Unanticipated departures from breeding designs can be detected using microsatellite DNA parentage analyses

Using microsatellite analysis, a partial pedigree was constructed from an experiment designed to evaluate differences between hatchery Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) and their wild donor stocks. First generation (F₁) progeny were created by crossing both hatchery and wild females with hatchery and wild males to create hybrid and control lines. The pedigree analysis revealed an accidental switch of a half-sib control and hybrid F₁ family, which most likely occurred during incubation and led to the misclassification of individuals in those families. The experimental error propagated into the F₂ lines. The pedigree also revealed a number of unintended full-sib matings in the F₂ crosses. This resulted from the small numbers (5 females, 14 males) of wild fish available for the experiment and differential family survival of the F₁ fish. Because researchers used group-specific physical marks to track typed crosses and not family groups, and because physical marks cannot detect inadvertent movement of fish until they are large enough to mark, experimental error occurred that would have influenced the results had a DNA-based analysis not been employed to verify the integrity of the experiment.     

opaque 2基因微卫星标记与玉米籽粒赖氨酸含量的关系

利用opaque2（o2）基因序列内的微卫星标记phi057、phi112和umc1066检测优质蛋白和普通玉米自交系CA335及黄早四,发现phi057是共显性标记,且具有明显的多态性。利用标记phi057对BC1F1回交群体[(CA335×黄早四)×CA335]的224个单株进行检测,两种基因型o2o2和o2O2的分离比为1︰1.24,符合孟德尔遗传分离比例。进一步将群体内     

牛微卫星DNA的特性研究及其在遗传育种中的应用

本文在对微卫星ＤＮＡ的遗传结构与特性概述的基础上,与目前主要几种遗传标记的特性进行比较,并对微卫星ＤＮＡ多态性分析技术在牛遗传育种中的研究与应用进行了探讨。     

大豆基因组中的微卫星标记

微卫星ＤＮＡ是一种简单重复序列,其核心心单位由２０－５相核苷酸组成,两侧一般 序列。由于它具有共显性,多态性高,可进行ＰＣＲ扩增分析,既简单又经济,因此是一种很有价值的分子标记。实验证明大豆的微卫星ＤＮＡ随机分布于基因组中,其核心单位主要是（ＡＴ）ｎ,（ＡＴＴ）ｎ。在人类基因组很大比例铁（ＣＡ）ｎ则很少在大豆中出现。平均每一个微卫星座位有７－１０个等位基因,最高可达２６个。大豆的微卫星标记可扩充现     

小麦种质N9134抗白粉病基因的SSR标记和染色体初步定位

普通小麦种质N9134含有野生二粒小麦AS846的抗白粉病基因,该种质对陕西省关中地区白粉病流行小种关中四号表现高抗。用高感小麦白粉病的普通小麦品种陕160和陕优225与N9134杂交,F1代对白粉病表现高抗,F2代抗病和感病植株的比例符合3∶1, 表明N9134苗期白粉病抗性由1对完全显性基因控制,暂定名为PmAS846。采用66个小麦SSR     

Q型烟粉虱种群微卫星位点BEM06的变异检测

烟粉虱B型和Q型是两种入侵性较强的生物型,在山东省农区混合分布。B型与Q型入侵种群的快速鉴别对于进一步解析烟粉虱群体遗传结构及其防控有重要意义。在前期研究的基础上,使用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术检测了国内外27个Q型种群和1个B型种群微卫星BEM06位点。结果表明：微卫星BEM06位点不能有效鉴别山东省B型与Q型烟粉虱。山东省的Q型烟粉虱入侵来源与西班牙有密切关系。     

利用微卫星标记分析北京油鸡的遗传多样性

[目的]探讨北京油鸡的遗传多样性。[方法]采用29对微卫星标记对北京油鸡保种群的192个个体进行遗传多样性检测,并通过计算等位基因数、等位基因频率、期望杂合度（He）和多态信息含量（PIC）分析群体内的遗传变异情况。[结果]在29个微卫星标记中共检测到171个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数在2～14个,平均等位基因数为5．90个;多态信息含量和期望杂合度的平均值分别为0．53和0．59,均大于0．5,表现为高度多态性;除5个位．羔（MCW0069、ADI_0112、MCW0183、LE10234和MCW0016）外,其余24个微卫星位点都处于基因平衡状态。[结论]北京油鸡保种群具有丰富的遗传多样性。北京油鸡在北京市农林科学院榆垡种鸡场得到了较为妥善的保存。     

利用18个微卫星座位对剑尾鱼RR-B系遗传质量的分析

[目的]为进一步了解剑尾鱼RR-B系的遗传质量,探讨微卫星标记技术在水生实验动物遗传监测中应用的可行性。[方法]选择18个在野生剑尾鱼群体中有多态性的微卫星座位,通过PCR扩增对剑尾鱼RR-B系（红眼红体）遗传质量进行分析。[结果]18个座位在RR-B系30尾个体中均为单态,且都是纯合子,基因纯合率达100％。[结论]18个微卫星座位可作为剑尾鱼RR-B系遗传监测的分子标记;剑尾鱼RR-B系经20多代的近交培育已具有很高的遗传均一性。该研究为水生实验动物分子监测标准的制定提供了基础数据。     

凡纳滨对虾三个亲本及其子代群体的SSR分析

利用微卫星标记技术,采用8对微卫星引物对凡纳滨对虾3个亲本群体（OIQ、SISQ、Kona Bay Q）及其子一代（OIZ、SISZ、Kona Bay Z）共计120个个体进行遗传分析。结果表明,8对微卫星引物在6个群体中共检测到28个等位基因,每个位点的等位基因数为2～6个,平均等位基因数为3.5;各位点的期望杂合度均比观测杂合度高;多态信息含量（PIC）值为0.4794～0.7699,说明这8个位点在凡纳滨对虾中具有较高的信息含量。在亲本和子代群体遗传结构分析中,子代的有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等指标均略低于亲本群体,但子代的遗传多样性并未受到太大影响,仍保持较好的遗传力。     

中国大、中型驴种遗传多样性的微卫星分析

[目的]为分析我国大、中型驴品种遗传多样性。[方法]利用24个微卫星标记,对我国8个大、中型驴品种遗传多样性进行了检测。[结果]24个微卫星位点在8个驴品种中的多态信息含量除NVHEQ18为中度多态外,其余23个微卫星均为高度多态,8个驴种的平均PIC（0.6940）、H（0.7119）和E（3.94）,表明基因多态性和遗传多样性相对较高。[结论]这24个微卫星可作为有效的遗传标记用于各驴品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。我国大、中型驴品种的分子系统发生关系与其育成史和地理分布基本一致。