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对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47~435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析.结果表明:在F基因47~435nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajima's D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择.但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响. 相似文献
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【目的】旨在通过分析鸡蛔虫的形态学和分子生物学特征,以了解南昌市鸡蛔虫与其他蛔虫的系统发育关系。【方法】观察并记录分离自南昌市鸡蛔虫的形态学特征,随后提取每个样本总DNA,PCR扩增ITS基因并测序,序列经NCBI比对后,对蛔虫样本ITS基因进行同源性分析和系统发育分析。【结果】所有蛔虫样本虫体呈淡黄色,头部可见唇瓣3片,近头端可见神经环。雄虫尾部向腹部弯曲而雌虫尾部尖直。蛔虫样本ITS基因大小均为1 000 bp左右,与安徽、湖南、波兰鸡蛔虫分离株(登录号分别为:MN158368、OM876368、KY789470)以及与鸽蛔虫(登录号:JQ995321)高度同源,与鹅蛔虫(登录号:KC905082)同源性相对较高。实验分离的鸡蛔虫样本序列与其他国家或地区的鸡蛔虫序列及鸽蛔虫序列聚为一簇,与其他国家或地区的鸡蛔虫亲缘关系最近,与鸽蛔虫亲缘关系也很近;鹅蛔虫与其互为姊妹群,有独立的进化分支,亲缘关系相对较近。【结论】分离自南昌的鸡蛔虫与安徽、湖南、波兰鸡蛔虫分离株高度同源,亲缘关系很近,初步判定它们具有相同的起源,同时也表明南昌地区鸡蛔虫可能由安徽、湖南等地区流入;而与鹅蛔虫同源性相对... 相似文献
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胰岛素样生长因子2结合蛋白( IGF2BPs)是一种重要的RNA代谢调控因子,涉及多个不同的生物学过程。本研究鉴定了一个马氏珠母贝IGF2BP1基因,命名为PfIGF2BP1-1,该基因cDNA全长为7348 bp,ORF长 1818 bp,编码605个氨基酸。多序列比对和系统进化分析表明,PfIGF2BP1-1有2个RRM结构域和4个KH结构域,与其他物种来源的IGF2BPs同源。实时荧光定量PCR结果显示,PfIGF2BP1-1 在马氏珠母贝的8个组织中均有表达,在肌肉组织表达最高,其次为足和外套膜组织。利用pET-32a 原核表达载体构建了含有PfIGF2BP1-1成熟多肽区的重组质粒并成功表达蛋白。在IPTG浓度为0.5 mmol/L,37 ℃培养8 h的条件下诱导表达PfIGF2BP1-1蛋白最佳。PfIGF2BP1-1蛋白刺激马氏珠母贝外套膜原代细胞,引起壳基质蛋白基因Accbp、MSI7、Nacrein的表达水平显著上升(p < 0.05),表明PfIGF2BP1-1蛋白可诱导壳矿化相关基因的表达参与马氏珠母贝的生物矿化过程。 相似文献
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[目的]提高犬瘟热病毒N蛋白基因在大肠杆菌中表达可溶性GST融合蛋白的含量.[方法]研究诱导剂(IPTG)的最佳加入时间、诱导剂(IPTG)浓度、诱导时间以及不同温度条件对GST - CDV N融合蛋白表达的影响,获得在大肠杆菌中的最佳的表达条件,然后再在最佳条件下大量的表达,用GST - Sepharose 4B亲和层析柱对GST - CDV N融合蛋白进行纯化,得到最大量的可溶性融合蛋白,并对蛋白含量进行测定.[结果]大肠杆菌BL21 (DE3)转化菌在37℃培养3.5 h(OD600 =1.314)时,加入IPTG使终浓度为1 mmol/L,然后在27℃诱导8h,GST - CDV N融合蛋白可溶性表达量最高,达到0.862 mg/mL.[结论]确定了犬瘟热病毒N蛋白基因的优化表达条件,为犬瘟热病毒分子免疫学诊断和亚单位疫苗的研制奠定了基础. 相似文献
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甘蔗线虫病抗性基因的PCR检测研究 总被引:3,自引:0,他引:3
以38份未经线虫病常规鉴定的甘蔗种质资源为供试材料,根据番茄抗根结线虫病基因和甜菜抗胞囊线虫病基因的保守序列区域,分别设计了2条上游引物、2条下游引物,对设计的引物进行组合后,应用PCR特异扩增从中分别筛选出各1对特异引物。用抗根结线虫基因设计的特异引物进行扩增最终获得了1条大约460 bp大小的特异片段;用抗胞囊线虫基因设计的特异引物进行扩增最终获得了1条大约690 bp大小的特异片段,进一步进行了PCR-Southern杂交,确认了该2条特异引物的真实性。 相似文献
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为明确江苏省高邮市某鸡场商品蛋鸡感染疾病情况,对患病商品蛋鸡病料进行禽腺病毒(fowl adenovirus, FAdV)、马立克病毒(Marek’s disease virus, MDV)、禽白血病病毒(avian leukosis virus, ALV)核酸检测和细菌分离鉴定。结果显示:该鸡场患病商品蛋鸡为禽腺病毒(D种血清11型)和沙门菌混合感染;沙门菌分离株对利福平、恩诺沙星、链霉素、庆大霉素、氨苄西林和多西环素耐药,对环丙沙星、氟苯尼考、头孢曲松、阿米卡星、四环素、磷霉素、头孢噻肟、卡那霉素、新霉素、呋喃唑酮、氯霉素和大观霉素敏感。 相似文献
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