生菜低温胁迫转录因子LsICE1的克隆、特征分析及其转化水稻

 【目的】克隆生菜（Lactuca sativa L.）低温胁迫转录因子LsICE1,对其进行序列分析和水稻遗传转化,研究超表达LsICE1基因对水稻耐低温能力的影响。【方法】设计简并引物,利用RT-PCR技术获得生菜LsICE1基因保守区域,再通过SON-PCR技术获得LsICE1基因的5′端和3′端,拼接得到全长的cDNA。对该序列进行生物信息学分析,采用半定量RT-PCR研究LsICE1的低温表达模式。最后构建植物表达载体,利用农杆菌介导法对水稻进行遗传转化。通过比较低温处理后对照和转基因株系的存活率和生理指标,鉴定超表达LsICE1基因对水稻耐低温能力的调控作用。【结果】测序结果显示,拼接后的cDNA片段长1 622 bp,包含一个1 497 bp完整的开放阅读框,编码498个氨基酸残基,命名为LsICE1,GenBank登录号为HQ848932。半定量RT-PCR研究表明,LsICE1基因是冷诱导条件下差异表达的基因。进化树分析表明,LsICE1蛋白与葡萄的ICE1蛋白亲缘关系最近,处于同一进化分枝。PCR和RT-PCR分子检测证明,LsICE1基因已经整合到水稻基因组中。与对照相比,低温处理后超表达LsICE1基因的转基因株系存活率和脯氨酸含量明显增加,相对电导率和丙二醛含量积累速率明显下降。【结论】首次从生菜中克隆了低温胁迫转录因子LsICE1,超表达LsICE1基因水稻株系提高了抗低温胁迫能力。     

0.05％核苷酸对芝麻的增产效果研究

2010年在河南省项城市进行随机区组试验,研究叶面喷施0.05％核苷酸(桑兰990A)对芝麻的增产效果.结果表明:与喷清水相比,喷施0.05％核苷酸(2mL/L)、0.05％核苷酸(2mL/L)+红A硼(2g/L)处理的芝麻株高分别增加5.40 cm、12.80 cm,蒴果数增加5.96个、14.94个,株粒数增加46...     

Comparsion of the Effects of Succinate and NADH on Postmortem Metmyoglobin Redcutase Activity and Beef Colour Stability

In two experiments, the effects of succinate and NADH（reduced nicotinamide adenine dinucleotide） on metmyoglobin reductase activity and electron transport chain-linked metmyoglobin reduction were investigated and compared. In experiment 1, metmyoglobin（MetMb）, substrate and inhibitors were incubated with mitochondria. Comparsion of the effects of succinate and NADH on MetMb reduction was investigated. The MetMb percentage in sample treated with 8 mol L-1 succinate decreased by about 69% after 3 h incubation, and the effect was inhibited by the addition of 10 mol L-1 electron transfer chain complex II inhibitor malonic acid; the MetMb percentage in samples treated with 2 mol L-1 NADH decreased by 56% and the effect was inhibited by the addition of 0.02 mol L-1 electron transport chain complex I inhibitor rotenone. These results indicated that electron transport chain played an important role in MetMb reduction. Both complex II and complex I take part in the MetMb reduction in mitochondria through different pathways. NADH-MetMb reduction system was less stable than succinateMetMb system. In experiment 2, the beef longissimus dorsi muscle was blended with different concentrations of succinate or NADH. Enhancing patties with higher concentration of succinate or NADH improved colour stability in vacuum packaged samples（P〈0.05）. These results verified that mitochondria electron transport chain is related to the MetMb reduction in meat system.     

球孢白僵菌基因组密码子使用模式及其影响因素分析

球孢白僵菌Beauveria bassiana是一类成功用于全球生物防治的重要病原真菌,这是由于其宿主范围广及毒力多样化特性决定的.利用球孢白僵菌已公布全基因组数据,开展密码子使用偏好分析,以理解其基因组特征和宿主适应性.尽管通过密码子指数CAI,CBI,ENc的计算,认为球孢白僵菌密码子使用偏性较弱.但根据RSCU值鉴定最优密码子,发现球孢白僵菌基因组强烈偏好使用第三位碱基G/C的密码子,尤其是C结尾的密码子.对密码子第三位碱基进行PR2分析,发现球孢白僵菌密码子偏好性还表现在倾向于使用嘧啶结尾密码子,即U使用频率高于A,C使用频率高于G.该偏好模式通过相关性分析,认为核苷酸组成是影响球孢白僵菌密码子偏好性的一个重要因素.而ENc图和对应分析则表明除核苷酸组成外,球孢白僵菌密码子使用偏好还受到基因功能及其他多种因素的影响.中性绘图分析认为,球孢白僵菌密码子使用偏好受到外界选择下的定向突变压力作用,并推测该选择来自于其宿主.而该定向突变压力也是加快球孢白僵菌自身基因组进化和毒力多样化的一种动力,使其能适应在700多种昆虫宿主中寄生.     

高粱·玉米核及细胞器基因核苷酸替代率与选择压力关系分析（摘要）

[目的]探讨选择压力与核苷酸替代率的关系。[方法]采用统计学方法分析高粱、玉米中部分核基因、细胞器基因的同义替代率、非同义替代率以及2者之间的比值,并对一些相关功能基因进行对比分析。[结果]相关功能基因在核与叶绿体中所受的纯化选择压力相近,在线粒体中则较低。高粱、玉米核同源基因间及核中不同功能基因间核苷酸替代的差异主要由非同义替代的差异造成。[结论]选择压力影响不同功能基因、不同物种的分子进化速率,而核与细胞器基因间进化速率的差异与选择压力间并无直接联系。     

复合酵母在三黄鸡上的应用研究

最近国内外众多研究证实:在动物上应用核酸具有免疫增强、促进畜禽肠道发育、抗氧化、微生态调节、组织修复等诸多功效,并提出核苷酸发挥作用的最佳时期是动物生长期、应激阶段等高核酸需要时期。一般原料中,鱼类、洋葱、     

东北三省部分地区猪附红细胞体16S rRNA核苷酸序列比较分析

为了解东北三省猪附红细胞体基因的流行变异情况,本试验选取相对保守的16S rRNA核苷酸序列作为分析对象,采用酚仿抽提法提取吉林株、辽宁株和黑龙江株猪附红细胞体基因组DNA,用一对特异性引物扩增目的DNA,然后分别与pMD-18T载体连接并转化BL-21菌株,经重组质粒PCR鉴定后并测序,比较其核苷酸序列。从同源性分析结果可以看出,黑龙江株、辽宁株与广东株猪附红细胞体核苷酸同源性最高,均达到100%;吉林株与美国株猪附红细胞体的核苷酸同源性最高,为97%。系统进化分析结果显示,黑龙江株与辽宁株猪附红细胞体亲缘关系最近,而与吉林株猪附红细胞体较远。结果表明,吉林株、辽宁株和黑龙江株猪附红细胞体16S rRNA基因序列存在差异。     

基于全基因组的芽孢杆菌平均核苷酸同源性(ANI)分析

采用Jspecies软件分析芽孢杆菌全基因组之间平均核苷酸同源性(ANI)的特征性。结果表明,芽孢杆菌属间、种间及亚种间两两菌株间ANI与其分类地位相关,具有明显属种特异性,其中芽孢杆菌科不同属之间的ANI值分布于50%～65%;芽孢杆菌种间ANI值均低于95%,分布范围为65%～90%,加权平均数为70.12%,其中90%的ANI值低于70%;芽孢杆菌亚种间ANI值分布主要范围为90%～96%,占90%。因此,芽胞杆菌属间的ANI鉴定标准建议定为50%～65%,芽胞杆菌种间的ANI鉴定标准建议定为65%～90%,芽胞杆菌亚种间的ANI鉴定标准建议定为90%～96%。同时,基因组中的四核苷酸(Tetra)回归系数与ANI值具有相关性,表现明显属种特征性,回归拟合显示两者呈现一元二次方程关系,y=271-573.58x+399.65x2(R2=0.981 2),同时高于70%的ANI值与相应的Tetra回归系数呈线性正相关,方程式为y=178.58x-81.521(R2=0.876 7)。     

德国牧羊犬复孔绦虫种类鉴定和遗传进化分析

为了对采集自3只德国牧羊犬小肠内的复孔绦虫进行种类鉴定和遗传进化分析,通过形态学方法对分离到的虫体进行孔雀绿染色后显微镜观察,并进一步基于线粒体部分基因(pcox1和pnad1)进行PCR扩增和序列分析.显微镜观察结果表明,分离到的虫体形态和内部结构符合犬复孔绦虫的特征.通过对扩增的靶基因序列及其遗传进化分析发现,3个...