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1.
大花君子兰叶绿体基因组及其特征   总被引:3,自引:0,他引:3  
郑祎  张卉  王钦美  高悦  张志宏  孙玉新 《园艺学报》2020,47(12):2439-2450
采用Illumina MiSeq测序平台对大花君子兰(Clivia miniata)叶片总DNA进行测序,通过组装获得了其叶绿体基因组(cpDNA)全长序列(158 114 bp)。对其cpDNA注释得到135个基因,包含87个蛋白编码基因、40个tRNA基因和8个rRNA基因。采用生物信息学方法对获得的cpDNA进行简单序列重复(SSR)分析和密码子偏好性分析。结果显示:①大花君子兰cpDNA中共有61个SSR位点,其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复数分别为38、9、2、8、3和1个,多数SSR分布在基因间隔区;②大花君子兰cpDNA密码子偏爱以A或U(T)结尾,亮氨酸使用频率最高,半胱氨酸使用频率最低。基于24种植物的cpDNA全长和23种植物的叶绿体ycf2基因序列进行系统发育分析,结果显示大花君子兰与石蒜科植物在同一分支,显示最近的亲缘关系,支持大花君子兰属于石蒜科。基于叶绿体ycf2的系统发育分析结果与基于cpDNA全长的系统发育分析研究结果大部分相同,支持ycf2基因可以代替cpDNA全长用于植物系统发育分析。  相似文献   
2.
克隆获得桃蚜电压门控钠离子通道基因cDNA序列,明确钠离子通道的典型特征,为研究桃蚜抗性分子机理奠定基础。采用实验技术主要有RT-PCR和PCR,克隆桃蚜钠离子通道基因cDNA序列,利用相关软件对其序列进行生物信息学分析。克隆得到两段cDNA序列MpNav-1(NCBI登录号:MN124170)和MpNav-2(NCBI登录号:MN176136)。MpNav-1长度为2945 bp,包括2877 bp的完整开放阅读框,共编码958个氨基酸;MpNav-2长度为3546 bp,包括3486 bp的完整开放阅读框,共编码1161个氨基酸。MpNav-1和MpNav-2共同组成桃蚜的钠离子通道α亚基,MpNav-1包含同源结构域Ⅰ和同源结构域Ⅱ,MpNav-2包含同源结构域Ⅲ和同源结构域Ⅳ。同源比对发现,桃蚜与豌豆蚜和高粱蚜钠离子通道基因相似度分别高达97.67%和97.65%,所克隆序列包含昆虫钠离子通道α亚基典型特征,具有MFM模块,并含有蚜虫类钠通道特有模块DENS。成功地克隆桃蚜钠离子通道基因,为阐明其对拟除虫菊酯类药剂产生靶标抗性的分子机制奠定基础。  相似文献   
3.
殷咸芳  刘志林 《青海草业》2001,10(4):21-22,15
湟源县草地面积有 85 1 85 .1 3hm2 ,占全县土地总面积的 5 6.45 % ,草地资源丰富 ,牧草种类较多 ,农业生产秸秆来源广泛 ,但由于利用不当 ,造成了草地严重破坏和秸秆的浪费 ,如何合理利用草地和秸秆资源 ,扼制草地退化 ,是促进该县畜牧业发展的重要因素  相似文献   
4.
广东果树上17种拟茎点霉的RAPD分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
 自320个随机引物中筛选出适于拟茎点霉属真菌种间亲缘关系分析的15个随机引物,并优化了RAPD分析的扩增体系,在此基础上,对广东果树上17种拟茎点霉进行了RAPD分析。各菌株间的Nei相似系数UPGMA法聚类结果表明:来源于不同地区的2个Phomopsis mangiferae Ahmad菌株和2个P.macadami Z.D.Jiang et P.K.Chi菌株都分别以0.636和0.589的相似系数两两首先聚在一起,而不同的种则只在小于0.54的相似系数范围内聚类,体现了种间及种内的亲缘关系差异程度;聚类群与寄主植物不具相关性,同种植物上的不同拟茎点霉,即使是分自相同寄生部位也不能聚在一类;支持形态学上将生于柑桔枝和黄皮茎、沙梨叶和果、杨梅叶和枝以及同是生于龙眼叶的共8个拟茎点霉分别鉴定为不同的种,而不支持将P. cytosporella Penz.et Sacc.与P. mangiferae合并为一个种的观点;RAPD技术可作为拟茎点霉属真菌种间的亲缘关系分析的重要手段。  相似文献   
5.
Ultrasonography of the liver was performed in 200 Holstein-Friesian dairy cattle using a 3.5 MHz transducer with a linear array electronic scanner. Liver samples were taken, processed and examined microscopically and the fat occupying rate was calculated. The hepatic ultrasonograms were evaluated according to the presence of bright pattern, dark pattern, deep attenuation, vascular blurring and blurring of edges. Of the 200 animals, 96 had a normal liver, 63 had hydropic degeneration of the liver, 37 had fatty infiltration of the liver, 3 had liver dystrophy and I had hepatic amyloidosis, diagnosed through histopathological examination. Amyloidosis was characterized by bright pattern and blurring of edges. Liver dystrophy had higher percentages of bright pattern and blurring of edges than normal liver. Hydropic degeneration had higher percentages of dark pattern and blurring of edges than normal liver. Fatty infiltration had higher percentages of bright pattern, deep attenuation, vascular blurring and blurring of edges than normal liver. The present results suggest that different ultrasonographic patterns can be observed in various diffuse hepatocellular disorders in dairy cattle  相似文献   
6.
研究结果表明,无论是香菇生料菌砖栽培,还是金针菇熟料袋栽,菌种世代的多少对产量均无明显的影响,这可能是由于菌种通过无性繁殖,遗传性变异甚小之故;研究结果还表明,金针菇菌丝生长的速度似乎有随着菌种工代的增多而加快的趋势,这窨是由于低代菌种自琼脂培养基移接天以杂本屑,棉籽壳等为主要原料的粗质培养基上的时间较短,适应酶的活性较弱,分解,利用高分子化合物的能力较差,故菌丝生长速度较为缓慢?还是由于其他原因  相似文献   
7.
塔里木河流域生态环境恶化的水文效应   总被引:12,自引:9,他引:12  
塔里木河是我国最大的内陆河。 4条源流出山口多年平均天然径流量 2 2 4 .9× 10 8m3 (195 7~ 2 0 0 1年 )。在全球变暖的大背景下 ,塔里木河流域山区气候出现变暖增湿的趋势 ,2 0世纪 90年代径流量达 2 4 1.9× 10 8m3 ,增幅 7.6 %。由于源流区人类开发利用水资源的影响 ,使得补给塔里木河干流的水量不断减少 ,水文条件改变 ,造成干流上、中游段耗水严重 ,导致下游生态与环境急剧退化。自 2 0 0 0年以来 ,实施的从开都河—博斯腾湖向下游绿色走廊应急输水 ,已使下游生态环境开始恢复生机。  相似文献   
8.
The complete nucleotide sequence was determined for genomic RNA of White clover mosaic virus (WClMV-RC) isolated from red clover (Trifolium pratense) in Japan, It is 5843 nucleotides in length, excluding the poly(A) tail at the 3' terminus. Similar to other potexviruses, it contains five open reading frames (ORFs 1 through 5), which putatively encode an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) (147 kDa), a triple gene block (TGB) (26 kDa/13 kDa/7 kDa), and a coat protein (CP) (22 kDa), respectively. The deduced amino acid sequence of the WClMV-RC CP was identical to that of WClMV-O, one of two New Zealand isolates, but only 85% identical to that of WClMV-M, the other New Zealand isolate, because of heterogeneity in the C-termini of CP amino acid sequences. The implication of this CP heterogeneity is discussed. Received 30 August 2001/ Accepted in revised form 11 January 2002  相似文献   
9.
Rice dwarf virus isolates were collected from several locations in Japan, the Philippines, China, Nepal and Korea. Genomic dsRNA segment profiles in polyacrylamide gel electrophoresis differed among the isolates. There were less differences in the profiles between isolates from Japan and Korea than in those between these two Countries and others. Nucleic acid hybridization was used to examine the extent of genomic variation. Full-length cDNAs to all genomic segments encoding non-structural proteins (S4, S6, S9, S10, S11 and S12) were synthesized from two Japanese isolates, and were used for dot-blot hybridization. Hybridizations using probes generated from the full-length cDNA clones failed to differentiate isolates from different geographical areas. However, cDNA probes covering a variable region of S12 were able to distinguish Japanese and Korean isolates from those of other countries. Phylogenetic tree analysis based on the amino acid sequence of P12 encoded by S12 grouped Japanese and Korean isolates together. The Chinese isolates from two different locations (Yunnan and Fujian) were closely related to each other, and were the most distantly related to Japanese and Korean isolates.  相似文献   
10.
以桃江县人工防护林为研究对象,分析了导致林地退化的主要原因,包括管护措施不到位、造林技术缺陷、自然灾害侵害、生理老化、环境污染等。针对退化原因,提出了相应的改造措施。  相似文献   
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