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银杏MYB转录因子的鉴定及特征分析 总被引:1,自引:1,他引:0
《山西农业大学学报(自然科学版)》2017,(5)
[目的]MYB蛋白是真核生物中一类重要的转录因子,在植物形态建成、生长发育、初生和次级代谢产物合成等生命过程中起重要调控作用。银杏作为植物中的"活化石",其提取物中含有的活性成分次生代谢物类黄酮等对人体有益。在类黄酮的生物合成中,MYB转录因子扮演着重要角色。本研究从转录组水平详细鉴定和分析了银杏GbMYB转录因子,为今后GbMYB的功能研究奠定基础,也为其他物种MYB转录因子的分析提供方法。[方法]本文首先利用BlASTp和PlantTFbcat等生物信息学工具对银杏的MYB蛋白序列进行筛选和鉴定;其次运用MEME和MEGA 7.0软件分别对GbMYB蛋白进行基序和系统进化分析;最后使用MeV对GbMYB在银杏各组织中的表达水平进行聚类分析。[结果]从41151个银杏蛋白中共鉴定出60个MYB转录因子,根据MYB保守域的特点将其分为R1-MYB、R2R3-MYB和R1R2R3-MYB三大类。系统进化树分析发现60个GbMYB可分为16个亚家族且具有相似功能的蛋白序列通常聚在一个家族。在银杏GbMYB蛋白中共检测到21种不同的保守基序。表达谱数据分析表明,一些GbMYB基因的表达具有组织特异性。[结论]本研究利用生物信息学方法,在银杏转录组水平上共鉴定出参与调控银杏各个组织发育的60个GbMYB转录因子;结合拟南芥AtMYB家族分类法将GbMYB分为16个亚家族;保守基序分析显示GbMYB在功能上具有多样性。研究结果为全面解析银杏MYB基因结构与生物学功能提供了新信息,也为进一步研究银杏GbMYB转录因子在次生代谢产物中的调控功能奠定了基础。 相似文献
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利95-利98井区沙河街组四段砂砾岩储层主要为多期叠合的近岸水下扇-浊积扇沉积复合体,岩性复杂多样,分选差,物性变化大,整体表现为低孔、低渗储层,勘探开发难度大。对砂砾岩储层有效性及有效储层预测的研究,首先要利用经验统计法和正逆累积法综合确定有效储层的物性下限,其中渗透率下限为0.878mD,不分岩性时孔隙度下限为8.0%(砾岩+砾状砂岩组合孔隙度下限为6.0%,砂岩+含砾砂岩组合孔隙度下限为10%);然后通过储层电性分析,落实油层、油水同层、干层的电性界限。考虑到实际操作的可行性,通过地震正演模拟分析,优选出均方根振幅进行孔隙度预测,最终在各期次砂砾岩体的孔隙度预测平面图基础上,勾绘出有效储层分布范围。 相似文献
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<正>一身墨绿色的工作服,浓浓的眉毛下有一双大大的眼睛,方正的"国字脸"经常一脸严肃,显露出军人的刚毅。在公司内部,大家都称呼他"韦班",而客户都叫他"电保姆"。他就是国网重庆南川供电公司城区配网班班长——韦斌。苦活带头干"到现场去了!""带队去抢修了!"笔者多次到城区配网班想更多了解韦斌,但总见不到人,值班员工回答最多的就是这两句。韦斌带领的城区配网班管理着城区736台配电变压器,承担着约11万户的供电任务。2013年7月中旬,花山公园的丽景华庭小区由于负荷过载,导致电缆 相似文献
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文章从牛细管冷冻精液介绍、消毒、精液解冻、输精方法、母牛发情鉴定、注意事项等方面详细论述了牛细管冷冻精液授配技术,仅供养牛户及同行参考。 相似文献
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宿主的Synaptogyrin-2(SYNGR2)蛋白影响猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)的感染能力。本研究旨在研究宿主因子SYNGR2对PCV2在细胞水平增殖的影响,并进一步对SYNGR2影响PCV2体外增殖的机制进行探究。本研究利用基因敲除、过表达、定点突变等手段,在PK15细胞上研究SYNGR2基因敲除及其p.Arg63Cys点突变对PCV2增殖的影响。为探究SYNGR2参与PCV2感染的具体机制,作者对SYNGR2基因敲除的细胞及野生型对照细胞进行转录组测序,筛选SYNGR2功能相关的基因及通路,根据差异表达基因进行表达模式聚类分析,并通过实时荧光定量PCR(quantitative PCR,qPCR)验证差异表达基因的表达情况。结果显示,SYNGR2基因敲除或p.Arg63Cys点突变显著降低PCV2对PK15细胞的感染能力,对敲除细胞过表达不同基因型的SYNGR2,PCV2的增殖能力均恢复。转录组差异表达基因分析结果显示,SYNGR2的功能主要是参与膜成分及囊泡等被膜细胞器的组成。对差异表达基因肌球蛋白VIIA与Rab互作蛋白(... 相似文献
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