The Inhibitors of CDK4/6 from a Library of Marine Compound Database: A Pharmacophore,ADMET, Molecular Docking and Molecular Dynamics Study

Background: CDK4/6 (Cyclin-dependent kinases 4/6) are the key promoters of cell cycle transition from G1 phase to S phase. Thus, selective inhibition of CDK4/6 is a promising cancer treatment. Methods: A total of 52,765 marine natural products were screened for CDK4/6. To screen out better natural compounds, pharmacophore models were first generated, then the absorption, distribution, metabolism, elimination, and toxicity (ADMET) were tested, followed by molecular docking. Finally, molecular dynamics simulation was carried out to verify the binding characteristics of the selected compounds. Results: Eighty-seven marine small molecules were screened based on the pharmacophore model. Then, compounds 41369 and 50843 were selected according to the ADMET and molecular docking score for further kinetic simulation evaluation. Finally, through molecular dynamics analysis, it was confirmed that compound 50843 maintained a stable conformation with the target protein, so it has the opportunity to become an inhibitor of CDK4/6. Conclusion: Through structure-based pharmacophore modeling, ADMET, the molecular docking method and molecular dynamics (MD) simulation, marine natural compound 50843 was proposed as a promising marine inhibitor of CDK4/6.     

CRISPR/Cas9编辑芥菜型多心皮油菜BjROP10基因的研究

油菜多心皮性状可显著增加油菜的每角果粒数,在油菜高产育种中有潜在的应用价值。前期研究发现,芥菜型多心皮油菜 J163-4 可形成稳定的四心皮性状,且小 G 蛋白基因 BjROP10 可能参与调控其多心皮的形成,但其分子机制尚不明确。本研究利用 CRISPR/Cas9技术,构建了BjROP10的双靶点载体,并遗传转化芥菜型多心皮油菜 J163-4。在 T₀代,通过筛选鉴定获得了 20 株阳性苗,其中 13 株心皮数目发生改变。通过测序分析了 7株心皮数发生变化的转基因阳性植株的 BjROP10 序列突变情况,结果显示其目标基因序列发生变异,导致无法编码形成正常的 BjROP10 蛋白。本研究对进一步解析 BjROP10 基因响应 CLV 信号调控油菜心皮数发育的功能提供了材料基础,也为研究油菜多心皮性状发育的分子机制奠定理论基础。     

鸡Rab6基因的克隆和特征分析

Rab是真核生物细胞器进行物质交换和信息传递重要的小分子结合蛋白。研究采用RT-PCR方法从22周龄母鸡脂肪组织中克隆了Rab6基因的cDNA序列。序列长度为774bp,包含1个627bp完整的CDS,编码208个氨基酸。该序列(Genbank No:DQ470138)与鸭、人、小鼠、狗的Rab6有85.8%～93.1%的同源性,而相应蛋白的同源性达97.6%以上。蛋白预测的分子量和等电点分别为23490Da、5.42,与鸭、人、小鼠、狗的Rab6蛋白高度相似,在78～102氨基酸处有1个跨膜结构。分析结果表明Rab6基因及其蛋白质在动物进化中是高度保守的。     

红鳍东方鲀3个白介素基因的序列特征及表达分析

本试验分析体质量(190.34±2.13)g的红鳍东方鲀白介素基因IL-1b、IL-8和IL-10的序列特征,检测其在红鳍东方鲀脑、鳃、心脏、肌肉、肝脏和脾脏中的表达,以及每尾红鳍东方鲀注射密度1×107 cfu/mL的哈维氏弧菌菌液0.1 mL后0、12、24、48 h在肝脏和脾脏中的表达.试验结果表明,IL-1b、...     

植物病程相关蛋白PR10研究进展

PR（pathogenesis related protein）蛋白产生与积累是植物体应答生物或非生物胁迫的主要特征之一。近年来大量PR蛋白被鉴定,根据它们的结构,亲源关系和生物活性,被分为17个功能家族。PR10蛋白具有核酸酶相似结构,一般为分子量16～19kD的酸性蛋白。近年来相关研究表明一些PR10蛋白具有核酸酶活性和体外抗菌活性,在植物防御反应中发挥重要作用,具有较为广泛的应用前景。本文就PR10蛋白的生理功能、基因结构、表达调控及其与植物抗病的关系等方面的最新研究进展作一综述,并结合本实验室工作展望其在植物抗性育种方面的应用前景。     

Mutations in FgPrp6 suppressive to the Fgprp4 mutant in Fusarium graminearum

The pre-mRNA processing factor Prp6 is an essential component of the U4/U6.U5 tri-small nuclear ribonucleoprotein(snRNP).In a previous study,mutations were identified in the PRP6 ortholog in four suppressors of Fgprp4 that was deleted of the only kinase FgPrp4 among the spliceosome components in the plant pathogenic fungus Fusarium graminearum.In this study,we identified additional suppressor mutations in FgPrp6 and determined the suppressive effects of selected mutations.In total,12 mutations o...     

辣椒新品种湘椒6号的选育

湘椒６号是由湖南地方良种伏地尖中选出的自交系Ｆ８１－１－２从北方引进的甜椒品种经６代单株选择而成Ｌ２４－１自交系配制而成的一代杂各。该品种植株生长势强,耐寒、耐湿,果实粗牛角形,果色深绿,微辣,商品性好。从定值致收获３５￣４５天,６６７ｍ＾２产鲜椒３０００ｋｇ。田间表现抗病毒病、疮痂病。     

翘嘴红肝脏G6Pase催化亚基的克隆以及摄食和饲料中碳水化合物对其表达的影响

采用RT-PCR和RACE法分离、克隆了翘嘴红G6Pase催化亚基基因全长cDNA,共1900 bp ［不含poly(A)］, 包括49 bp 5′非翻译区,1068 bp阅读框以及含Poly(A)信号AATAAA的778 bp 3′非翻译区［不包括Poly(A)］。阅读框共编码355个氨基酸,分子量为39.89 ku。序列比对分析表明翘嘴红G6Pase与斑马鱼G6Pase的相似性高达95%,与鼠、狗、人G6Pase的相似性为63%,和光滑爪蟾、金头鲷、河豚等G6Pase的相似性分别为69%、55%、76%,并具有G6Pase特有的3个保守基序。为了研究摄食以及饲料中碳水化合物对G6Pase的影响,使用实时定量RT-PCR分别测定了饲喂等能但不含碳水化合物和含23.98%碳水化合物的饲料的翘嘴红肝脏G6Pase基因的表达水平,在使用上述饲料饲喂8周后,禁食48 h, 然后测定禁食和摄食后3、6、12、24 h G6Pase mRNA的表达量,结果显示摄食后12 h,两组G6Pase的表达明显增加,说明摄食影响G6Pase基因的表达,禁食和摄食后3～12 h,含糖组G6Pase基因的表达量为无糖组的2～4倍,这表明碳水化合物可以诱导G6Pase mRNA的表达。图5参21 关键词：快速扩增cDNA末端;葡萄糖6磷酸酶;碳水化合物;翘嘴红;实时定量PCR E-mail:gexp@ffrc.cn     

高浓度铬对克氏原螯虾抗氧化酶系统的影响

采用毒性实验方法,研究了50mg·L~(-1)铬(Cr~(6 ))在14d内对克氏原螯虾鳃和肝胰腺抗氧化酶系统的影响。结果表明,肝胰腺比鳃的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)活性、总抗氧化能力(T-AOC)和丙二醛(MDA)含量均要高。Cr6 对鳃和肝胰腺SOD和CAT活性的影响各异,鳃SOD活性先受抑制再被激活,最后再被抑制;而肝胰腺SOD活性始终受到抑制。鳃CAT活性先增高后下降,肝胰腺CAT活性先下降后上升,最后均下降至低于对照组。鳃和肝胰腺T-AOC随Cr~(6 )处理时间而出现的变化呈总体一致的趋势:在暴露的7d内,T-AOC与暴露时间呈正相关,在暴露14d后显著下降;而MDA含量几乎全部低于对照组。结果显示,肝胰腺比鳃对高浓度Cr~(6 )的毒性影响更为敏感,高浓度Cr~(6 )在短期内可能对抗氧化防御功能起促进作用;同时,高浓度下克氏原螯虾抗氧化能力的提高可能并非由抗氧化酶活性的提高引起,而主要通过调动机体的非酶促系统来完成。     

基于GF-6/WFV卫星遥感的大田冬小麦叶片氮素含量估测

为对大田冬小麦叶片氮素含量（LNC）进行快速、准确及无损监测,通过在江苏省泰州泰兴市、盐城大丰区和南通如皋市布设冬小麦遥感监测大田试验,在获取试验样点冬小麦冠层红光波段反射率（RED_ref）、近红外波段反射率（NIR_ref）和计算的十个光谱指数（RVI、NDVI、DVI、SAVI、OSAVI、MSR、RDVI、EVI2、NLI和SVI）基础上,将12个遥感光谱指标与冬小麦LNC进行相关分析,选出与LNC相关性较好的作为模型输入变量,构建基于BP神经网络的冬小麦LNC估测模型, 并利用GF-6/WFV卫星遥感影像对县域冬小麦LNC的空间分布开展监测。结果表明,12个遥感光谱指标与冬小麦LNC之间存在不同程度的相关性,其中NDVI、RVI、MSR、OSAVI和NLI与冬小麦LNC的相关性较好（相关系数不低于0.65）。将优选的5个遥感光谱指标作为模型输入变量,构建基于BP神经网络的冬小麦LNC估测模型（LNC-BPEM）,模型的估测精度r²=0.866,RMSE=0.246%,ARE=12.9%。将冬小麦LNC-BPEM估测模型和GF-6/WFV影像结合对县域冬小麦LNC的空间信息监测,获得了如皋县域冬小麦LNC的空间分布特征,该区域冬小麦LNC范围在0.9%~2.0%（长势正常）的种植面积为29 693.3 hm²,占冬小麦总种植面积的74%。这说明利用GF-6/WFV卫星的多个遥感光谱指标与神经网络结合建模可有效估测县域大田冬小麦叶片氮素含量。