利用二代测序技术对柔嫩艾美耳球虫T-DNA整合位点的分析及鉴定

为建立一种适用于转基因球虫的快速且准确的分析T-DNA整合位点的方法,本研究利用二代测序技术对转基因柔嫩艾美耳球虫EtM2e虫株进行基因组重测序分析,基于嵌合体reads比对分析T-DNA的插入位点,通过T-DNA特有序列以及外源基因与球虫同源序列的测序深度进而分析T-DNA拷贝数,最后利用PCR扩增验证分析位点。结果表明:1)二代测序下机数据过滤后获得数据7.2 Gb,Q20为96.1%,Q30为89.2%,能够比对至柔嫩艾美耳球虫参考基因组的reads数为23 992 361×2,平均测序深度为80×,reads全基因覆盖结果表明整个染色体被覆盖的较为均匀,测序的随机性比较好,可以进行后续分析;2)比对至T-DNA序列的reads数为3 106和3 036,平均测序深度为140×,嵌合体reads序列信息表明T-DNA只存在一个插入位点,位于HG994969.1:2 704 213~2 705 255;3)T载体骨架特有序列卡那抗性基因的平均测序深度为67×,T-DNA特有序列EYFP基因的平均测序深度为85×,而T-DNA与球虫同源序列His4基因的5′调控区序列的平均测序深度为154×,Actin基因的3′调控区序列的平均测序深度为164×,同源序列的平均测序约为特有序列平均测序深度的2倍,这表明T-DNA为单拷贝,与发现一个插入位点的结果相符合;4)经PCR验证分析成功鉴定了该整合位点。转基因艾美耳球虫EtM2e虫株T-DNA整合位点的鉴定为后续转基因球虫鉴定提供了技术平台,也为球虫活载体疫苗的研发提供了一个潜在的靶位点。     

基于工业遗址改造利用探究——以中山造船厂公园景观设计为例

指出了伴随后工业时代的来临,世界经济格局的调整,第三产业逐渐取代第二产业,工业遗址中的水塔、废弃铁轨、厂房等象征工业革命的建筑,不断被移除.而在城市工业废弃地改造过程中,如何适宜地将场所精神融入新生景观中去,达到新与旧的融合,是近年来景观设计时所关注的热点.结合海绵城市的理念,改造并利用工业遗址,在使工...     

困难立地造林和森林植被恢复技术研究

随着经济全球化不断发展,人类活动对自然环境造成的破坏与日剧增,生态环境恶化带来的不良影响进一步扩大,以林业建设为途径修复生态环境是现阶段的有效措施之一。通过对林业建设进行分析,介绍了困难立地造林和森林植被恢复技术,从而进一步促进我国生态林业的发展。     

赣州市地面火箭人工影响天气标准化作业点建设管理的研究、探索和思考

为了进一步规范人影标准化作业点建设和管理、保障作业安全,结合赣州市人工影响天气标准化作业点建设工作,对人工影响天气标准化作业点建设和管理等内容进行了初步的探索和研究,文章根据最新的行业国标和工作实践进一步更新规范了人影标准化作业点的建设内容、标准和要求,总结了人影标准化作业点建设管理中积累的工作经验,指出了目前存在的问题,提出了思考和展望,可为其他地方开展人工影响天气标准化作业点建设和管理提供参考。     

磷肥对酸性红壤上玉米不同部位丛枝菌根真菌群落的影响

为了研究不同磷肥水平下酸性红壤上玉米不同部位丛枝菌根真菌(Arbuscular mycorrhizal fungi, AMF)群落多样性和组成结构,明确玉米不同部位AMF群落的分布特征及对磷肥的响应差别,为提高酸性红壤磷素利用提供理论依据。本实验设置三个磷肥水平：不施磷、低磷(25 mg P /kg)和高磷(100 mg P /kg),玉米培养4周后,测定玉米生物量和土壤理化性质,利用高通量测序技术检测玉米根部、根际和非根际土壤AMF群落结构和多样性。结果显示,随着磷肥水平增加,玉米生物量显著提高,高磷处理下玉米地上部磷含量显著高于不施磷和低磷处理。取样部位(根部、根际和非根际)显著影响了AMF群落优势属球囊霉属(Glomus)、巨孢囊霉属(Paraglomus)和近明球囊霉属(Claroideoglomus)相对丰度,但是磷肥影响不显著。类似的,取样部位而不是磷肥显著影响了AMF群落香农指数和物种丰富度。非度量多维标度(NMDS)结果显示,根部样品与非根际和根际土壤样品群落距离更远,而相同取样部位中不同磷肥水平间群落组成更为相似；置换多元方差分析(PERMANOVA)进一步表明,取样部位而不是磷肥显著影响了AMF群落组成结构,主要表现在根部样品与根际和非根际土壤不同。因此,酸性红壤上玉米不同部位对AMF群落的影响明显高于磷肥作用,表明AMF应用于酸性红壤时应重点考虑作物部位的特性。     

福建莆田凤腾龙滨海生态旅游度假区总体规划

通过对龙凤文化的延伸,以及与当地的妈祖文化结合,形成风腾龙跃、龙凤吉祥的意象,使凤腾龙滨海生态旅游度假区规划成为自然景观优美、文化内涵深刻、休闲度假设施丰富齐伞的国内外旅游度假胜地,使该地区形成集进香朝观、休闲度假、民俗风情、水上运动于一体的旅游度假新格局。     

城镇搬迁地土壤厚度划分与案例研究

为确定城镇搬迁地绿化有效土壤厚度,本研究通过对比城镇搬迁地原地土壤和传统农业土壤的差异,基于土壤、杂填土、建筑垃圾和土体等基本概念,对城镇搬迁地土壤厚度进行了定义；基于建筑垃圾层位置和园林绿化种植土相关标准定义了城镇搬迁地绿化有效土厚土壤厚度的内涵；并以上海市世博文化园和三林楔形绿地建成前城镇搬迁地为例对进行了土壤厚度划分方法的应用。结果表明：城镇搬迁地土壤厚度是城镇搬迁地内土壤剖面所有的土壤物质层厚度之和；城镇搬迁地绿化有效厚度为在城镇搬迁地中位于地下水之上,自身理化性质符合或者经过改良后符合地方规定的园林绿化种植土标准的土壤物质层厚度。上海市世博文化园建成前城镇搬迁地土壤厚度为2.4~4.5m,但由于土壤理化性质不符合园林绿化用土标准,绿化有效土厚为零,绿化种植土均需采用客土。三林楔形绿地建成前城镇搬迁地土壤厚度大于1m,土壤经过改良均可作为园林绿化种植土。但由于地下水层的存在,城镇搬迁地绿化有效土厚为1m。 因此,城镇搬迁地绿化有效土壤厚度划分方法可为城镇搬迁地原地土壤和客土用量的快速估算提供科学依据。     

丝羽乌骨鸡SLC38A11基因分型及其与皮肤乌色度关联分析

为进一步验证SLC38A11在丝羽乌骨鸡黑色素沉积中的作用,本研究采用基于飞行时间质谱分析技术对SLC38A11基因SNPs位点进行基因分型,对所有SNP位点利用Hapoview4.1进行连锁不平衡分析,并检测SNP位点是否处于H-W平衡状态,分析基因型与皮肤亮度L*值关联性,筛选对皮肤乌色度显著相关的SNP标记。结果表明：1）SLC38A11基因4个多态性位点质谱检出率为100%,每个位点都有3种基因型。SLC38A11基因SNP1位点为错义突变,SNP2、SNP3和 SNP4 3个SNPs位点均为同义突变。2）卡方检验表明,SNP1位点偏离H-W平衡（P<0.05）,其他3个SNPs位点均处于H-W平衡状态（P>0.05）。SNP1位点遗传多样性较低,其他3个SNPs位点为中度多态。3）单标记关联分析表明,SNP1位点TC基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于CC和TT基因型（P<0.05）;SNP2位点AA基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于GG与GA基因型（P<0.05）;SNP3位点TT基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于CC与CT基因型（P<0.05）。4）SNP2、SNP3和SNP4之间的强连锁产生了3种单倍型,H3H3单倍型（AATTAA基因型）胸部皮肤亮度L*值显著低于单倍型H2H3（GACTAG）和H2H1（GGCCAA）。SNP1～SNP4 4个位点基因型合并后,TCAATTAA胸部皮肤亮度L*值显著低于CCGGCCAA、TTGACTAG和CCGACTAG。综上,SLC38A11基因与丝羽乌骨鸡胸部皮肤乌色度密切相关,TCAATTAA基因型可作为研究丝羽乌骨鸡胸部皮肤乌色度的候选分子标记,为下一步利用分子标记辅助育种加快培育乌色度高的丝羽乌骨鸡新品种提供参考。