白斑综合征病毒(WSSV)提取物中43 kDa蛋白来源的MALDI-TOF分析

将纯化的WSSV粒子蛋白经SDS-PAGE分离后,对图谱中出现的43kDa蛋白进行质谱分析,发现该蛋白不是WSSV基因组编码,是来自其宿主的蛋白成分,与肌动蛋白有很高的同源性。提示该蛋白的有无及含量多少与纯化病毒粒子的状态有很大关系,可以作为纯化WSSV完整性的参考指标。     

Identification and Expression of a β-actin Gene from Liposcelis bostrychophila Badonnel （Psocoptera： Liposcelididae）

A β-actin gene, Libβ-actinl, from the psocid, Liposcelis bostrychophila, was isolated, sequenced, and expressed in Escherichia coli. The cDNA sequence was 1 281 bp in length and contained an open reading frame of 1 131 bp encoding 376 amino acids with a predicted molecular weight of 41.82 kDa. According to a BlastN search, the coding region shared the highest identity (97%) with Pediculus humanus actin 5C, while the deduced amino acid sequence was completely identical to a mutant of Drosophila melanogaster actin 5C. Comparison of the nucleotide and deduced amino acid sequences confirmed the high similarity between Libβ-actinl and homologs in other insect species. The 3′ untranslated region (3′ UTR) of the Libβ-actinl mRNA had a high A+U content (approximately 75%) and contained three repeats of the AUUUUUA and AUUUA motifs, which may play a role in regulating mRNA decay. The expression of Libβ-actinl was further analyzed in insecticide induced and control psocids. The results indicated that there was no significant difference in expression of Libβ-actinl between the induced and control groups, suggesting that Libβ-actinl may be an appropriate internal control for the gene expression profiling in this insect. Furthermore, Libβ-actinl was also heterologously expressed in Escherichia coli, which provided a basis to investigate the physiological functions of actin genes in the psocid.     

荔波连蕊茶肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及其表达分析

根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,以山茶属植物荔波连蕊茶幼嫩茎段为材料,提取总RNA,进行RT-PCR。采用RACE技术扩增获得1 631 bp的Actin基因全长cDNA序列,命名为ClActin1(GenBank登录号KF366912)。序列分析表明,ClActin1开放阅读框(ORF)为1 134 bp,编码377个氨基酸,5’非编码区90 bp,3’非编码区407 bp。预测的ClActin1蛋白分子量为41.69 kD,理论等电点为5.31,具有Actin超基因家族的保守结构域和肌动蛋白家族特有的特征信号序列。ClActin1与GenBank中收录的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在82%以上,氨基酸序列的相似性在97%以上。与其它植物肌动蛋白比较并构建系统进化树,结果显示山茶肌动蛋白与茶树和杨树的肌动蛋白的亲缘关系最为密切。实时荧光定量PCR结果显示,该基因在荔波边蕊茶不同组织器官及不同发育时期的表达量稳定,表明ClActin1基因可作为内参基因。     

小麦中一个ADF基因克隆与表达分析

肌动蛋白在植物防御真菌侵染过程有重要作用,有众多基因调节肌动蛋白表达变化,肌动蛋白解聚因子(Actin-depolymerizing factor,ADF)是其中一个重要调节因子.利用同源序列设计引物进行PCR扩增后,通过电子克隆技术得到一个新的TaA DFc DNA全长,在小麦望水白和Alondra两个品种中分别得到...     

利用荧光定量PCR检测禾谷丝核菌的相对生物量

小麦纹枯病是以禾谷丝核菌(Rhizoctonia cerealis)侵染为主的小麦土传病害。为建立检测禾谷丝核菌在寄主小麦(Triticum aestivum)中的相对生物量的可靠方法,促进小麦抗纹枯病机制的研究,本研究克隆了禾谷丝核菌肌动蛋白基因RcActin的部分(3′端)cDNA,并设计了RcActin的特异引物。该引物不仅能区分禾谷丝核菌与寄主小麦,还能区分全蚀病菌(Gaeumannomyces graminis)、根腐病菌(Bipolaris sorokiniana)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)等常见小麦土传病害的病原菌,表明该引物能用于小麦纹枯病的分子检测,也能用于相对表达量的测定。利用相对定量法,以RcActin相对于寄主管家基因的相对表达量作为禾谷丝核菌相对生物量的指标,结果表明,此方法能准确反映禾谷丝核菌在寄主中的相对生物量和对小麦纹枯病抗性程度进行快速鉴定。     

松江鲈β-肌动蛋白基因全长cDNA的克隆和序列分析

[目的]获得松江鲈β-肌动蛋白基因cDNA全长序列,并检测松江鲈β-肌动蛋白在组织中的表达。[方法]以松江鲈肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR、5′-RACE和3′-RACE的方法扩增β-肌动蛋白基因cDNA片段,用RT-PCR方法检测组织表达。[结果]获得了松江鲈β-肌动蛋白基因cDNA的3个片段,测序后拼接得到1905bp全长cDNA序列,其包含了1128个核苷酸的开放性阅读框,翻译编码375个氨基酸。核苷酸和氨基酸同源性分析发现,松江鲈β-肌动蛋白基因序列与点带石斑鱼、军曹鱼、红鲷鱼等同源性相对较高,与哺乳动物和鸟类同源性相对较低;系统发育分析表明,松江鲈β-肌动蛋白与点带石斑鱼关系最近。RT-PCR分析表明,该基因在检测的肌肉、肝脏、肠和脑4种组织均有表达。[结论]首次得到了β-肌动蛋白基因cDNA全长序列,并证明了松江鲈的β-肌动蛋白基因非常保守。     

紫花苜蓿肌动蛋白基因的提取

选取紫花苜蓿叶片为材料,提取总RNA,利用蒺藜状苜蓿的肌动蛋白基因设计特异性引物,扩增出目的基因的cDNA进行测序,测序结果在NCBI基因库中利用Blast与其他高等植物肌动蛋白基因序列进行了比对、分析,结果证明所提取的基因为紫花苜蓿肌动蛋白基因的片段。     

西方蜜蜂肌动蛋白基因启动子的克隆与序列分析

为研究适合蜜蜂转基因需要的启动子,利用生物信息学知识和现有的生物信息资源,在NCBI数据库查询了西方蜜蜂肌动蛋白基因的编码序列,与西方蜜蜂基因组对比后,克隆、分析了西方蜜蜂肌动蛋白基因序列,该肌动蛋白基因有起始密码子(strart codon)ATG、开放阅读框(ORF)、终止密码子(stop codon)TAA、TATA框(-32bp)、CAAT框(-69 bp)和ployA( 1396 bp),这些都符合真核生物基因的一般特点,是一个较完整的基因.成功克隆了该启动子.     

黄垂网不同发育时期肌动蛋白基因的序列分析

[目的]对黄垂网不同发育时期（幼孢囊和成熟孢囊时期）的肌动蛋白基因的序列进行测定、比对。[方法]基于肌动蛋白基因,利用分子生物学方法对黄垂网不同发育时期的DNA进行提取、测序。[结果]不同发育时期的序列同源性在99%以上,具有的氨基酸数量相同,都为19种,没有色氨酸。丝氨酸含量最高,组氨酸含量最低。[结论]除丙氨酸、苯丙氨酸、异亮氨酸和脯氨酸外,黄垂网在不同发育时期的氨基酸含量均相同。