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提取实验室保存禽副粘病毒-2标准毒株Yucaipa株和3株分离毒株F4、F6、F8株的RNA,经RT—PCR,获得4株毒株的HN基因,同时测得F基因与HN基因之间的序列。序列分析结果表明,HN基因的ORF全长为1743 nt,编码一个由580个氨基酸组成的蛋白。运用DNAMAN软件分析,4株毒株与GenBank上已发表毒株的HN基因的核苷酸和氨基酸之间的同源性相比,同源率分别为99.89%和99.69%。分析F基因与HN基因间序列发现两基因间序列与副粘病毒科其他病毒的基因间序列相似,含有基因起始信号和终止信号,但不含3个碱基的连接序列。通过序列分析,在分子水平上进一步证实分离于同一批进口七彩文鸟的F4、F6株是抗原性存在差异的两个毒株。毒株间的血清学关系与分子水平的核苷酸序列、氨基酸序列的比较关系一致。 相似文献
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Aleksa Obradovic Athanassios Mavridis Klaus Rudolph Jaap D. Janse Momcilo Arsenijevic Jeffrey B. Jones Gerald V. Minsavage Jaw-Fen Wang 《European journal of plant pathology / European Foundation for Plant Pathology》2004,110(3):285-292
During the last two decades bacterial strains associated with necrotic leaf spots of pepper and tomato fruit spots were collected in Serbia. Twenty-eight strains isolated from pepper and six from tomato were characterized. A study of their physiological and pathological characteristics, and fatty acid composition analysis revealed that all of the strains belong to Xanthomonas campestris pv. vesicatoria. Being non-amylolytic and non-pectolytic, pathogenic on pepper but not on tomato, containing lower amounts of fatty acid 15 : 0 ante–iso, the pepper strains were designated as members of the A group of X. campestris pv. vesicatoria. However, the tomato strains hydrolyzed starch and pectate, caused compatible reactions on tomato but not on pepper, had higher percent of 15 : 0 ante–iso fatty acid, and were classified into B phenotypic group and identified as X. vesicatoria. PCR primers were developed which amplified conserved DNA regions related to the hrp genes of different strains of X. campestris pv. vesicatoria associated with pepper and tomato. Restriction analysis of the PCR product resulted in different patterns and enabled grouping of the strains into four groups. When xanthomonads isolated from pepper and tomato in Serbia were analyzed, they clustered into two groups corresponding to the grouping based on their physiological and pathological characteristics. According to the reaction of pepper and tomato differential varieties, the strains from pepper belong to races P7 and P8 and tomato strains belong to the race T2. All strains were sensitive to copper and streptomycin. Advantages and disadvantages of various bacterial spot management practices are discussed. 相似文献
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目的利用RT-PCR和RACE技术克隆土耳其斯坦东毕吸虫肌动蛋白基因全长序列并进行序列分析.方法根据日本血吸虫和曼氏血吸虫肌动蛋白基因的保守区设计引物,利用RT-PCR扩增出土耳其斯坦东毕吸虫的肌动蛋白基因的大片段,再结合RACE技术分别得到肌动蛋白的3'端和5'端,将三部分序列拼接后获得肌动蛋白基因的全长cDNA序列并进行序列分析.结果成功克隆了土耳其斯坦东毕吸虫肌动蛋白的全长cDNA并提交GenBank,登录号为DQ017265,核酸序列比对表明东毕吸虫肌动蛋白基因的核苷酸序列和日本血吸虫、曼氏血吸虫的同源性分别为90%和91%.结论土耳其斯坦东毕吸虫肌动蛋白的全长cDNA的克隆为进一步表达及其生物学性能的分析提供了理论基础. 相似文献
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绵羊肺腺瘤病毒NM株前病毒gag基因的克隆与序列分析 总被引:4,自引:0,他引:4
参照GenBank中已发表的绵羊肺腺瘤病毒(JSRV)的全基因序列,设计合成3对引物,对JSRVNM株的gag基因分3段进行PCR扩增,经琼脂糖凝胶电泳分析,分别呈3条531、888和949 bp的特异条带,将其分别克隆人pMD-18T载体中,进行序列测定并拼接序列,得到完整的gag基因序列。分析结果表明,与南非代表株(基因序列号NC-001494)的gag基因序列比较,核苷酸同源性为89.0%,推导出的氨基酸同源性为90%。与美国代表株(基因序列号AF105220)的gag基因序列比较,核苷酸同源性为86.3%,氨基酸同源性为87%。 相似文献
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H1N1猪流感广东株血凝素基因的克隆与序列分析 总被引:6,自引:1,他引:6
用RT-PCR方法扩增H1N1亚型猪流感病毒广东分离株A/Swine/GuangDong/711/2001HA基因,对其进行了克隆和测序。结果显示,HA基因全长1771bp.共编码579个氨基酸。A/Swine/Guang Dong/711/2001HA基因编码的氨基酸序列中有8个糖基化位点,5个位于HAl基因的第27、28、40、104和287位点,3个位于HA2基因的21、153和213位点。与H1N1亚型猪流感经典毒株比较后发现,血凝素糖基化位点并不是高度保守的。将A/Swine/Guang Dong/711/2001与自Gen Bank读取的1918年人流感毒株A/South Carolina/1/18、1991年人流感毒株A/MD/12/91和1997年猪流感毒株A/Swine/Wisconsin/238/97等进行核苷酸同源性比较分析,A/Swine/Guang Dong/711/2001与A/SouthCarolina/1/18、A/MD/12/91和A/Swine/Wisconsin/238/97等毒株的核苷酸同源性分别为93.9%、94.7%和93.9%。从系统发生树来看,A/Swine/Guang Dong/711/2001与A/South Carolina/1/18和A/Swine/Wisconsin/238/97的亲缘关系相近。 相似文献
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