miRNA172小分子,以及3个与耐寒相关的miRNA402,miRNA319和miRNA393小分子串连在一起分别导入植物表达载体pVKH-35S-GUS-pA,取代表达载体中的GUS基因,构建了pVKH-35S-mir172-pA和pVKH-35S-mir31+402+393-pA融合表达载体。经PCR和双酶切及测序鉴定,pVKH-35S-mir172-pA和pVKH-35S-mir319+402+393-pA构建成功,为后续利用基因工程手段,miRNA转化木薯,提高木薯生长和木薯耐寒相关研究奠定基础。 相似文献
66.
植物miRNA抗逆性研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
在逆境胁迫下,植物中的miRNA能够迅速表达并作用于某些与逆境相关的基因,启动植物的某些抗逆信号系统,提高植物抵御不良环境危害的能力。文章就miRNA的合成、作用机制、进化特点及其在植物对高盐和干旱等胁迫中的抗逆作用机制进行了综述,并对植物miRNA的研究发展趋势进行了展望。 相似文献
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用miRNA Target Finder分析软件预测干扰RB1B株马立克氏病病毒(Marek’s Disease Virus,MDV)gM基因翻译的潜在靶序列,从中筛选出3个作为干扰对象,根据干扰载体pRFPRNAiC特点,设计合成3对单链DNA序列,经PCR反应扩增出双链DNA,并将其插入干扰载体pRFPRNAiC,构建重组干扰质粒pRFPRNAiCgM1、pRFPRNAiCgM2、pRFPRNAiCgM3。将质粒pRFPRNAiCgM1以不同的剂量转染鸡胚成纤维(CEF)细胞,确定最佳转染质粒量,试验结果表明1μg转染剂量转染效果最佳。以1μg剂量将3种重组干扰质粒分别转染CEF细胞,24h后感染RB1B株MDV,72h后用空斑计数MDV在CEF细胞上增殖数量,以此判定miRNA干扰效果,结果显示,重组干扰质粒中质粒pRFPRNAiCgM2干扰效果较好,能有效抑制MDV在CEF上的生长繁殖。 相似文献
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70.
剩余采食量(residual feed intake, RFI)是评价畜禽饲料利用率的重要指标。microRNA(miRNA)是一类通过转录后抑制基因表达的内源性非编码单链RNAs,长度约为22 nt,是基因表达的重要调控因子。miRNA与动物机体的采食及能量代谢密切相关,参与调控牛、猪、鸡等动物的RFI。针对近年来畜禽RFI的研究现状,特别是miRNA调控畜禽剩余采食量的研究进展进行总结,有助于揭示畜禽RFI性状的分子调控机理,为畜禽饲料利用率的改良与高效生产提供新思路,为优质畜禽的分子选育工作提供理论依据。 相似文献