不同筛选方法的低密度SNP集合填充准确性比较

【目的】尝试通过在华西牛参考群高密度标记芯片位点中,使用两种标记筛选方法挑选具有代表性的且密度梯度不同的SNP位点集合,后利用基因组填充策略在相同填充参数下将低密度芯片数据填充至高密度继而进行后续基因组研究,从而达到降低华西牛基因型分型成本的目的。研究分别比较了不同标记集合填充准确性和填充一致性的差异,阐述了标记筛选方法、标记密度、最小等位基因频率和参考群体数量等4个因素对填充结果的影响,为华西牛低密度SNP填充芯片设计提供参考。【方法】将质控后剩余的1 233头华西牛群体随机分为参考群(986头)和验证群(247头)。使用等间距法(equidistance,EQ)和高MAF法(high MAF,HM)两种标记筛选方法分别从华西牛参考群体的Illumina Bovine HD芯片位点集合中筛选出16种不同密度的SNP集合,共生成32种不同SNP梯度密度集合。随后在验证群体中利用Beagle(v5.1)软件将各低密度集合填充至770 k密度水平,计算填充准确性和填充一致性并对填充性能影响因素进行分析。【结果】32种低密度SNP集合的标记数量在100—16 000之间,窗口最大为24 17...     

浅谈提高兽医比对实验准确性的方法

目前兽医实验室考核(人员比对实验)和实验室比对实验中经常涉及比对实验,一个结果的好坏直接决定排名前后,甚至直接与目标管理考核和绩效考评挂钩,因此,全国各地非常重视这一实验。比对实验涉及项目多为ELISA、血凝与血凝抑制实验和PCR。提高这3个实验结果的准确性就可以到达比对实验结果全部正确的目标。     

改性玉米淀粉黏结剂对种绳捻制质量的影响

为了提高水稻种绳的抗拉强度和穴距准确性、防止种子在种绳捻制和直播过程中脱落,提出了在包容材料上涂刷黏结剂的方法并配制了一种改性玉米淀粉黏结剂。试验结果表明,配制的改性玉米淀粉黏结剂及其涂刷量和黏度对水稻出苗率影响不显著。通过二次回归正交旋转组合试验,研究了改性玉米淀粉黏结剂的涂刷量和黏度与水稻种绳的抗拉强度、穴距准确性和每穴粒数合格率的关系,建立了相应的数学模型。利用多目标非线性优化方法,对黏结剂的涂刷量和黏度进行了参数优化。确定的最优参数组合是黏结剂涂刷量为80%、黏度为7 792 mPa·s。在此条件下,种绳的抗拉强度达到18.84 N,穴距变异系数为3.25%,穴粒数合格率为91.05%。研究结果证明,在种绳捻制过程中涂刷适量的改性玉米淀粉黏结剂,对提高种绳抗拉强度和穴距准确性具有重要作用,对水稻出苗和土壤环境没有影响。这为水稻种绳捻制机的改进设计提供了重要参考。     

提高电子检漏仪检漏的准确性

在使用新型的美国Ｔｉｆ５６５０型电子检漏仪检测华中理工大学制冷设备厂生产的ＲＺＳ－Ⅱ型日光型植物生长箱（群）过程中，进行不同检测方法对检漏准确性影响的研究，结果表明，即使是技术先进的进口电子检漏仪，检测方法不同对检测准确性影响较大，若检测方法不当，易误判，造成漏检，正确的检测方法是探头处于检测部位正下方３ｍｍ，探头移动速度〈１ｍｍ．ｓ＾－１。     

提高大豆新品系三项试验的准确性措施

大豆新品系的鉴定试验、品种比较试验及区域试验是大豆育种的三个重要环节,也是向生产推荐良种的三个重要"窗口".根据准确的鉴定试验能够将量比较大的高代稳定品系准确而果断地取舍,准确的品种比较试验能为区域试验提供可靠的优良品系(做品比试验当年要设异地鉴定试验),准确的区域试验能为生产试验提供量极少而可靠的优良品系,从而为品种的审定推广提供可靠的试验数据.通过这三个"窗口",生产单位能够超前高繁优良新品系,加快种子推广速度.所以,提高此三项试验的准确性至关重要.     

蚂蚁与下雨

“蚂蚁筑巢快下雨”、“蚂蚁搬家晴必雨,蜘蛛结网雨必晴”,这都是群众利用物象的变化来预测下雨的经验之一。我站从1964年4月开始,对蚂蚁的活动进行连续的观察,并分析其与气候的关系。结果认为利用蚂蚁的活动,在补充天气预报方面有一定的价值,但要结合当时的温度、湿度等情况加以分析,预报的准确性才高。现介绍观察结果如下:     

蜂业宣传应注意的几个问题

中国蜂业的发展壮大离不开宣传和推广。从总体上来讲 ,相比于化妆品、电子产品宣传确实还是不足 ,需要下功夫做深入持久的宣传 ,以提高中国蜂业的社会知名度和市场准入。但在宣传中要注意以下几个问题。1　优质的产品是做宣传的基础任何广告宣传都离不开其过硬的产品 ,没有优质的产品 ,宣传对商家可能会获得短期效益 ,但将损害整个行业的长远利益。所以 ,要尽一切力量 ,比如采取科学的饲养管理方法 ,选育优良品种 ,从源头上保证蜂产品不受污染 ,取蜜、取浆、采集花粉 ,贮运、包装、加工等各个方面严格按照《食品卫生法》的要求来操作 ,使之…     

影响复费率电能表费率计算的原因

复费率多功能电能表可设置年、时区、日时段费率及公众假日等多种数据,其外置时钟芯片具有日历、计时和闰年自动切换功能。精确记录客户在每一时刻的用电情况;通常有尖费率、峰费率、平费率、谷费率4种费率,通俗地说为尖峰平谷4个时段。1影响复费率计算准确性的两种情况1.1时钟的准确性问题是否始终能保持准确,将会对复费率多功能电能表是不是能够进行准确地计量产生决定性的影响。     

样本溶血对血浆中16种氨基酸测定准确性的探究

为探究样本溶血对国标酸解法测定血浆中16种氨基酸含量的影响,采集60份断奶仔猪颈动脉血液并分为3组,即普通溶血组、机械溶血组与对照组,普通溶血组为血液采集后溶血样本,机械溶血组为血液采集后经超声波处理溶血再离心样本,未溶血血浆为对照组。采用赛卡姆S433D全自动氨基酸分析仪检测血浆样本中天冬氨酸(Asp)、苏氨酸(Thr)、丝氨酸(Ser)、谷氨酸(Glu)、甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、蛋氨酸(Met)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)、酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸(Phe)、脯氨酸(Pro)、赖氨酸(Lys)、组氨酸(His)、精氨酸(Arg)的含量。结果表明,普通溶血组Asp、Ala、Val、Leu、His、Lys含量相较于其余两组显著升高(P<0.05),其余10种氨基酸含量相较于对照组偏高或偏低(P>0.05)。说明血样溶血对其氨基酸含量存在较大影响,且受非血红蛋白因素影响较小,为了尽可能避免或减少溶血的发生,建议采血操作以及样品的运送、分离检测严格规范,以提高测定的准确性。     

浅谈水务工程标底的准确性——以深圳市水务工程为例

水务工程的投资大、工期长、专业广,其不可预知性、风险大的特点导致了招投标过程中标段编制的复杂性。文章就水务工程标底的编制、审计依据、编制方法、作用、主要影响因素及提高标底的准确性作了简单的阐述。