不同筛选方法的低密度SNP集合填充准确性比较

【目的】尝试通过在华西牛参考群高密度标记芯片位点中,使用两种标记筛选方法挑选具有代表性的且密度梯度不同的SNP位点集合,后利用基因组填充策略在相同填充参数下将低密度芯片数据填充至高密度继而进行后续基因组研究,从而达到降低华西牛基因型分型成本的目的。研究分别比较了不同标记集合填充准确性和填充一致性的差异,阐述了标记筛选方法、标记密度、最小等位基因频率和参考群体数量等4个因素对填充结果的影响,为华西牛低密度SNP填充芯片设计提供参考。【方法】将质控后剩余的1 233头华西牛群体随机分为参考群(986头)和验证群(247头)。使用等间距法(equidistance,EQ)和高MAF法(high MAF,HM)两种标记筛选方法分别从华西牛参考群体的Illumina Bovine HD芯片位点集合中筛选出16种不同密度的SNP集合,共生成32种不同SNP梯度密度集合。随后在验证群体中利用Beagle(v5.1)软件将各低密度集合填充至770 k密度水平,计算填充准确性和填充一致性并对填充性能影响因素进行分析。【结果】32种低密度SNP集合的标记数量在100—16 000之间,窗口最大为24 17...     

日粮中添加活性干酵母对西门塔尔育肥牛饲料消化率和日增重的影响

[目的] 研究活性干酵母（active dry yeast,ADY）对西门塔尔育肥牛饲料消化率和日增重的影响。[方法] 选择西门塔尔肉牛30头,随机分成3组,A组为对照组,B组、C组为试验组。A组牛饲喂基础日粮,B组每头牛每天基础日粮+饲喂10 g酵母菌1,C组每头牛每天饲喂基础日粮+10 g酵母菌2,分早晚2次饲喂。预饲期为5 d,正试期为28 d。利用粪便分离筛对育肥牛饲料消化率进行评估,并计算日增重。[结果] 试验第21天,C组上层粪筛滞留物比例显著（P<0.05）低于A组。试验第28天,C组中层粪筛滞留物比例低于A组和B组,并显著（P<0.05）低于试验第7天、第14天和第21天。试验第28天,C组下层粪筛滞留物比例最高,并显著（P<0.05）高于试验第7天和试验第14天。2个试验组的平均日增重均高于对照组,试验C组的平均日增重显著（P<0.05）高于A组和B组。[结论] 日粮中分别添加2种活性干酵母可提高西门塔尔育肥牛的日增重,并在一定程度上提高饲料消化率,酵母菌2的效果更好。     

不同培育方式对西门塔尔犊牛生长发育性能的影响

【目的】探讨不同犊牛培育方式对犊牛生长发育性能的影响。【方法】根据2018—2021年的犊牛培育方法及生长发育性能,以西门塔尔牛为研究对象比较四组的培育效果,试验Ⅰ组采用带犊母牛白天放牧,其余时间随母哺乳;试验Ⅱ组采用白天放牧+早补饲,其余时间随母哺乳;试验Ⅲ组(传统组)采用带犊母牛全天舍饲,犊牛全天自由哺乳;试验Ⅳ组采用母牛舍饲,定时自然哺乳方式(按月龄限制哺乳次数)和犊牛岛内补饲。补饲组采用犊牛7日龄开始补饲,然后比较各组间0—4月龄(4月龄断奶)、4—6月龄犊牛的生长发育性能。【结果】结果表明：西门塔尔牛公、母犊初生重分别为45 kg和41 kg,四种培育方式对犊牛初生重影响不大;而试验Ⅳ组采用母牛舍饲,定时哺乳方式提高犊牛日增重明显,生长发育性能表现最好,料重比最低,4月龄断奶和6月龄体重都最高,公、母犊体重分别达217.19±52.27 kg和191.50±14.62 kg、296.11±26.51 kg和259.11±24.92 kg。3—4月龄采取过渡性断奶,定时哺乳和犊牛岛内补饲可提高犊牛成活率,减少断奶应激,促进犊牛生长发育,提高了种牛的供种水平。【结论】母牛舍饲,分...     

德系乳肉兼用型西门塔尔牛胚胎移植效果研究

[目的]建立德系乳肉兼用型西门塔尔牛群体,探索文山牛快速扩繁和生产性能提升技术。[方法]在马关县从600头文山黄牛、西本杂、安本杂和短本杂牛母牛中选择270头,用CIDR+PG法进行同期发情处理,选择黄体合格的受体,采用非手术法移植德系乳肉兼用型西门塔尔牛胚胎,在移植后60~90 d通过直肠检查法进行妊娠诊断,确定妊娠率,跟踪调查产犊情况,并测定胚胎移植所产犊牛的初生体重和主要体尺指标。[结果]受体牛同期发情处理270头,胚胎移植87头,妊娠28头,移植妊娠率32.18%;妊娠母牛中产犊17头,产犊率60.71%,产犊19头,成活16头,产犊成活率84.21%。公母犊牛平均的初生重33.00 kg,体高69.50 cm,体斜长62.19 cm,胸围72.69 cm,管围13.50 cm。[结论]首次在文山州开展了牛胚胎移植获得成功,杂交牛受体的移植妊娠率极显著或显著高于文山牛受体,秋季移植的妊娠率极显著高于春季和冬季的。提示以杂交牛为受体在秋季进行胚胎移植可有效提高移植成功率。     

Effect of particle size and partial replacement of alfalfa hay by soya bean hulls on nutrient intake,total tract digestibility and rumen degradability of diets by Holstein steers

This study examined the effect of alfalfa hay (AH) particle size and the replacement of soya bean hull (SH) for AH within the diet of restricted fed Holstein steers on dry matter intake (DMI), total tract digestion, ruminal digestion, ruminal pH and ammonia nitrogen content, and faecal pH. Four rumen‐cannulated Holstein steers averaging 353 ± 9.6 kg of BW were assigned to a 4 × 4 Latin square experiment with four periods and a 2 × 2 factorial arrangement of treatments. Factor A was AH particle size (fine vs. coarse) and factor B was diet SH content (0% vs. 10%; substituted for AH). Steers were fed at 1% of body weight of TMR containing 400 g/kg forage and 600 g/kg concentrate. Chopping of AH to fine particles decreased (p = 0.01) amount of dietary materials retained on the medium sieve (8 mm). The inclusion of SH significantly increased (p = 0.01) materials retained on the 1.18‐mm sieve and tended to decrease (p = 0.07) materials on 19‐mm sieves. The inclusion of SH increased (p = 0.01) ether extract (EE) intake and increased (p = 0.07) DMI. Inclusion of SH increased (p = 0.01) EE digestion and decreased (p < 0.01) faecal pH. Neither AH particle size nor SH inclusion in diets affected (p > 0.10) the in situ ruminal degradability coefficients of DM (‘a’, ‘b’, ‘c’ or ‘a+b’). No interaction of AH×SH was seen on nutrient intake, digestibility and in situ ruminal degradability of Holstein steers.     

西门塔尔牛14项线性体型评分的正态分布检验

１４项线性体型性状引入到包括蒙贝利亚和弗列克维两个类群７０头成年母牛的西门塔尔牛群。体高，强壮度，乳用性，尻宽，前乳房附着，后乳房宽度，乳头位置和乳房静脉８个性状附合正态分布。而后腿侧观，尻宽，后乳房高度，乳房支撑和乳房匀度的评分具有偏崎，乳房深度偏崎十分明显。１３项评分性状是呈陡峰现象，只有乳房静脉一项不是；呈现陡峰现象的原因可能是分值取自于数个评分员的平均值所致。     

Sickness, mortality and the buller steer syndrome in a western Canadian feedlot

Objective To determine if an association existed between sickness, mortality and bullers in a western Canadian feedlot.
Design A retrospective epidemiological study.
Animals 78,445 male cattle that entered a 24,000-head feedlot in western Canada from 1991 to 1993.
Procedure Animal health records for bullers were collected and analysed to see if they were at greater risk of sickness and mortality than other steers, and to see if pens with a high prevalence of bullers also had a high prevalence of sickness and mortality.
Results The prevalence of bullers increased with increasing age of cattle on arrival at the feedlot (R = 0.36; P < 0.001). Sickness and mortality decreased with increasing age of cattle on arrival. However, sickness and mortality in bullers relative to other steers actually increased with increasing age on arrival suggesting an interaction existed between sickness and bullers. Bullers were significantly (P < 0.05) more likely to get sick and to die than other steers. In all cases, there was a strong temporal association between sickness and bullers, with sickness and bullers mostly occurring within the first 30 days of the feeding period. On average, pens of cattle with a high prevalence of bullers did not have a correspondingly high prevalence of sickness or mortality.
Conclusion This study suggests that sickness is an effect modifier of dominance behaviour and therefore bullers in feedlot steers. Bullers should always be checked for signs of sickness and treated accordingly. Further research is needed to investigate the effects of sickness on dominance behaviour in pens of feedlot cattle.     

中国肉用西门塔尔牛场间遗传联系分析

旨在加快中国肉用西门塔尔牛的遗传进展,实现全国范围内的联合育种。本研究利用全国38家育种场和公牛站在2000—2019年出生的3 991头肉用西门塔尔牛初生重性状,使用DMU软件对场间关联率进行计算。对各场站划分关联组,并比较单场和关联组内的遗传力和估计育种值（estimated breeding value,EBV）的预测准确性。结果表明,中国肉用西门塔尔牛全国平均关联率为1.91%,大部分场间关联率处于较低水平。依据关联率可划分出两个关联组,分别包括6个和8个场,组内平均关联率分别为11.23%和12.54%。对两个关联组分别进行单场和联合估计,单场估计初生重的遗传力范围为0.32~0.44,关联组1的初生重遗传力为0.47,关联组2的初生重遗传力为0.43。两个关联组单场估计EBV的平均准确性分别为0.47和0.45,联合估计EBV的平均准确性分别为0.61和0.56。联合估计较单场估计EBV的准确性有明显提高。依据关联率划分关联组进行联合育种有利于加快中国肉用西门塔尔牛的育种进程。为推进中国肉用西门塔尔牛的育种进程,应先形成区域性联合育种,再逐步加强遗传联系,形成全国范围内的遗传关联体系。     

西门塔尔牛牙龈间充质干细胞的分离鉴定及诱导分化

本研究旨在建立西门塔尔牛牙龈间充质干细胞（gingival mesenchymal stem cells,GMSCs）体外分离培养体系,并对其生物学特性进行探讨,为细胞治疗、再生医学等提供种子细胞。取14周龄西门塔尔牛牙龈,采用0.1%Ⅳ型胶原酶消化法分离GMSCs,进行体外培养和冷冻保存,测定冻存前后细胞活率,MTT检测法绘制GMSCs生长曲线;通过免疫荧光、流式细胞术和PCR等方法鉴定西门塔尔牛GMSCs特异性标记物（CD29、CD44、CD73、CD90、CD105、CD166和STRO-1）,并通过体外成脂、成骨诱导检测其多向分化潜能。结果表明,西门塔尔牛GMSCs折光性强、贴壁后呈长纺锤形;冻存前和复苏后细胞的活率检测结果显示,细胞复苏后的活率均小于冻存前的活率,但均维持在85%以上,细胞生长曲线呈典型的S型;免疫荧光结果显示,西门塔尔牛GMSCs表达CD29、CD105和STRO-1,不表达CD31;PCR结果显示,西门塔尔牛GMSCs表达CD44、CD73、CD90和CD166,不表达CD34和CD45;流式细胞术结果显示,西门塔尔牛GMSCs高表达CD73（99.94%）、CD90（99.87%）和CD105（99.90%）,几乎不表达CD34（1.16%）和CD45（1.18%）;成脂诱导分化后,可见大小不一的脂滴,脂滴可被油红O染色,且PCR检测结果表明其表达成脂关键基因过氧化物酶体增殖因子活化受体-γ（PPAR-γ）和脂蛋白酶（LPL）;成骨诱导分化后,可见被茜素红染色的矿化结节,且PCR检测结果表明其表达成骨关键基因Ⅰ型胶原蛋白（CollagenⅠ）和骨桥蛋白基因（OPN）。综上,本研究成功分离出西门塔尔牛GMSCs,建立了西门塔尔牛GMSCs体外分离、培养体系,并通过成脂和成骨诱导分化证明其具有多向分化潜能,结果可为再生医学和牙齿修复等研究提供参考。     

生殖激素对西门塔尔牛屡配不孕的影响

为探究生殖激素对西门塔尔牛屡配不孕的影响,采用ELISA方法对健康组（16头）和屡配不孕组（3头） 4个时期血清的生殖激素E2、PROG、FSH、LH、PGE2、GnRH进行检测,比较两组生殖激素浓度变化。结果显示：屡配不孕组的产后恢复期与第1发情期的E2浓度,第1发情期和第2发情期的FSH浓度,第2发情期GnRH浓度,第3发情期PROG、PGE2浓度均显著低于健康组的生殖激素浓度（P＜0.05）。产后第16天、第27天和第41天屡配不孕组E2浓度低于健康组（P＜0.05）;产后第52天屡配不孕组PROG浓度低于健康组（P＜0.05）;产后第41天和第58天屡配不孕组FSH浓度显著低于健康组（P＜0.05）;产后第58天时屡配不孕组LH浓度显著低于健康组（P＜0.05）;在产后第16天、第41天和第91天屡配不孕组PGE2浓度显著低于健康组（P＜0.05）;产后第68天屡配不孕组GnRH浓度显著低于健康组（P＜0.05）。综上所述,6种激素浓度低于正常值可能会导致屡配不孕,激素变化或可作为评价西门塔尔牛屡配不孕的参考。