微卫星标记OarFCB128在5个绵羊品种中的遗传多样性研究

[目的]研究微卫星标记OarFCB128在5个绵羊品种中的遗传多样性。[方法]利用微卫星标记OarFCB128对5个绵羊品种（藏羊、兰州大尾羊、蒙古羊、小尾寒羊、无角道赛特）的基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度进行分析。[结果]微卫星标记OarFCB128在藏羊、兰州大尾羊、蒙古羊、小尾寒羊、无角道赛特中的多态信息含量、有效等位基因数及群体杂合度分别是0.8404、0.8922、0.9075、0.9094、0.7728,7.2414、11.5140、12.6820、12.8750、5.2674,0.8619、0.9131、0.9211、0.9223、0.8102。[结论]微卫星标记OarFCB128在绵羊品种中的多态性丰富,可用于绵羊遗传多样性评估。     

不同肉牛品种间杂种优势预测

[目的]预测西门塔尔杂交牛（西杂牛）与不同品种牛之间的杂种优势。[方法]以西杂牛为母本,利木赞牛、红安格斯牛、夏洛莱牛、德国黄牛为父本,利用微卫星标记对不同牛种间的遗传距离进行分析,并预测杂种优势。[结果]西杂牛与德国黄牛的遗传距离最大,为1.2598,其次是利木赞牛（1.0546）、红安格斯牛（0.8867）和夏洛莱牛（0.5997）。[结论]西杂牛与其他品种牛之间的杂种优势依次为德国黄牛〉利木赞牛〉红安格斯牛〉夏洛莱牛。     

人参遗传多样性的SSR分析

[目的]分析吉林省5个人参产区人参（Panax ginseng C.A.Mey）种质资源存在的差异性,为参农异地引种提供理论依据。[方法]利用SSR技术对吉林省5个人参产区9个人参类型的DNA进行检测,并利用DPS9.50专业版软件进行相异系数计算,用Nei-Li公式和UPGMA法构建聚类树状图。[结果]从25对引物中筛选出16对多态性引物用于扩增,共扩增出181条条带,其中,多态性条带117条,多态性64.7%。[结论]人参种质资源在分子水平上存在较大差异;人参不同类型间的差异主要由其遗传因素决定,但也与环境因素有关。     

四川三个藏猪群体的微卫星遗传多样性分析

本研究利用已开发的18对微卫星引物,分析了四川境内阿坝、稻城和德格三个藏猪群体共143个个体18条常染色体上的微卫星遗传多样性。结果表明:阿坝藏猪群体多态信息含量和观测杂合度比其他两群低,群体遗传变异较小;三个群体Nei氏标准遗传距离均在0.6以上,平均基因流值大于1,表明三个群体各有特点,群内基因交流频繁。     

中国5个地区家养双峰驼的遗传多样性研究

为了科学评价、保护和利用骆驼遗传资源,采用10个微卫星位点对40峰阿拉善骆驼、40峰河西骆驼、60峰北疆骆驼、60峰东疆骆驼和60峰南疆骆驼共260个个体进行群体间、群体内遗传水平变化研究,并对群体结构进行遗传多样性分析。检测得到129个等位基因。5个群体的多态信息含量(PIC)为0.578~0.665,观察杂合度(Ho)的范围为0.187~0.261,期望杂合度的变化范围为0.612~0.699。依据Da遗传距离构建的UPGMA系统发生树表明,5个地区家养双峰驼可以分为两个分支,阿拉善骆驼、河西骆驼、东疆骆驼聚为一支;北疆骆驼和南疆骆驼聚为一支。结果表明,河西骆驼和阿拉善骆驼显示了最密切的关系,而阿拉善骆驼和南疆骆驼之间有最远的遗传距离。     

微卫星标记技术及其在蚕学研究中的应用前景

微卫星标记 ,又称SSR(simplesequencerepeat)标记 ,是目前运用最广的遗传标记之一。介绍了SSR标记的特征 ,产生多态性的基本原理 ,获得SSR标记的途径以及多态性数据的统计分析方法。解释了SSR标记使用过程中遇到的所谓“影子带”现象。展望了SSR标记技术在家蚕基因组研究中的应用前景。     

凡纳滨对虾全基因组SSR标记开发及不同养殖群体的遗传多样性

为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响,为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记,基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星,约占基因组序列总长度的18.56%,其中,二碱基微卫星最丰富,占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体[桂海1号(CG)、海兴农2号(CH)和山东养殖群体(CT)],及3个国外群体[厄瓜多尔1号(FO)、厄瓜多尔2号(FT)和墨西哥群体(FM)]的遗传特征。结果显示,14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异,等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量的范围分别为6～25、0.112～0.994、0.234～0.925和0.226～0.918;遗传多样性丰富程度为CH>FO>FM>CT>FT>...     

利用微卫星标记对级进杂交绵羊群体遗传特性的鉴定(英文)

[Objective] The aim of the research was to identify and assess the genetic characteristics of grading breeding sheep populations in Ba Yan Nur City. [Method] Genetic polymorphism and aggregation of seven sheep populations, including three breeding sheep populations (breeding F1, F2 and Bamei mutton sheep), three introduced mutton sheep breeds (Texel, Dorset and German Merino sheep) and one local female parent population (Mongolia sheep), were assessed using 10 microsatellite markers. [Result] By cluster analysis, the seven sheep populations can be divided into two groups. The F1 and German Merino sheep were closely related, which were clustered with F2, Bamei mutton sheep and Mongolia sheep to form one group while Texel and Dorset to form another group. The genetic aggregation of the seven breeds was assessed by Bayesian discrimination. And the results show that the genetic aggregation of F1 and F2 were lower while that of Bamei mutton sheep, Texel, Dorset and German Merino sheep were higher. [Conclusion] Better genetic stability has been formed in Bamei mutton sheep.     

Microsatellite genetic variation between and within farmed and wild Atlantic salmon (Salmo salar) populations

Genetic diversity between three farmed and four wild populations of Atlantic salmon from Ireland and Norway were analysed using 15 microsatellite markers. High levels of polymorphism were observed over all populations with the average number of alleles and average heterozygosity at 17.8 and 0.70, respectively. Farmed salmon showed less genetic variability than wild salmon in terms of allelic diversity but not necessarily in terms of overall heterozygosity. Between farmed populations significant differences were observed in expected heterozygosity suggesting that more intensive breeding practices may have resulted in a further erosion of genetic variability. Phylogenetic analysis using either populations or individuals as nodes show a clustering of populations into two groups, farmed and wild. This suggests that founder effects and subsequent selection have had more effect on the genetic differentiation between these strains than geographical separation. This technology has great potential for use in aquaculture situation where levels of genetic variation could be monitored and inbreeding controlled in a commercial breeding progra.     

日本对虾养殖群体两个世代遗传结构的微卫星分析

利用8对微卫星引物对日本对虾养殖群体两个世代的遗传结构进行了分析,共检测到108个等位基因,等位基因长度为196-528 bp,各位点等位基因数为6-23个。亲本和子代群体每个位点平均等位基因数目分别为8.5个和11.5个,平均观测杂合度分别为0.721和0.632,平均期望杂合度分别为0.775和0.764,平均多态信息含量分别为0.732和0.729。根据标记信息,利用最大似然法对两个世代的个体分别进行系谱结构推断,亲本群体划分为6个群体,群体间遗传距离为0.277-2.356,均值为1.510;子代群体划分为17个群体,群体间遗传距离为0-2.593,均值为1.113。亲本和子代分群体间的遗传距离变化范围为0-3.089,均值为1.238。根据各分群体间的Nei's遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)构建了日本对虾两个世代的遗传进化树。其中18个分群体(4个亲本群体和14个子群体)经过聚类后形成3个分支,其余5个分群体(两个亲本群体和3个子群体)明显偏离于主支。研究发现,子代的观测杂合度明显低于亲本,说明子代在继承亲本遗传信息的过程中已经丢失了一定的杂合性。